RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRDM9Q9NQV7 894 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ENTPD4Q9Y227 616 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AP4S1Q9Y587 144 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FER1L5A0AVI2 2057 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 A0A1B0GX78 115 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DHRS12A0PJE2 317 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GLOD5A6NK44 160 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CXCR6O00574 342 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DSCR3O14972 297 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RDH16O75452 317 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 STK17BO94768 372 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRT75O95678 551 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UMPSP11172 480 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARSFP54793 590 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM53BQ14153 422 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RGNQ15493 299 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SYT16Q17RD7 645 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PQLC1Q8N2U9 271 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OR52E4Q8NGH9 312 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OR52N2Q8NGI0 321 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PSMA8Q8TAA3 256 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FIG4Q92562 907 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLCO4A1Q96BD0 722 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BBS4Q96RK4 519 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EFHD1Q9BUP0 239 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CHST8Q9H2A9 424 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GIMAP4Q9NUV9 329 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PSME2Q9UL46 239 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SRPK3Q9UPE1 567 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPACA6W5XKT8 324 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ASPMQ8IZT6 3477 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRABD2BA6NFA1 517 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MYO1GB0I1T2 1018 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC5A2P31639 672 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EMP3P54852 163 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMEM164Q5U3C3 297 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LCN10Q6JVE6 187 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZZZ3Q8IYH5 903 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GALNT6Q8NCL4 622 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CANT1Q8WVQ1 401 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AMDHD1Q96NU7 426 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GLIPR2Q9H4G4 154 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HCN3Q9P1Z3 774 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AK5Q9Y6K8 562 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RORAP35398 523 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 VHLP40337 213 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MVDP53602 400 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SKP1P63208 163 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 VAC14Q08AM6 782 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HSPB3Q12988 150 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FADDQ13158 208 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CEBPEQ15744 281 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 VMACQ2NL98 169 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OR52E8Q6IFG1 317 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NIPAL1Q6NVV3 410 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADGRG5Q8IZF4 528 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NRG4Q8WWG1 115 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZPBPQ9BS86 351 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EPS8L2Q9H6S3 715 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARMC1Q9NVT9 282 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ACSL6Q9UKU0 697 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SDK2Q58EX2 2172 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 WASHC1A8K0Z3 465 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NSA2O95478 260 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CDK9P50750 372 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP19.11■□□□□ 0.657e-12■■□□□ 13.7
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PTOV1Q86YD1 416 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OR5AK3PQ8NH89 298 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM162AQ96A26 154 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPRY4Q9C004 299 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NRSN2Q9GZP1 204 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ASCL3Q9NQ33 180 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC22A11Q9NSA0 550 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SNX8Q9Y5X2 465 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MEN1O00255 615 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BRINP1O60477 761 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CREG1O75629 220 aa19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms