RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 PCLAFQ15004 111 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 KRTCAP3Q53RY4 240 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 OPN5Q6U736 354 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 IL20RBQ6UXL0 311 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 RTL4Q6ZR62 310 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC29A4Q7RTT9 530 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 SIAH3Q8IW03 269 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 SULF2Q8IWU5 870 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 GALNT12Q8IXK2 581 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 MMP21Q8N119 569 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 PSD4Q8NDX1 1056 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 APIPQ96GX9 242 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 GPR137Q96N19 417 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM109Q9BVC6 243 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 RAB21Q9UL25 225 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 PSME2Q9UL46 239 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 F8P00451 2351 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-205ENST00000444916 NPIPA5E9PKD4 350 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 LRRTM2O43300 516 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 TRIM13O60858 407 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 CLPSP04118 112 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 NT5EP21589 574 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 SSTR4P31391 388 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 DEKP35659 375 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 RAE1P78406 368 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 RBPJQ06330 500 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 FUT7Q11130 342 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 ASPHQ12797 758 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 EBPQ15125 230 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 PIGGQ5H8A4 983 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 RNFT1Q5M7Z0 435 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 C6orf163Q5TEZ5 329 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 GALNT18Q6P9A2 607 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 MYO7BQ6PIF6 2116 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 SCIMPQ6UWF3 145 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC15A4Q8N697 577 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 GOLM1Q8NBJ4 401 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC22A8Q8TCC7 542 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 KLHL29Q96CT2 875 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 SGCZQ96LD1 299 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM111AQ96PZ2 611 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 GAL3ST4Q96RP7 486 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 TRMOQ9BU70 441 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 WWTR1Q9GZV5 400 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 SIRT5Q9NXA8 310 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 NPIPA1Q9UND3 350 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 GTF3C1Q12789 2109 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 A0A1B0GUH1 482 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 WISP2O76076 250 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 NADKO95544 446 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 ATP1B1P05026 303 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 TUBBP07437 444 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 IL3P08700 152 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 CT62P0C5K7 136 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 UROSP10746 265 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 DRD2P14416 443 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 GSTM5P46439 218 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 ALDH9A1P49189 494 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 PER3P56645 1201 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 GPR85P60893 370 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 BTKQ06187 659 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 IMPG1Q17R60 797 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF750Q32MQ0 723 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 SPDYAQ5MJ70 313 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 TRIM46Q7Z4K8 759 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 C16orf52Q8NHV5 167 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 SMC6Q96SB8 1091 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 DEPPQ9NTK1 212 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC17A7Q9P2U7 560 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 HEY2Q9UBP5 337 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 UTS2RQ9UKP6 389 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 TFECO14948 347 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 ASNA1O43681 348 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC19A2O60779 497 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 SPAG7O75391 227 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 SERPINB3P29508 390 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 ALDH3A1P30838 453 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 FEN1P39748 380 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 RFC3P40938 356 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF844Q08AG5 666 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF763Q0D2J5 394 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-205ENST00000444916 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms