RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373433.8

RPRD1B-201, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPRD1B, Length 3,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-201ENST00000373433 GSTM1P09488 218 aa10.64□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC35G4P0C7Q5 338 aa10.64□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 ALAS2P22557 587 aa10.64□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 MAN2A2P49641 1150 aa10.64□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 CDC42P60953 191 aa10.64□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 CNTN1Q12860 1018 aa10.64□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 FLYWCH1Q4VC44 716 aa10.64□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 LIPKQ5VXJ0 399 aa10.64□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 XKRXQ6PP77 449 aa10.64□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 TSTD1Q8NFU3 115 aa10.64□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 SPATA9Q9BWV2 254 aa10.64□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 WDR26Q9H7D7 661 aa10.64□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 NIPAL2Q9H841 368 aa10.64□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 GALNT9Q9HCQ5 603 aa10.64□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 MARK1Q9P0L2 795 aa10.64□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 SSR3Q9UNL2 185 aa10.64□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 MAPRE3Q9UPY8 281 aa10.64□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 CCL27Q9Y4X3 112 aa10.64□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 IGLON5A6NGN9 336 aa10.64□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 WASHC1A8K0Z3 465 aa10.64□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 ADH1BP00325 375 aa10.64□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 ADRA2AP08913 450 aa10.64□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 NUDT7P0C024 238 aa10.64□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 C6P13671 934 aa10.64□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 TIMP2P16035 220 aa10.64□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 KIR3DL1P43629 444 aa10.64□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 DOC2BQ14184 412 aa10.64□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 C10orf53Q8N6V4 93 aa10.64□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 NELL1Q92832 810 aa10.64□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 BTBD1Q9H0C5 482 aa10.64□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 SOHLH2Q9NX45 425 aa10.64□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 COMMD3Q9UBI1 195 aa10.64□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 GMFGO60234 142 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 CCNB2O95067 398 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 PRKACAP17612 351 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 ACRV1P26436 265 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 CTHP32929 405 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 CCT3P49368 545 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 NAE1Q13564 534 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 POU4F3Q15319 338 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 LRIF1Q5T3J3 769 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 CBLL1Q75N03 491 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 TRIM69Q86WT6 500 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC37A3Q8NCC5 494 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 GALNT11Q8NCW6 608 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 RAB7BQ96AH8 199 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 TBC1D20Q96BZ9 403 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 RSPRY1Q96DX4 576 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 ALG14Q96F25 216 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 LRRC3BQ96PB8 259 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 OPALINQ96PE5 141 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 FAM83CQ9BQN1 747 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 CLEC2DQ9UHP7 191 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 MANBAO00462 879 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 PLA2G10O15496 165 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 RASGRP1O95267 797 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 KCNK5O95279 499 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 CPN2P22792 545 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 APEX1P27695 318 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 EVI2BP34910 448 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP10.63□□□□□ -0.718e-6■■□□□ 13.7
RPRD1B-201ENST00000373433 IQCCQ4KMZ1 466 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 DDI2Q5TDH0 399 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 RFLNAQ6ZTI6 216 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 GLYATL1Q969I3 302 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 HHATLQ9HCP6 504 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 C11orf16Q9NQ32 467 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 CLN6Q9NWW5 311 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 B3GNT2Q9NY97 397 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 RIMKLBQ9ULI2 386 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 PPT2Q9UMR5 302 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 NINQ8N4C6 2090 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 CACNA1HO95180 2353 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 MYL12BO14950 172 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 PLOD3O60568 738 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 TPPPO94811 219 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 RPN2P04844 631 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 CTRB1P17538 263 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 MYL12AP19105 171 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 DDCP20711 480 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 TNK1Q13470 666 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 XKR6Q5GH73 641 aa10.63□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 CTRB2Q6GPI1 263 aa10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms