RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299259.10

COPS2-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS2, Length 2,036 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2-201ENST00000299259 ADI1Q9BV57 179 aa9.88□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 RAB23Q9ULC3 237 aa9.88□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 PADI2Q9Y2J8 665 aa9.88□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa9.88□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 MAGEA13PA6NCF6 341 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 TMEM229AB2RXF0 380 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 I3L1I5 382 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 M0QX08 132 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 DLGAP1O14490 977 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 YKT6O15498 198 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 FGF17O60258 216 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 PGM3O95394 542 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 MED26O95402 600 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 MYF5P13349 255 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 DCTP40126 519 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 ARL4DP49703 201 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 ID2Q02363 134 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 GARNL3Q5VVW2 1013 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 OR4N5Q8IXE1 308 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 LGI4Q8N135 537 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 METTL25Q8N6Q8 603 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 TMEM52Q8NDY8 209 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 NUP43Q8NFH3 380 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 OR5K1Q8NHB7 308 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 TANKQ92844 425 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 GATA6Q92908 595 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 COL26A1Q96A83 441 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 CCDC74AQ96AQ1 378 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 ANKRD60Q9BZ19 345 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 EQTNQ9NQ60 294 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 FSCN3Q9NQT6 498 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 FBXO4Q9UKT5 387 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 U3KQV3 271 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 NCOR1O75376 2440 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 HYKKA2RU49 373 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 LDB3O75112 727 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 DIRAS1O95057 198 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 NSA2O95478 260 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 ATP1B1P05026 303 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 ALPLP05186 524 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 LYNP07948 512 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 NR2F1P10589 423 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 PORP16435 677 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 HOXD12P35452 270 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 BLMHQ13867 455 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 FAM53BQ14153 422 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 MAPK11Q15759 364 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 HLA-BQ31612 363 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 INAVAQ3KP66 663 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 FAM111BQ6SJ93 734 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 TBPL2Q6SJ96 375 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 CARM1Q86X55 608 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 HIPK1Q86Z02 1210 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 ARMC8Q8IUR7 673 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 DTWD2Q8NBA8 298 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 OR7G2Q8NG99 324 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 OR4C6Q8NH72 309 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 SAP25Q8TEE9 199 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 XAGE5Q8WWM1 108 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 C7orf34Q96L11 122 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 YIPF4Q9BSR8 244 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 RBCK1Q9BYM8 510 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 REEP1Q9H902 201 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 ANKRA2Q9H9E1 313 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 VNN3Q9NY84 501 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 HCN3Q9P1Z3 774 aa9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 FAM227AF5H4B4 570 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 PLOD2O00469 737 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 B4GAT1O43505 415 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 CHST10O43529 356 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 FOXS1O43638 330 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 ASNA1O43681 348 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 SLITRK5O94991 958 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 GPR75O95800 540 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 RNH1P13489 461 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 TNFRSF1BP20333 461 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 CD1CP29017 333 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 SEPHS1P49903 392 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 CHN2P52757 468 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 CRISP3P54108 245 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 HSD11B2P80365 405 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 PPP2R2BQ00005 443 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 CFHR1Q03591 330 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 FUT5Q11128 374 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 GNA13Q14344 377 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 KCNAB1Q14722 419 aa9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.3 ms