RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320857.7

SSR4-201, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SSR4, Length 1,671 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-201ENST00000320857 ZBED5Q49AG3 693 aa16.02■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 CYP27C1Q4G0S4 372 aa16.02■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 DEFB134Q4QY38 66 aa16.02■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 FRMPD2BQ6IN97 320 aa16.02■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 TMEM107Q6UX40 140 aa16.02■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 IQCHQ86VS3 1027 aa16.02■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 OR4N4Q8N0Y3 316 aa16.02■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 FBLIM1Q8WUP2 373 aa16.02■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa16.02■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 TBC1D17Q9HA65 648 aa16.02■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 LYRM4Q9HD34 91 aa16.02■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 BCL2L10Q9HD36 194 aa16.02■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 KCMF1Q9P0J7 381 aa16.02■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 SPACA6W5XKT8 324 aa16.02■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 TRIOO75962 3097 aa16.01■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 B4DGG1 531 aa16.01■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 ALPPL2P10696 532 aa16.01■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 CYP4B1P13584 511 aa16.01■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 PVRP15151 417 aa16.01■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 CD38P28907 300 aa16.01■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 KCNJ5P48544 419 aa16.01■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 PXNP49023 591 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 CLK3P49761 638 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 HMGA2P52926 109 aa16.01■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 LIM2P55344 173 aa16.01■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 RAPSNQ13702 412 aa16.01■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 SYPL1Q16563 259 aa16.01■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 MICAQ29983 383 aa16.01■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa16.01■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa16.01■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 ZNF605Q86T29 641 aa16.01■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 GKN2Q86XP6 184 aa16.01■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 SFTPA2Q8IWL1 248 aa16.01■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 LGI4Q8N135 537 aa16.01■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 CAMKK1Q8N5S9 505 aa16.01■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 OR4K14Q8NGD5 310 aa16.01■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 OR5D16Q8NGK9 328 aa16.01■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 OR9A2Q8NGT5 310 aa16.01■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 KLHL6Q8WZ60 621 aa16.01■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 TMIGD2Q96BF3 282 aa16.01■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 ELP4Q96EB1 424 aa16.01■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 C10orf90Q96M02 699 aa16.01■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 COL21A1Q96P44 957 aa16.01■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 GABARAPL3Q9BY60 117 aa16.01■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 SEC14L3Q9UDX4 400 aa16.01■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 DAPP1Q9UN19 280 aa16.01■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 A0A1W2PR77 199 aa16■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 H3BSA7 217 aa16■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 AHCYL1O43865 530 aa16■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 GADD45GO95257 159 aa16■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 CSF2P04141 144 aa16■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 NME1P15531 152 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 NPRL3Q12980 569 aa16■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 CDK5R2Q13319 367 aa16■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 RUNX2Q13950 521 aa16■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa16■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa16■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 KLHL35Q6PF15 583 aa16■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa16■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 KCTD8Q6ZWB6 473 aa16■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa16■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 NUP43Q8NFH3 380 aa16■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 GPR32P1Q8NGA4 272 aa16■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 OR52J3Q8NH60 311 aa16■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 ZNF566Q969W8 418 aa16■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 ZNF354BQ96LW1 612 aa16■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 PITX2Q99697 317 aa16■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 PSD2Q9BQI7 771 aa16■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 SEMA6CQ9H3T2 930 aa16■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa16■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 ACER3Q9NUN7 267 aa16■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 PTTG2Q9NZH5 202 aa16■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 POMT2Q9UKY4 750 aa16■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 POFUT2Q9Y2G5 429 aa16■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa15.99■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 J3KTA2 159 aa15.99■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 ASNA1O43681 348 aa15.99■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 ABCB7O75027 752 aa15.99■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 CCNB2O95067 398 aa15.99■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 SLC34A2O95436 690 aa15.99■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 WNT1P04628 370 aa15.99■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 CCDC159P0C7I6 412 aa15.99■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 ETS2P15036 469 aa15.99■□□□□ 0.15
SSR4-201ENST00000320857 MC3RP41968 323 aa15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms