RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292579.11

ZNF250-201, Transcript of zinc finger protein 250, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF250, Length 6,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF250-201ENST00000292579 ERVK-18Q9QC07 812 aa8.91□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 LHX3Q9UBR4 397 aa8.91□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 C15orf41Q9Y2V0 281 aa8.91□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 HTR1AP08908 422 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 IL9P15248 144 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 YPEL5P62699 121 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 TRAM2Q15035 370 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 TSC22D1Q15714 1073 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 LRIF1Q5T3J3 769 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 PAQR9Q6ZVX9 377 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 SLCO6A1Q86UG4 719 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 OR5T2Q8NGG2 359 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 OR51Q1Q8NH59 317 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 NEIL2Q969S2 332 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 GPRC5BQ9NZH0 403 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 H3BUI4 141 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 YKT6O15498 198 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 UGT2B7P16662 529 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 ZNF43P17038 809 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 SDC2P34741 201 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 MC3RP41968 323 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 FASLGP48023 281 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 RRADP55042 308 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 DCDP81605 110 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 SERTAD2Q14140 314 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 SLC5A9Q2M3M2 681 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 C6orf136Q5SQH8 315 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 PRAMEF20Q5VT98 475 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 ADNP2Q6IQ32 1131 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 QSOX2Q6ZRP7 698 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 OR52R1Q8NGF1 315 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 APIPQ96GX9 242 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 PGAM5Q96HS1 289 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 CST11Q9H112 138 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 COQ10BQ9H8M1 238 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 ARGFXA6NJG6 315 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 GFRA2O00451 464 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 TNFRSF21O75509 655 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 NADKO95544 446 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 ANXA8P13928 327 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 HK3P52790 923 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 KCNC4Q03721 635 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 SLC18A2Q05940 514 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 CBX3Q13185 183 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 TLDC1Q6P9B6 456 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 BEND4Q6ZU67 534 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 UEVLDQ8IX04 471 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 CLECL1Q8IZS7 167 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 ZADH2Q8N4Q0 377 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 IL17RCQ8NAC3 791 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 SLC12A9Q9BXP2 914 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 KLHL31Q9H511 634 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 USP3Q9Y6I4 520 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF250-201ENST00000292579 CACNG3O60359 315 aa8.9□□□□□ -0.99
ZNF250-201ENST00000292579 BCKDHAP12694 445 aa8.9□□□□□ -0.99
ZNF250-201ENST00000292579 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.99
ZNF250-201ENST00000292579 NPTX1Q15818 432 aa8.9□□□□□ -0.99
ZNF250-201ENST00000292579 BICRALQ6AI39 1079 aa8.9□□□□□ -0.99
ZNF250-201ENST00000292579 COMMD6Q7Z4G1 85 aa8.9□□□□□ -0.99
ZNF250-201ENST00000292579 ZFAND4Q86XD8 727 aa8.9□□□□□ -0.99
ZNF250-201ENST00000292579 OR8S1Q8NH09 359 aa8.9□□□□□ -0.99
ZNF250-201ENST00000292579 SLCO2A1Q92959 643 aa8.9□□□□□ -0.99
ZNF250-201ENST00000292579 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.99
ZNF250-201ENST00000292579 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
ZNF250-201ENST00000292579 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
ZNF250-201ENST00000292579 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.99
ZNF250-201ENST00000292579 A0A1W2PRQ8 180 aa8.9□□□□□ -0.99
ZNF250-201ENST00000292579 UNC119BA6NIH7 251 aa8.9□□□□□ -0.99
ZNF250-201ENST00000292579 PDLIM1O00151 329 aa8.9□□□□□ -0.99
ZNF250-201ENST00000292579 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
ZNF250-201ENST00000292579 ITGA10O75578 1167 aa8.9□□□□□ -0.99
ZNF250-201ENST00000292579 PRKCAP17252 672 aa8.9□□□□□ -0.99
ZNF250-201ENST00000292579 WDR4P57081 412 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
ZNF250-201ENST00000292579 MBTPS1Q14703 1052 aa8.9□□□□□ -0.99
ZNF250-201ENST00000292579 ZNF77Q15935 545 aa8.9□□□□□ -0.99
ZNF250-201ENST00000292579 EPGNQ6UW88 154 aa8.9□□□□□ -0.99
ZNF250-201ENST00000292579 B3GNT9Q6UX72 402 aa8.9□□□□□ -0.99
ZNF250-201ENST00000292579 IL17CQ9P0M4 197 aa8.9□□□□□ -0.99
ZNF250-201ENST00000292579 PCDHB10Q9UN67 800 aa8.9□□□□□ -0.99
ZNF250-201ENST00000292579 ANHXE9PGG2 379 aa8.89□□□□□ -0.99
ZNF250-201ENST00000292579 MT-ND5P03915 603 aa8.89□□□□□ -0.99
ZNF250-201ENST00000292579 SLC35E2BP0CK96 405 aa8.89□□□□□ -0.99
ZNF250-201ENST00000292579 TGFBR2P37173 567 aa8.89□□□□□ -0.99
ZNF250-201ENST00000292579 FAM189BP81408 668 aa8.89□□□□□ -0.99
ZNF250-201ENST00000292579 OR2T5Q6IEZ7 315 aa8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms