RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331163.10

PDGFB-201, Transcript of platelet derived growth factor subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFB, Length 3,497 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFB-201ENST00000331163 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 ENPP6Q6UWR7 440 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 RRM2BQ7LG56 351 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 ZDHHC12Q96GR4 267 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 CHID1Q9BWS9 393 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 A0A0J9YY10 115 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 FRS3O43559 492 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 GDF9O60383 454 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 HPGDP15428 266 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 NME1P15531 152 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 PSMA3P25788 255 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 PPP2R1BP30154 601 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 KIR2DS3Q14952 304 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 SLC5A12Q1EHB4 618 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 COX20Q5RI15 118 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 CCNJQ5T5M9 372 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 PRMT9Q6P2P2 845 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 ABHD13Q7L211 337 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 TMEM105Q8N8V8 129 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 ROPN1LQ96C74 230 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 NDC1Q9BTX1 674 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 SUSD2Q9UGT4 822 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 A0A1W2PPV9 198 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 SPEM2Q0P670 501 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 SLC14A1Q13336 389 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 NIPAL1Q6NVV3 410 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 FIGNL1Q6PIW4 674 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 HS3ST5Q8IZT8 346 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 OR2A14Q96R47 310 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 AIFM1O95831 613 aa15□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 LDLRP01130 860 aa15□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP15□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 HOXC5Q00444 222 aa15□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 ANGPT1Q15389 498 aa15□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 C14orf28Q4W4Y0 310 aa15□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 FAM111BQ6SJ93 734 aa15□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 CCDC80Q76M96 950 aa15□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 LHPPQ9H008 270 aa15□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 MKLN1Q9UL63 735 aa15□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 TMED5Q9Y3A6 229 aa15□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa15□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 KLHL18O94889 574 aa15□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 HERC3Q15034 1050 aa15□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 CDKL4Q5MAI5 379 aa15□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 FBXO42Q6P3S6 717 aa15□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 TMEM64Q6YI46 380 aa15□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 TTLQ8NG68 377 aa15□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 OR2L5Q8NG80 312 aa15□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 C16orf58Q96GQ5 468 aa15□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 TAS2R9Q9NYW1 312 aa15□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 SEC14L3Q9UDX4 400 aa15□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 PCNX2A6NKB5 2137 aa15□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa15□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 M0R3G1 203 aa15□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 MPIP34949 423 aa15□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 IDUAP35475 653 aa15□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 CAPGP40121 348 aa15□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 ARHGDIAP52565 204 aa15□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 GBX1Q14549 363 aa15□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 ZNF793Q6ZN11 406 aa15□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 CSF3RQ99062 836 aa15□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 ABCB10Q9NRK6 738 aa15□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 LMO7DNF2Z398 122 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 XCR1P46094 333 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 AVPR1BP47901 424 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 RGS19P49795 217 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 NXPH1P58417 271 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 ABATP80404 500 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 FZD5Q13467 585 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 GAB1Q13480 694 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 ATAD3BQ5T9A4 648 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 SLCO6A1Q86UG4 719 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 SLC25A45Q8N413 288 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 MINDY1Q8N5J2 469 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 AMER2Q8N7J2 671 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 FAM86B1Q8N7N1 296 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 NETO1Q8TDF5 533 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 TMEM125Q96AQ2 219 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 CLMPQ9H6B4 373 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 FGF21Q9NSA1 209 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 AASSQ9UDR5 926 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 ERGIC3Q9Y282 383 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 TRBC2A0A5B9 178 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFB-201ENST00000331163 ASPDHA6ND91 283 aa14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.4 ms