RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484046.1

TM4SF1-AS1-201, TM4SF1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TM4SF1-AS1, Length 488 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SPEF1Q9Y4P9 236 aa4.87□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 A0A1B0GVL5 298 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CCT8L1PA6NM43 557 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 A8MUA0 341 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 G3V4G9 280 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 KCNK1O00180 336 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 STX7O15400 261 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ULK1O75385 1050 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PRKD3O94806 890 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 MYO1DO94832 1006 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 GNA14O95837 355 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 C1QAP02745 245 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 FESP07332 822 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 NUDT17P0C025 328 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 RBP3P10745 1247 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ATP1A3P13637 1013 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PKMP14618 531 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PTNP21246 168 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 MAOAP21397 527 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PSMA2P25787 234 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CMPK1P30085 196 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 EFNA4P52798 201 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PNLIPRP1P54315 467 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 NAGLUP54802 743 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CDH15P55291 814 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 BTG2P78543 158 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ZNF844Q08AG5 666 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 BRD3Q15059 726 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ZSWIM7Q19AV6 140 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PRAMEF20Q5VT98 475 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 AGAP6Q5VW22 663 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SLC22A10Q63ZE4 541 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TMEM200BQ69YZ2 307 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 DCUN1D2Q6PH85 259 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 OPN5Q6U736 354 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SCIMPQ6UWF3 145 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 STAC2Q6ZMT1 411 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 VN1R4Q7Z5H5 301 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 KIAA1328Q86T90 577 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SLC22A15Q8IZD6 547 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SYT14Q8NB59 555 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SYT8Q8NBV8 401 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 OR5T3Q8NGG3 340 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SPATA22Q8NHS9 363 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CALML6Q8TD86 181 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ELMO1Q92556 727 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TBC1D20Q96BZ9 403 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CTHRC1Q96CG8 243 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 KCNC2Q96PR1 638 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PCDHB18PQ96TA0 734 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CCDC77Q9BR77 488 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SLC25A51Q9H1U9 297 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 MYO1AQ9UBC5 1043 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PCYOX1Q9UHG3 505 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 MCM8Q9UJA3 840 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SLC39A10Q9ULF5 831 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 IKBKGQ9Y6K9 419 aa4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP4.86□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 NCKAP5O14513 1909 aa4.85□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 FREM3P0C091 2139 aa4.85□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 DNAH1Q9P2D7 4330 aa4.85□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 COL7A1Q02388 2944 aa4.85□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa4.85□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 LCE6AA0A183 80 aa4.85□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 LRP5LA4QPB2 252 aa4.85□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ZNF860A6NHJ4 632 aa4.85□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 C9orf118A6NHY6 69 aa4.85□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 H0Y3Z8 333 aa4.85□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 GFYI3L273 518 aa4.85□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PSMA7O14818 248 aa4.85□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TIMM23O14925 209 aa4.85□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 HAT1O14929 419 aa4.85□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 EMC8O43402 210 aa4.85□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 HCRTR2O43614 444 aa4.85□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 GPC4O75487 556 aa4.85□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PDE5AO76074 875 aa4.85□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 LY6HO94772 140 aa4.85□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 AP2A2O94973 939 aa4.85□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ACSL3O95573 720 aa4.85□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TGM6O95932 706 aa4.85□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ACTL6AO96019 429 aa4.85□□□□□ -1.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 RPN2P04844 631 aa4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70 ms