RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 SOAT1P35610 550 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCT3P49368 545 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDK9P50750 372 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 EMP2P54851 167 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRR5P85299 388 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 VAC14Q08AM6 782 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAP4K2Q12851 820 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 GAB1Q13480 694 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 CAMK2BQ13554 666 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 RTP5Q14D33 572 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPATS1Q496A3 300 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 GTDC1Q4AE62 458 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF628Q5EBL2 1059 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 GALNT12Q8IXK2 581 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZFP90Q8TF47 636 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 METTL21AQ8WXB1 218 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 RIT1Q92963 219 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 MCUR1Q96AQ8 359 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 ELP4Q96EB1 424 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 CRB3Q9BUF7 120 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 CXorf21Q9HAI6 301 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 TPT1P8Q9HAU6 139 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 NTMQ9P121 344 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 ABCD2Q9UBJ2 740 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 C3orf18Q9UK00 162 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 L3MBTL1Q9Y468 752 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 C21orf140B9A014 251 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLIC1O00299 241 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 GSC2O15499 205 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 EMC8O43402 210 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLOD3O60568 738 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAD1O60671 282 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 ALOX12BO75342 701 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 TCN2P20062 427 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 STAT5AP42229 794 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 LTB4RQ15722 352 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM107Q6UX40 140 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC15A3Q8IY34 581 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR2L13Q8N349 312 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR56A1Q8NGH5 318 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR2Y1Q8NGV0 311 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 CT55Q8WUE5 264 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 TSLPQ969D9 159 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 CTHRC1Q96CG8 243 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAD21L1Q9H4I0 556 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADAP2Q9NPF8 381 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 ASCL3Q9NQ33 180 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 THSD1Q9NS62 852 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAT2BQ9NZL9 334 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM181Q9P2C4 612 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 DNAJA2O60884 412 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 PGM1P36871 562 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLA2G5P39877 138 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 MC3RP41968 323 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAGEA8P43361 318 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC7A2P52569 658 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 EFNA3P52797 238 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPS15P62841 145 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 RABL3Q5HYI8 236 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 SAXO2Q658L1 398 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 VWA5B2Q8N398 1253 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADCY4Q8NFM4 1077 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM125Q96AQ2 219 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 NXPE2Q96DL1 559 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 NEURL3Q96EH8 262 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDRT15Q96T59 188 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPR87Q9BY21 358 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 EPS8L2Q9H6S3 715 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADA2Q9NZK5 511 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 UPK1AO00322 258 aa15.83■□□□□ 0.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 BRINP1O60477 761 aa15.83■□□□□ 0.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGHEP01854 428 aa15.83■□□□□ 0.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPX2P18283 190 aa15.83■□□□□ 0.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 TNNI3P19429 210 aa15.83■□□□□ 0.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 FOLR3P41439 243 aa15.83■□□□□ 0.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 MTPNP58546 118 aa15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms