RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364561.1

RNU6-1277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1277P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TTC26A0AVF1 554 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TMEM120BA0PK00 339 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MOXD2PA6NHM9 499 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C19orf81C9J6K1 198 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TRAPPC2LH3BP13 241 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C15orf65H3BRN8 121 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CLDN34H7C241 214 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FAAHO00519 579 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TM9SF1O15321 606 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 AVILO75366 819 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DDX58O95786 925 aaKnown RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IGHV4-59P01825 116 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ARG1P05089 322 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CCL4P13236 92 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MYF5P13349 255 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 AKR1C4P17516 323 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NME2P22392 152 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PSMB8P28062 276 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HTR7P34969 479 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GRK3P35626 688 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CEACAM6P40199 344 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MAGEA9P43362 315 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PSMC4P43686 418 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NPBWR2P48146 333 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RFX3P48380 749 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 XKP51811 444 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GTF2A2P52657 109 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF131P52739 623 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IRX4P78413 519 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MCL1Q07820 350 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PPP2R5CQ13362 524 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SERINC3Q13530 473 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EFR3AQ14156 821 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MFSD10Q14728 455 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GNMTQ14749 295 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 P2RY6Q15077 328 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PTPN14Q15678 1187 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 AAK1Q2M2I8 961 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GAGE2EQ4V326 116 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C19orf54Q5BKX5 351 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ELP2Q6IA86 826 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FAM171BQ6P995 826 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C2orf66Q6UXQ4 117 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KDELC2Q7Z4H8 507 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RASSF3Q86WH2 238 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NOSTRINQ8IVI9 506 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CPXM2Q8N436 756 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SIRT6Q8N6T7 355 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LINC01465Q8N7H1 131 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EXD3Q8N9H8 876 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 AVL9Q8NBF6 648 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SLC38A9Q8NBW4 561 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZBTB44Q8NCP5 570 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C11orf65Q8NCR3 313 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 BBS1Q8NFJ9 593 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OR5AN1Q8NGI8 311 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OR10G4Q8NGN3 311 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OR5M8Q8NGP6 311 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LYPD6BQ8NI32 183 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NPLOC4Q8TAT6 608 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 POC1BQ8TC44 478 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HELQQ8TDG4 1101 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HTR3CQ8WXA8 447 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ATP6V0A1Q93050 837 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HPS3Q969F9 1004 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CEP95Q96GE4 821 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C12orf42Q96LP6 360 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CCDC140Q96MF4 163 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KIF2CQ99661 725 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DESI2Q9BSY9 194 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HIGD2AQ9BW72 106 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PORCNQ9H237 461 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CALHM2Q9HA72 323 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LIN7BQ9HAP6 207 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PLEKHA1Q9HB21 404 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GLOD4Q9HC38 313 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 APMAPQ9HDC9 416 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SLC6A20Q9NP91 592 aa-2.59□□□□□ -2.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms