RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476783.5

PTBP2-208, Transcript of polypyrimidine tract binding protein 2, human

TSL 1 (best)

Gene PTBP2, Length 779 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTBP2-208	ENST00000476783	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783		A0A1W2PPV9	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783		A8MUA0	341 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783		G3V3Y1	287 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783		H7C0S8	307 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	CCL22	O00626	93 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	P2RX6	O15547	441 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	GPC4	O75487	556 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	CCNDBP1	O95273	360 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	GAST	P01350	101 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	PRSS56	P0CW18	603 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	GYPE	P15421	78 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	SRD5A1	P18405	259 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	JAK1	P23458	1154 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	CCR7	P32248	378 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	LIMS1	P48059	325 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	PIK3CG	P48736	1102 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	DIO3	P55073	304 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	WNT3	P56703	355 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	KRT31	Q15323	416 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	TMED2	Q15363	201 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	ODF2	Q5BJF6	829 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	RANBP10	Q6VN20	620 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	PACS1	Q6VY07	963 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	ADCK2	Q7Z695	626 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	RFX6	Q8HWS3	928 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	VRK3	Q8IV63	474 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	SMPDL3A	Q92484	453 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	LRRC45	Q96CN5	670 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	OLFM3	Q96PB7	478 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	MED18	Q9BUE0	208 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	MYO6	Q9UM54	1294 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	MED12	Q93074	2177 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783		A0A0G2JMM0	328 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783		A0A1W2PPB8	328 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783		A0A1W2PRS3	328 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	ZNF487	B1APH4	448 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	HAT1	O14929	419 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	KIF5C	O60282	957 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	B4GALT2	O60909	372 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	RDH16	O75452	317 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	OR2J2	O76002	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	ZFAND5	O76080	213 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	OR6B1	O95007	311 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	C1orf105	O95561	183 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	FH	P07954	510 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	RAP2A	P10114	183 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	CRYGS	P22914	178 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	SOX3	P41225	446 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	NR2C2	P49116	596 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	DNASE1L1	P49184	302 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	ALDH9A1	P49189	494 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	MTTP	P55157	894 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	LINC00310	P59036	64 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	DYNLT1	P63172	113 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	SKP1	P63208	163 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	ABAT	P80404	500 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	DEFA6	Q01524	100 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	UBXN1	Q04323	297 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	WASHC5	Q12768	1159 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	SQLE	Q14534	574 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	PRPSAP1	Q14558	356 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	P3H1	Q32P28	736 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTBP2-208	ENST00000476783	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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