RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAOAP21397 527 aa26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 GAB1Q13480 694 aa26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 MLC1Q15049 377 aa26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 MFSD4BQ5TF39 518 aa26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRSS58Q8IYP2 241 aa26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRIM4Q9C037 500 aa26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 CXorf36Q9H7Y0 433 aa26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 DLL3Q9NYJ7 618 aa26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 ACTR3BQ9P1U1 418 aa26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 VPS4AQ9UN37 437 aa26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 CFAP54Q96N23 3096 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 C9orf172C9J069 976 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARPC2O15144 300 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 ONECUT2O95948 504 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 PORP16435 677 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 ATP6V1B2P21281 511 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 CDK9P50750 372 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 HSD17B7P56937 341 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR4D2P58180 307 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 MINDY4Q4G0A6 757 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 GALNT6Q8NCL4 622 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR10A6Q8NH74 314 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZFP28Q8NHY6 868 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF583Q96ND8 569 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 LRFN5Q96NI6 719 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRIM15Q9C019 465 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 STOML1Q9UBI4 398 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 CLDN16Q9Y5I7 305 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 SNX8Q9Y5X2 465 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 H3BNX3 289 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 STK17BO94768 372 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 C8BP07358 591 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 AGXTP21549 392 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 IL10P22301 178 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 PPP2R1BP30154 601 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 SOX11P35716 441 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 FOXL2P58012 376 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 STX4Q12846 297 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 LTB4RQ15722 352 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZFP1Q6P2D0 407 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 MED25Q71SY5 747 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 LAPTM4BQ86VI4 370 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR9A2Q8NGT5 310 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 STT3BQ8TCJ2 826 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 PHF12Q96QT6 1004 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 SNX13Q9Y5W8 968 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 NUP210LQ5VU65 1888 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 SOAT1P35610 550 aa25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 LCN8Q6JVE9 175 aa25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 ADCY4Q8NFM4 1077 aa25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR5AK3PQ8NH89 298 aa25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 TGIF2Q9GZN2 237 aa25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 NEUROD4Q9HD90 331 aa25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 NECTIN3Q9NQS3 549 aa25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 FOXJ2Q9P0K8 574 aa25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 PTPRBP23467 1997 aa25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZCCHC18P0CG32 403 aa25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 GPC1P35052 558 aa25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 EFNA3P52797 238 aa25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 RHDQ02161 417 aa25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 OCA2Q04671 838 aa25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 FXNQ16595 210 aa25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 MLIPQ5VWP3 458 aa25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 OVCH1Q7RTY7 1134 aa25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPPL2CQ8IUH8 684 aa25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 PTCHD1Q96NR3 888 aa25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 CEP250Q9BV73 2442 aa25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZGLP1P0C6A0 271 aa25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 NCK1P16333 377 aa25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM164Q5U3C3 297 aa25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM151BQ8IW70 566 aa25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR2T12Q8NG77 320 aa25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 PSMA8Q8TAA3 256 aa25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 MR1Q95460 341 aa25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC35A5Q9BS91 424 aa25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 CHST8Q9H2A9 424 aa25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 ACSL6Q9UKU0 697 aa25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 MKL2Q9ULH7 1088 aa25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 KNTC1P50748 2209 aa25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 DCDC2BA2VCK2 349 aa25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 CLIC1O00299 241 aa25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 TNFSF15O95150 251 aa25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 RHAGQ02094 409 aa25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM107Q6UX40 140 aa25.97■■□□□ 1.75
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