RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 MTNR1AP48039 350 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 EPHB3P54753 998 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 FAAH2Q6GMR7 532 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 ZNF767PQ75MW2 155 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 COMMD7Q86VX2 200 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 TOMM5Q8N4H5 51 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 OR8J2Q8NGG1 315 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 HMGB4Q8WW32 186 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 ARSGQ96EG1 525 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 FAM170BA6NMN3 283 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 POM121CA8CG34 1229 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 MID1O15344 667 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 PRKYO43930 277 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 HLA-DPB1P04440 258 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 SYPP08247 313 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 CBSLP0DN79 551 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 ATF6P18850 670 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 DNASE1P24855 282 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 CBSP35520 551 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 ETV5P41161 510 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 ETV1P50549 477 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 Q5BKY6 102 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 ZNF697Q5TEC3 545 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 PLCZ1Q86YW0 608 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 ASB11Q8WXH4 323 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 PLD4Q96BZ4 506 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 SLC22A12Q96S37 553 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 SLC23A1Q9UHI7 598 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 MYLKQ15746 1914 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 RFXAPO00287 272 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 KDM4BO94953 1096 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 CD3GP09693 182 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 ELFN1P0C7U0 828 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 PDHA2P29803 388 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 SSR2P43308 183 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 TBPL1P62380 186 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 C9orf64Q5T6V5 341 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 GALNT11Q8NCW6 608 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 OR52E4Q8NGH9 312 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 RAD51AP1Q96B01 352 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 NARFLQ9H6Q4 476 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 BTNL2Q9UIR0 455 aa14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 LCTP09848 1927 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 HRGP04196 525 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 RB1P06400 928 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 HBQ1P09105 142 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 GZMKP49863 264 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 TRPV1Q8NER1 839 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 TM9SF4Q92544 642 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 RFT1Q96AA3 541 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 SLC6A16Q9GZN6 736 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 OR2AG1Q9H205 316 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 EVA1BQ9NVM1 165 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 KLHL28Q9NXS3 571 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 HYKKA2RU49 373 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 ALDH1A1P00352 501 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 ADAP00813 363 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 IL1RNP18510 177 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 CD70P32970 193 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 ACVR1BP36896 505 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 RPL3P39023 403 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 GZMMP51124 257 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 WNT3P56703 355 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 HDDC2Q7Z4H3 204 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 TMEM145Q8NBT3 493 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 GALNT6Q8NCL4 622 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 BBS10Q8TAM1 723 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 RDH14Q9HBH5 336 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 STOML2Q9UJZ1 356 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 SOX18P35713 384 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 CHRNEQ04844 493 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 HOMEZQ8IX15 550 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 MEIOBQ8N635 442 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 PROKR2Q8NFJ6 384 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 PKMYT1Q99640 499 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 SPG21Q9NZD8 308 aa14.53□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 CENPAP49450 140 aa14.52□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 SRP9P49458 86 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 RHAGQ02094 409 aa14.52□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 C6orf120Q7Z4R8 191 aa14.52□□□□□ -0.08
USP25-201ENST00000285679 DCAF4L2Q8NA75 395 aa14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms