RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 RHBDF1Q96CC6 855 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 PHOX2BQ99453 314 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 SCML1Q9UN30 329 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1W2PPL8 197 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 DHRS4L1P0CG22 281 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 GRK5P34947 590 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 POU4F2Q12837 409 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF789Q5FWF6 425 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 MPP7Q5T2T1 576 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 ABCD2Q9UBJ2 740 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 AK4P27144 223 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 ETV4P43268 484 aa19.33■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 MAGEA2P43356 314 aa19.33■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 DNASE1L3Q13609 305 aa19.33■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa19.33■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 OR2L2Q8NH16 312 aa19.33■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 NANSQ9NR45 359 aa19.33■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa19.33■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 MAP2K4P45985 399 aa19.33■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF84P51523 738 aa19.33■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 LRIT3Q3SXY7 679 aa19.33■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF542PQ5EBM4 170 aa19.33■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa19.33■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa19.33■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 PLXDC1Q8IUK5 500 aa19.33■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 OR7G3Q8NG95 312 aa19.33■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 TESCQ96BS2 214 aa19.33■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 SYT11Q9BT88 431 aa19.33■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 KCNK12Q9HB15 430 aa19.33■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 A0A0G2JPF8 293 aa19.33■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa19.33■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 NME4O00746 187 aa19.33■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 SYNGR4O95473 234 aa19.33■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa19.33■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 FOXJ1Q92949 421 aa19.33■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 CREB3L1Q96BA8 519 aa19.33■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 PELI2Q9HAT8 420 aa19.33■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 FZD3Q9NPG1 666 aa19.33■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 NPIPA2E9PIF3 369 aa19.33■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 NPIPA3F8WFD2 350 aa19.33■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 SEMA4FO95754 770 aa19.33■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 IL1RNP18510 177 aa19.33■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 HERV-K104P61576 105 aa19.33■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 FIGNL1Q6PIW4 674 aa19.33■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 CEACAM19Q7Z692 300 aa19.33■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 SPAG16Q8N0X2 631 aa19.33■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 ZFAND2BQ8WV99 257 aa19.33■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 ANKMY1Q9P2S6 941 aa19.33■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 ENPP4Q9Y6X5 453 aa19.33■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 STSP08842 583 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 TCTE1Q5JU00 501 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM130Q8N3G9 435 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 OR4K5Q8NGD3 323 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 RFT1Q96AA3 541 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 LINC00597Q9H2U6 94 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 SMOXQ9NWM0 555 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 DENRO43583 198 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 CAPN3P20807 821 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 HHEXQ03014 270 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 OR4N5Q8IXE1 308 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 PTERQ96BW5 349 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 APIPQ96GX9 242 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF696Q9H7X3 374 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 LOC100509620A0A075B734 347 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 CSF2P04141 144 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 DPP6P42658 865 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 SELENOVP59797 346 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 LETMD1Q6P1Q0 360 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 TTLL10Q6ZVT0 673 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 HMGN2P46Q86SG4 172 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 FOXRED2Q8IWF2 684 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 HS3ST5Q8IZT8 346 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 SLC39A11Q8N1S5 342 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 GSTO2Q9H4Y5 243 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 DRGXA6NNA5 263 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 AURKAO14965 403 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 TIMP1P01033 207 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 BMP2P12643 396 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 PRKCAP17252 672 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 RIN1Q13671 783 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 RUNDC3AQ59EK9 446 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 ENPP6Q6UWR7 440 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 USP53Q70EK8 1073 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 VTCN1Q7Z7D3 282 aa19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms