RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400919.7

FAAP20-204, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene FAAP20, Length 1,413 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-204ENST00000400919 RNF4P78317 190 aa25.51■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 EMX2Q04743 252 aa25.51■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 IL23RQ5VWK5 629 aa25.51■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 FAM180BQ6P0A1 224 aa25.51■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 RNF111Q6ZNA4 994 aa25.51■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 CCDC116Q8IYX3 515 aa25.51■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 LRRC34Q8IZ02 419 aa25.51■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 BRINP2Q9C0B6 783 aa25.51■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 AKTIPQ9H8T0 292 aa25.51■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 MEAF6Q9HAF1 191 aa25.51■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa25.51■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 OR6C76A6NM76 312 aa25.5■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 GABRR3A8MPY1 467 aa25.5■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 KITP10721 976 aa25.5■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 SLC29A4Q7RTT9 530 aa25.5■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 VWA5B2Q8N398 1253 aa25.5■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 LIX1Q8N485 282 aa25.5■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 HORMAD2Q8N7B1 307 aa25.5■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 OR7G1Q8NGA0 311 aa25.5■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 NPAS2Q99743 824 aa25.5■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 C1orf50Q9BV19 199 aa25.5■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 REEP4Q9H6H4 257 aa25.5■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 MED4Q9NPJ6 270 aa25.5■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 MYOTQ9UBF9 498 aa25.5■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 TRAV17A0A0B4J275 112 aa25.49■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 HRKO00198 91 aa25.49■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 ITGA10O75578 1167 aa25.49■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 NTSP30990 170 aa25.49■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 RPL3P39023 403 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 TNFSF10P50591 281 aa25.49■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 FUT7Q11130 342 aa25.49■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 MAP4K2Q12851 820 aa25.49■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 CEBPEQ15744 281 aa25.49■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa25.49■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 CLHC1Q8NHS4 586 aa25.49■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 NUBPLQ8TB37 319 aa25.49■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 DOK4Q8TEW6 326 aa25.49■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 MTERF3Q96E29 417 aa25.49■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 AKAP10O43572 662 aa25.48■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 MAN1A2O60476 641 aa25.48■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 LRATO95237 230 aa25.48■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 F10P00742 488 aa25.48■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 HPCAL1P37235 193 aa25.48■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa25.48■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 TMEM156Q8N614 296 aa25.48■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa25.48■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 PPCDCQ96CD2 204 aa25.48■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 C7orf26Q96N11 449 aa25.48■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 CSAG2Q9Y5P2 127 aa25.48■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa25.48■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 TTLL8A6PVC2 850 aa25.47■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 LBPP18428 481 aa25.47■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 CYB561P49447 251 aa25.47■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 SSR4P51571 173 aa25.47■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 SLC37A1P57057 533 aa25.47■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 TUBA3CQ13748 450 aa25.47■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 TUBA3EQ6PEY2 450 aa25.47■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF605Q86T29 641 aa25.47■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 FAM9CQ8IZT9 166 aa25.47■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 CATSPER1Q8NEC5 780 aa25.47■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 ADCY4Q8NFM4 1077 aa25.47■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF675Q8TD23 568 aa25.47■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 ERP27Q96DN0 273 aa25.47■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 OR10A5Q9H207 317 aa25.47■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 ASIC5Q9NY37 505 aa25.47■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 MAT2BQ9NZL9 334 aa25.47■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 SH3BP4Q9P0V3 963 aa25.47■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 CFL2Q9Y281 166 aa25.47■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 MYO1GB0I1T2 1018 aa25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 TBX19O60806 448 aa25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 CT62P0C5K7 136 aa25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 SSTR4P31391 388 aa25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 CD96P40200 585 aa25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP25.46■■□□□ 1.676e-7■■■■■ 32.1
FAAP20-204ENST00000400919 C9orf40Q8IXQ3 194 aa25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 MAGEB18Q96M61 343 aa25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 ANKRD10Q9NXR5 420 aa25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 MAPRE3Q9UPY8 281 aa25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 WWP2O00308 870 aa25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 OR2J2O76002 312 aa25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 PCSK2P16519 638 aa25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 PRPS1L1P21108 318 aa25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms