RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466901.5

COPS7B-218, Transcript of COP9 signalosome subunit 7B, humanhuman

TSL 3

Gene COPS7B, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7B-218ENST00000466901 GIMAP4Q9NUV9 329 aa7.26□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 HPF1Q9NWY4 346 aa7.26□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 C1orf109Q9NX04 203 aa7.26□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 HEY2Q9UBP5 337 aa7.26□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 UTS2RQ9UKP6 389 aa7.26□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa7.26□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 POLEQ07864 2286 aa7.26□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 LRRK2Q5S007 2527 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 A0A1W2PS29 197 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 OR6C76A6NM76 312 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 NME2P1O60361 137 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 OR6B1O95007 311 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 HSPA4LO95757 839 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 ATP1B1P05026 303 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 CT62P0C5K7 136 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 LINC00032P0C843 101 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 DDCP20711 480 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 NME2P22392 152 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 PRPH2P23942 346 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 SSTR4P31391 388 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 SOX3P41225 446 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 SLC37A1P57057 533 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 PMP22Q01453 160 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 FUT7Q11130 342 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 MAP4K2Q12851 820 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 CHI3L2Q15782 390 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 PIGGQ5H8A4 983 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 NOXRED1Q6NXP6 359 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 FAM180BQ6P0A1 224 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 OPN5Q6U736 354 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 RNF165Q6ZSG1 346 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 ZNF227Q86WZ6 799 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 CCDC116Q8IYX3 515 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 VWA5B2Q8N398 1253 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 SLC15A4Q8N697 577 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 OR7G1Q8NGA0 311 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 OR6Y1Q8NGX8 325 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 PRR7Q8TB68 274 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 SLC22A8Q8TCC7 542 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 AGR3Q8TD06 166 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 TWIST2Q8WVJ9 160 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 NR4A3Q92570 626 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 GAL3ST4Q96RP7 486 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 SLX1AQ9BQ83 275 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 BRINP2Q9C0B6 783 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 WWTR1Q9GZV5 400 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 OR10A5Q9H207 317 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 LRTM1Q9HBL6 345 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 EHD3Q9NZN3 535 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 ENTPD4Q9Y227 616 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 CCL27Q9Y4X3 112 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 EML6Q6ZMW3 1958 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa7.24□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 ASPDHA6ND91 283 aa7.24□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 TMEM114B3SHH9 223 aa7.24□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 TMEM233B4DJY2 109 aa7.24□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 NPIPB8E9PQR5 432 aa7.24□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 PIP5K1BO14986 540 aa7.24□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 LSM1O15116 133 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 PEX1O43933 1283 aa7.24□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 SERPINE1P05121 402 aa7.24□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 DHRS4L1P0CG22 281 aa7.24□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 GRK2P25098 689 aa7.24□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 ARRB2P32121 409 aa7.24□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 MPIP34949 423 aa7.24□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 MPP2Q14168 576 aa7.24□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 CASP8Q14790 479 aa7.24□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 KIAA0040Q15053 153 aa7.24□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 EBPQ15125 230 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa7.24□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 UGT3A2Q3SY77 523 aa7.24□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 GALNTL6Q49A17 601 aa7.24□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 FHL5Q5TD97 284 aa7.24□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 HHATQ5VTY9 493 aa7.24□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 FAM71E1Q6IPT2 247 aa7.24□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 RTL4Q6ZR62 310 aa7.24□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 Q6ZSR9 355 aa7.24□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 IKBIPQ70UQ0 350 aa7.24□□□□□ -1.25
COPS7B-218ENST00000466901 MDGA2Q7Z553 956 aa7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms