RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280154.11

PDCD4-201, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDCD4, Length 3,602 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-201ENST00000280154 SULT1C2O00338 296 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 SLC22A1O15245 554 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 LANCL1O43813 399 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 ELFN1P0C7U0 828 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 SRFP11831 508 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 TNFRSF1AP19438 455 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 ARL4AP40617 200 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 TPI1P60174 286 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 CXCR4P61073 352 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 GNA12Q03113 381 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 NME3Q13232 169 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 IHHQ14623 411 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 YIF1BQ5BJH7 314 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 GPR157Q5UAW9 335 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 TPGS1Q6ZTW0 290 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 TRAM1L1Q8N609 369 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 SIRT6Q8N6T7 355 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 PLA2G15Q8NCC3 412 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 ARRDC2Q8TBH0 407 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 PYDC1Q8WXC3 89 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 TMEM45BQ96B21 275 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 FCRL5Q96RD9 977 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 MAGT1Q9H0U3 335 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 MKLN1Q9UL63 735 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 ZNF716A6NP11 495 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 CDH16O75309 829 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 CRCPO75575 148 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 ZNF735P0CB33 412 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 ITIH1P19827 911 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 AOAHP28039 575 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 CD68P34810 354 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 AVPR1AP37288 418 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 ACTR1BP42025 376 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 CDK16Q00536 496 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 AGERQ15109 404 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 DLG2Q15700 870 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 FAM83EQ2M2I3 478 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 TYSND1Q2T9J0 566 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 ASPHD2Q6ICH7 369 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 DCDC5Q6ZRR9 648 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 SYT13Q7L8C5 426 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 TRABD2AQ86V40 505 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 VRK2Q86Y07 508 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 SLC44A3Q8N4M1 653 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 IL17RCQ8NAC3 791 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 SPPL2AQ8TCT8 520 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 NKD1Q969G9 470 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 MS4A14Q96JA4 679 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 LYSMD1Q96S90 227 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 OR51V1Q9H2C8 321 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa8.99□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 XIRP2A4UGR9 3374 aa8.98□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa8.98□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 CST8O60676 142 aa8.98□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 NADKO95544 446 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 IFNA6P05013 189 aa8.98□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 CALCBP10092 127 aa8.98□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 CD72P21854 359 aa8.98□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 LAP3P28838 519 aa8.98□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 SSTR2P30874 369 aa8.98□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 SERPINF1P36955 418 aa8.98□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 KIR3DL2P43630 455 aa8.98□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 PRSS53Q2L4Q9 553 aa8.98□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa8.98□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 CYB561A3Q8NBI2 242 aa8.98□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 ART4Q93070 314 aa8.98□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 HARBI1Q96MB7 349 aa8.98□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 TBX5Q99593 518 aa8.98□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 SNX10Q9Y5X0 201 aa8.98□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 SAC3D1A6NKF1 404 aa8.98□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 UGDHO60701 494 aa8.98□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 STX11O75558 287 aa8.98□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 C9P02748 559 aa8.98□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 RBP1P09455 135 aa8.98□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 ADH5P11766 374 aa8.98□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 FPR3P25089 353 aa8.98□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 RAG2P55895 527 aa8.98□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 GPLD1P80108 840 aa8.98□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 RUNX3Q13761 415 aa8.98□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 CDKN3Q16667 212 aa8.98□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 KCNIP4Q6PIL6 250 aa8.98□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 ZNF534Q76KX8 674 aa8.98□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 Q7L0L9 218 aa8.98□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PDCD4-201ENST00000280154 VWA5B2Q8N398 1253 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms