RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 SH3BP4Q9P0V3 963 aa24.92■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa24.92■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 IGSF10Q6WRI0 2623 aa24.92■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 IGKV3-11P04433 115 aa24.91■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 NTSP30990 170 aa24.91■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 SOX11P35716 441 aa24.91■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 DIO3P55073 304 aa24.91■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 C21orf58P58505 322 aa24.91■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 MEP1AQ16819 746 aa24.91■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa24.91■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 ABHD17BQ5VST6 288 aa24.91■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 LGI4Q8N135 537 aa24.91■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 KIF2BQ8N4N8 673 aa24.91■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 NATD1Q8N6N6 113 aa24.91■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 EPS8L2Q9H6S3 715 aa24.91■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 ATAD3AQ9NVI7 634 aa24.91■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 ERVK-19Q9WJR5 959 aa24.91■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 FUT7Q11130 342 aa24.9■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 MFAP5Q13361 173 aa24.9■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 PRSS53Q2L4Q9 553 aa24.9■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 IGFL2Q6UWQ7 119 aa24.9■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 IGFL3Q6UXB1 125 aa24.9■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 OR7G1Q8NGA0 311 aa24.9■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 OR5L2Q8NGL0 311 aa24.9■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF675Q8TD23 568 aa24.9■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 SIKE1Q9BRV8 207 aa24.9■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 BRINP2Q9C0B6 783 aa24.9■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 ABI3Q9P2A4 366 aa24.9■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 FAM208BQ5VWN6 2430 aa24.9■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 OR6C76A6NM76 312 aa24.89■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 CDK2AP1O14519 115 aa24.89■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 SLITRK5O94991 958 aa24.89■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 AQP5P55064 265 aa24.89■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 DUSP2Q05923 314 aa24.89■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 ACER2Q5QJU3 275 aa24.89■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 CPTPQ5TA50 214 aa24.89■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 RNF111Q6ZNA4 994 aa24.89■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 RIMKLAQ8IXN7 391 aa24.89■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 ARMC10Q8N2F6 343 aa24.89■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 VWA5B2Q8N398 1253 aa24.89■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 ZADH2Q8N4Q0 377 aa24.89■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 CTHRC1Q96CG8 243 aa24.89■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 ERP27Q96DN0 273 aa24.89■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 DPY30Q9C005 99 aa24.89■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 CDCP1Q9H5V8 836 aa24.89■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 MAT2BQ9NZL9 334 aa24.89■■□□□ 1.58
CRIP1-201ENST00000330233 PDPK1O15530 556 aa24.88■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 DPM1O60762 260 aa24.88■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 CT62P0C5K7 136 aa24.88■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 IDH3AP50213 366 aa24.88■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP24.88■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 RNF4P78317 190 aa24.88■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 MGAT2Q10469 447 aa24.88■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 RPS6KA2Q15349 733 aa24.88■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 LINC00696Q6ZRV3 163 aa24.88■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF321PQ8N8H1 164 aa24.88■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 ADCY4Q8NFM4 1077 aa24.88■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 SUN3Q8TAQ9 357 aa24.88■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 SLC39A7Q92504 469 aa24.88■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 COQ8BQ96D53 544 aa24.88■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC28BQ9BUN5 200 aa24.88■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 TCF7L2Q9NQB0 619 aa24.88■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 AIG1Q9NVV5 245 aa24.88■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF639Q9UID6 485 aa24.88■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa24.88■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 K7EM74 188 aa24.87■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 HRKO00198 91 aa24.87■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 FCHO1O14526 889 aa24.87■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 UBDO15205 165 aa24.87■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 PDGFAP04085 211 aa24.87■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 VIMP08670 466 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 IDO1P14902 403 aa24.87■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 SLC37A1P57057 533 aa24.87■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 GSTA3Q16772 222 aa24.87■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa24.87■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 FAM111BQ6SJ93 734 aa24.87■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa24.87■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 OR7A2PQ8NGA2 310 aa24.87■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 ZFP28Q8NHY6 868 aa24.87■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 DOK4Q8TEW6 326 aa24.87■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 STON2Q8WXE9 905 aa24.87■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 AMDHD1Q96NU7 426 aa24.87■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 OR52B2Q96RD2 323 aa24.87■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 OR10A5Q9H207 317 aa24.87■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 GLIPR2Q9H4G4 154 aa24.87■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 ATRXP46100 2492 aa24.87■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 DYTNA2CJ06 578 aa24.86■■□□□ 1.57
CRIP1-201ENST00000330233 S1PR1P21453 382 aa24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms