RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428101.6

LMO1-202, Transcript of LIM domain only 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO1, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1-202ENST00000428101 PRAMEF20Q5VT98 475 aa25.08■■□□□ 1.61
LMO1-202ENST00000428101 FAM219BQ5XKK7 198 aa25.08■■□□□ 1.61
LMO1-202ENST00000428101 LETMD1Q6P1Q0 360 aa25.08■■□□□ 1.61
LMO1-202ENST00000428101 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
LMO1-202ENST00000428101 METTL4Q8N3J2 472 aa25.08■■□□□ 1.61
LMO1-202ENST00000428101 FBXW8Q8N3Y1 598 aa25.08■■□□□ 1.61
LMO1-202ENST00000428101 RND1Q92730 232 aa25.08■■□□□ 1.61
LMO1-202ENST00000428101 LURAP1Q96LR2 239 aa25.08■■□□□ 1.61
LMO1-202ENST00000428101 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa25.08■■□□□ 1.61
LMO1-202ENST00000428101 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa25.08■■□□□ 1.61
LMO1-202ENST00000428101 OTOGQ6ZRI0 2925 aa25.07■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 A8MT66 165 aa25.07■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 AQP7O14520 342 aa25.07■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 SUSD5O60279 629 aa25.07■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 CT62P0C5K7 136 aa25.07■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 TSPAN8P19075 237 aa25.07■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 PIK3R1P27986 724 aa25.07■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 SERPINB3P29508 390 aa25.07■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 NUP107P57740 925 aa25.07■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 FAM13CQ8NE31 585 aa25.07■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 LILRB4Q8NHJ6 448 aa25.07■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 ASB5Q8WWX0 329 aa25.07■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 ELOVL6Q9H5J4 265 aa25.07■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 AHSPQ9NZD4 102 aa25.07■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 ZNF225Q9UK10 706 aa25.07■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 BCKDKO14874 412 aa25.06■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 OTCP00480 354 aa25.06■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 PDYNP01213 254 aa25.06■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 RFPL3SP0C7P2 107 aa25.06■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 CHRNB4P30926 498 aa25.06■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 FUT7Q11130 342 aa25.06■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 NTRK2Q16620 822 aa25.06■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa25.06■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 ZNF615Q8N8J6 731 aa25.06■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 OR4K14Q8NGD5 310 aa25.06■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 UCK2Q9BZX2 261 aa25.06■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 CNIH4Q9P003 139 aa25.06■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 NFU1Q9UMS0 254 aa25.06■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa25.05■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa25.05■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 LRRC3CA6NJW4 275 aa25.05■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 ACVR2AP27037 513 aa25.05■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 XKP51811 444 aa25.05■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 KCNJ2P63252 427 aa25.05■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 TMEM64Q6YI46 380 aa25.05■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 TIFABQ6ZNK6 161 aa25.05■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 PAGE2Q7Z2X7 111 aa25.05■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 COMMD6Q7Z4G1 85 aa25.05■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 GALNT12Q8IXK2 581 aa25.05■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 MYRIPQ8NFW9 859 aa25.05■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 OR5M3Q8NGP4 307 aa25.05■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 TRPC4APQ8TEL6 797 aa25.05■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 TP53INP1Q96A56 240 aa25.05■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 ZFP64Q9NPA5 681 aa25.05■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 CES1P1Q9UKY3 287 aa25.05■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 SLC12A4Q9UP95 1085 aa25.05■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 FAM215AQ9Y5M1 114 aa25.05■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 EXPH5Q8NEV8 1989 aa25.04■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 NKX2-6A6NCS4 301 aa25.04■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 LRATO95237 230 aa25.04■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 ABHD2P08910 425 aa25.04■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 CPMP14384 443 aa25.04■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 SSTR2P30874 369 aa25.04■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 HSD17B3P37058 310 aa25.04■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 MAN2A2P49641 1150 aa25.04■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 MAPK12P53778 367 aa25.04■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 TFF3Q07654 80 aa25.04■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 RTL6Q6ICC9 239 aa25.04■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 ZNF585AQ6P3V2 769 aa25.04■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 ACAD11Q709F0 780 aa25.04■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 TAGAPQ8N103 731 aa25.04■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 SELENOMQ8WWX9 145 aa25.04■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 ADIPOR1Q96A54 375 aa25.04■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 LDAHQ9H6V9 325 aa25.04■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 TMEM216Q9P0N5 145 aa25.04■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa25.04■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa25.03■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 HCN1O60741 890 aa25.03■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 TOXO94900 526 aa25.03■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 S1PR1P21453 382 aa25.03■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 MMP21Q8N119 569 aa25.03■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 C14orf79Q96F83 325 aa25.03■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 TTYH2Q9BSA4 534 aa25.03■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 OR10A5Q9H207 317 aa25.03■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 BRF2Q9HAW0 419 aa25.03■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 SPRR3Q9UBC9 169 aa25.03■■□□□ 1.6
LMO1-202ENST00000428101 TRPS1Q9UHF7 1281 aa25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms