RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399598.6

UBXN2B-201, Transcript of UBX domain protein 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN2B, Length 5,068 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2B-201ENST00000399598 TMIGD2Q96BF3 282 aa14.52□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 APIPQ96GX9 242 aa14.52□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 CLEC4EQ9ULY5 219 aa14.52□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 ABCC6O95255 1503 aa14.52□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 PCDH17O14917 1159 aa14.52□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 DHRS4L1P0CG22 281 aa14.52□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 ADORA3P0DMS8 318 aa14.52□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 HS3ST5Q8IZT8 346 aa14.52□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 DTWD1Q8N5C7 304 aa14.52□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 NETO1Q8TDF5 533 aa14.52□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 PNPLA2Q96AD5 504 aa14.52□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 BIRC8Q96P09 236 aa14.52□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 ANXA3P12429 323 aa14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 DNASE1P24855 282 aa14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 HERV-K104P61576 105 aa14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 ACTC1P68032 377 aa14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 ACTA1P68133 377 aa14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 COMMD6Q7Z4G1 85 aa14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 NELL2Q99435 816 aa14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 C5AR2Q9P296 337 aa14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 EPHA6Q9UF33 1036 aa14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 IL20RAQ9UHF4 553 aa14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 CNR2P34972 360 aa14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 KCNJ5P48544 419 aa14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 LRFN4Q6PJG9 635 aa14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 WDR92Q96MX6 357 aa14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 G6PC3Q9BUM1 346 aa14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 CD70P32970 193 aa14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 CLCN2P51788 898 aa14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 FOXA1P55317 472 aa14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 ARF1P84077 181 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 NKAPLQ5M9Q1 402 aa14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 C17orf50Q8WW18 174 aa14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 CRYGNQ8WXF5 182 aa14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 ATG5Q9H1Y0 275 aa14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 GPR52Q9Y2T5 361 aa14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 MON2Q7Z3U7 1717 aa14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 C6P13671 934 aa14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 RBMXP38159 391 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 RIN1Q13671 783 aa14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 SHFQ7M4L6 423 aa14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 WDR20Q8TBZ3 569 aa14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 INPP5KQ9BT40 448 aa14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 LHPPQ9H008 270 aa14.51□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 SOBPA7XYQ1 873 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 RFPL2O75678 378 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 OR2B3O76000 313 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 CSF2RAP15509 400 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 GABARAPL2P60520 117 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 RCAN2Q14206 197 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 STOML3Q8TAV4 291 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 GSTO2Q9H4Y5 243 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 PDLIM7Q9NR12 457 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 SLC22A31A6NKX4 558 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 H2BFMP0C1H6 154 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 MTNR1AP48039 350 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 TBC1D25Q3MII6 688 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 CHRDL2Q6WN34 429 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 PROKR1Q8TCW9 393 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 TESCQ96BS2 214 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 SLC6A7Q99884 636 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 GXYLT2A0PJZ3 443 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 FMO6PO60774 539 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 HRH2P25021 359 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 UQCRC1P31930 480 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 ZNF542PQ5EBM4 170 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 ZNF584Q8IVC4 421 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 SYNPOQ8N3V7 929 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 SLC15A4Q8N697 577 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 TMEM234Q8WY98 164 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 C7orf34Q96L11 122 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 STUB1Q9UNE7 303 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 PLCL2Q9UPR0 1127 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 MYO10Q9HD67 2058 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 PPM1BO75688 479 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 RP2O75695 350 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 PRKCAP17252 672 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 OXTRP30559 389 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 DCTP40126 519 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 CRTC1Q6UUV9 634 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms