RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 ACOT7O00154 380 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 KLK8O60259 260 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 ATP6AP2O75787 350 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 LRATO95237 230 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 NADKO95544 446 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 TAC1P20366 129 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 CHRNB4P30926 498 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
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PRAME-212ENST00000485532 OR4C11Q6IEV9 310 aa11.66□□□□□ -0.54
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PRAME-212ENST00000485532 SLC22A16Q86VW1 577 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 C10orf107Q8IVU9 208 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 C9orf40Q8IXQ3 194 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 LAS2Q8IYD9 372 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 TEX9Q8N6V9 391 aa11.66□□□□□ -0.54
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PRAME-212ENST00000485532 ASB5Q8WWX0 329 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 UCN3Q969E3 161 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 FAM173AQ9BQD7 235 aa11.66□□□□□ -0.54
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PRAME-212ENST00000485532 NUDT4Q9NZJ9 180 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 OPTCQ9UBM4 332 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 ATG4BQ9Y4P1 393 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 FAM215AQ9Y5M1 114 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 FREM3P0C091 2139 aa11.66□□□□□ -0.54
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PRAME-212ENST00000485532 SYCE1LA8MT33 242 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 PLPP1O14494 284 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 BIRC5O15392 142 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 SMIM24O75264 130 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 SCELO95171 688 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 IGHG3P01860 377 aa11.65□□□□□ -0.54
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PRAME-212ENST00000485532 RFPL3SP0C7P2 107 aa11.65□□□□□ -0.54
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PRAME-212ENST00000485532 MSX1P28360 303 aa11.65□□□□□ -0.54
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PRAME-212ENST00000485532 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
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PRAME-212ENST00000485532 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 TMEM35AQ53FP2 167 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 DEPDC1Q5TB30 811 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 PRAMEF20Q5VT98 475 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 CES4AQ5XG92 561 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 PAOXQ6QHF9 649 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 OPN5Q6U736 354 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 LYPD8Q6UX82 237 aa11.65□□□□□ -0.54
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PRAME-212ENST00000485532 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
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PRAME-212ENST00000485532 NUDCD3Q8IVD9 361 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 FAM109AQ8N4B1 249 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
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PRAME-212ENST00000485532 UBTD2Q8WUN7 234 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 NRGNQ92686 78 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 CMTM7Q96FZ5 175 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 DGAT2Q96PD7 388 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 ROGDIQ9GZN7 287 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 IL1RL2Q9HB29 575 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 KCNJ16Q9NPI9 418 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 SACM1LQ9NTJ5 587 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 OXSMQ9NWU1 459 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 COPS7AQ9UBW8 275 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-212ENST00000485532 A0A1W2PS29 197 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 GLOD5A6NK44 160 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 EEDO75530 441 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 P04436 131 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 GLI4P10075 376 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 GFAPP14136 432 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 CAPN3P20807 821 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 BGNP21810 368 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 ADH7P40394 386 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 RAP1GDS1P52306 607 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 PRKAA2P54646 552 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 DNAJB13P59910 316 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 RPS13P62277 151 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 HERVK_113P63132 956 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 ERVK-8P63133 956 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 TNFRSF17Q02223 184 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 PFKFB4Q16877 469 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa11.64□□□□□ -0.55
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