RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316412.9

PRAMEF20-201, Transcript of PRAME family member 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PRAMEF20, Length 1,597 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20-201ENST00000316412 ELP4Q96EB1 424 aa16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 NEURL3Q96EH8 262 aa16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 SPRY4Q9C004 299 aa16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 SEMA3GQ9NS98 782 aa16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 USP22Q9UPT9 525 aa16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 VSTM2BA6NLU5 285 aa16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 EVPLLA8MZ36 301 aa16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 PLOD2O00469 737 aa16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 SDHBP21912 280 aa16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 GPC1P35052 558 aa16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZNF628Q5EBL2 1059 aa16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 TMEM107Q6UX40 140 aa16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 TMPRSS12Q86WS5 348 aa16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 OR10A6Q8NH74 314 aa16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 SFXN5Q8TD22 340 aa16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZNF675Q8TD23 568 aa16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 KAT2AQ92830 837 aa16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 PTCHD1Q96NR3 888 aa16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 ECSITQ9BQ95 431 aa16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 CHST8Q9H2A9 424 aa16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 SLC26A1Q9H2B4 701 aa16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 ALG2Q9H553 416 aa16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 NTMQ9P121 344 aa16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 SATB2Q9UPW6 733 aa16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 AP3M1Q9Y2T2 418 aa16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 C9orf172C9J069 976 aa16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZGLP1P0C6A0 271 aa16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 AGXTP21549 392 aa16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 MC3RP41968 323 aa16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 MS4A2Q01362 244 aa16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 STX4Q12846 297 aa16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 BIKQ13323 160 aa16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 RGNQ15493 299 aa16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 C3orf38Q5JPI3 329 aa16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 COX20Q5RI15 118 aa16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 FHL5Q5TD97 284 aa16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 FAM111BQ6SJ93 734 aa16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 TMEM151BQ8IW70 566 aa16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 PLPP5Q8NEB5 264 aa16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 OR7G2Q8NG99 324 aa16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 OR52N2Q8NGI0 321 aa16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 WDR60Q8WVS4 1066 aa16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 FKBP10Q96AY3 582 aa16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 CTHRC1Q96CG8 243 aa16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 VN1R1Q9GZP7 353 aa16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 PIF1Q9H611 641 aa16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 MAT2BQ9NZL9 334 aa16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 POMPQ9Y244 141 aa16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 ACOT8O14734 319 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 EMC8O43402 210 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 DNAJA2O60884 412 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 STK17BO94768 372 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 KCNK5O95279 499 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 KRT75O95678 551 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 DLGAP3O95886 979 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 ALBP02768 609 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 IFI6P09912 130 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 CT62P0C5K7 136 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 NT5EP21589 574 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 STT3AP46977 705 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 FOXL2P58012 376 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 OR4D2P58180 307 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 OCA2Q04671 838 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 VAC14Q08AM6 782 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 SERTAD2Q14140 314 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 FXNQ16595 210 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 NKG7Q16617 165 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 MINDY4Q4G0A6 757 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 C6orf120Q7Z4R8 191 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 IFNEQ86WN2 208 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 PRSS58Q8IYP2 241 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 GALNT6Q8NCL4 622 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 TSLPQ969D9 159 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 MOAP1Q96BY2 351 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 ANKRA2Q9H9E1 313 aa16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.1 ms