RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	MPI	P34949	423 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	CYB561	P49447	251 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	HLCS	P50747	726 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	SLC37A1	P57057	533 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	ERVK-8	P63133	956 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	OCRL	Q01968	901 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	TUBA3C	Q13748	450 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	MDS2	Q8NDY4	140 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	UCN3	Q969E3	161 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	ZBTB9	Q96C00	473 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	EPN3	Q9H201	632 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.23
PTPA-222	ENST00000445241	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	PRAMEF2	O60811	474 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	ITGA10	O75578	1167 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	SASH3	O75995	380 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	BCKDHA	P12694	445 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	NT5E	P21589	574 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	NTS	P30990	170 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	CD96	P40200	585 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	SSR4	P51571	173 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	C21orf58	P58505	322 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	PPP2R2A	P63151	447 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	PSPH	P78330	225 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	EMX2	Q04743	252 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	PDE7A	Q13946	482 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	GALNTL6	Q49A17	601 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	MMP21	Q8N119	569 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	NATD1	Q8N6N6	113 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	TP53INP1	Q96A56	240 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	C3orf30	Q96M34	536 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	MFRP	Q9BY79	579 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	REEP4	Q9H6H4	257 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF639	Q9UID6	485 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	TTLL8	A6PVC2	850 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	HDAC3	O15379	428 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	ATP8B1	O43520	1251 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	PLOD3	O60568	738 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	PEX11A	O75192	247 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	CD46	P15529	392 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	S1PR1	P21453	382 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	TACR1	P25103	407 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	HPCAL1	P37235	193 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	TLE1	Q04724	770 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	MGAT2	Q10469	447 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	OR1C1	Q15619	314 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	OGFOD2	Q6N063	350 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	OPN5	Q6U736	354 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM156	Q8N614	296 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	SCMH1	Q96GD3	660 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	SGCZ	Q96LD1	299 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	C5orf34	Q96MH7	638 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	C7orf26	Q96N11	449 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	BBS4	Q96RK4	519 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	OR10A5	Q9H207	317 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	LRFN1	Q9P244	771 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	PRODH2	Q9UF12	536 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241		A0A087WV62	115 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		13.56	□□□□□ -0.24

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