RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447402.7

SELENBP1-208, Transcript of selenium binding protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SELENBP1-208	ENST00000447402	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SELENBP1-208	ENST00000447402	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SELENBP1-208	ENST00000447402	MORN4	Q8NDC4	146 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SELENBP1-208	ENST00000447402	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SELENBP1-208	ENST00000447402	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SELENBP1-208	ENST00000447402	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SELENBP1-208	ENST00000447402	NCLN	Q969V3	563 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SELENBP1-208	ENST00000447402	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SELENBP1-208	ENST00000447402	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SELENBP1-208	ENST00000447402	MAGED4	Q96JG8	741 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SELENBP1-208	ENST00000447402	ART5	Q96L15	291 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SELENBP1-208	ENST00000447402	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SELENBP1-208	ENST00000447402	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SELENBP1-208	ENST00000447402	PCSK5	Q92824	1860 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402		A0A1W2PQ72	361 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402		A8MUI8	341 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	DNAJB5	O75953	348 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	IL6	P05231	212 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	GALNS	P34059	522 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	ATP4B	P51164	291 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402		Q0VFX4	171 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	TERF2	Q15554	542 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	CEBPE	Q15744	281 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	BORA	Q6PGQ7	559 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM107	Q6UX40	140 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	ANKRD46	Q86W74	232 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	NATD1	Q8N6N6	113 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	M1AP	Q8TC57	530 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR52E6	Q96RD3	313 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM234B	A2RU67	622 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	DDAH2	O95865	285 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	C6orf47	O95873	294 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM107A	O95990	144 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	PGR	P06401	933 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	ITGAM	P11215	1152 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	SSTR4	P31391	388 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	CLCN2	P51788	898 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	KCNK10	P57789	538 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	MAP4K2	Q12851	820 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	SZRD1	Q7Z422	152 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	GALNT16	Q8N428	558 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF721	Q8TF20	911 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	EXTL1	Q92935	676 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	VPS33A	Q96AX1	596 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	VMP1	Q96GC9	406 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	FBXL20	Q96IG2	436 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	NUDT9	Q9BW91	350 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCDC154	A6NI56	674 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	NR5A2	O00482	541 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCDC22	O60826	627 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	SERPINA7	P05543	415 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	MC3R	P41968	323 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRKAG1	P54619	331 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	AP2B1	P63010	937 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	PHC1	P78364	1004 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	TBR1	Q16650	682 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	HSDL2	Q6YN16	418 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		12.75	□□□□□ -0.37

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