RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 HSPB11Q9Y547 144 aa16.78■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 A0A0G2JPF8 293 aa16.78■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 C7orf72A4D263 438 aa16.78■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa16.78■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 S100A9P06702 114 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa16.78■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 AOAHP28039 575 aa16.78■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 MTNR1AP48039 350 aa16.78■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 PGBD2Q6P3X8 592 aa16.78■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa16.78■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 OR9Q2Q8NGE9 314 aa16.78■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 THRSPQ92748 146 aa16.78■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 HSPA12BQ96MM6 686 aa16.78■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 TTYH2Q9BSA4 534 aa16.78■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 RBCK1Q9BYM8 510 aa16.78■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 RMI1Q9H9A7 625 aa16.78■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 C5AR2Q9P296 337 aa16.78■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 OR6C74A6NCV1 312 aa16.78■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 IFNA7P01567 189 aa16.78■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 C5AR1P21730 350 aa16.78■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 PYCR1P32322 319 aa16.78■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 ACTC1P68032 377 aa16.78■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 ACTA1P68133 377 aa16.78■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 ARFRP1Q13795 201 aa16.78■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 SEC23BQ15437 767 aa16.78■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 FAM180BQ6P0A1 224 aa16.78■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 GKN2Q86XP6 184 aa16.78■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 LILRA2Q8N149 483 aa16.78■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 KLHDC9Q8NEP7 349 aa16.78■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 OR5AR1Q8NGP9 310 aa16.78■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 SAMD11Q96NU1 681 aa16.78■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 CST11Q9H112 138 aa16.78■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 KCNJ13O60928 360 aa16.77■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 AK1P00568 194 aa16.77■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 TRAM1Q15629 374 aa16.77■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 JAGN1Q8N5M9 183 aa16.77■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 OR2L5Q8NG80 312 aa16.77■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 HS6ST2Q96MM7 605 aa16.77■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 DMRT3Q9NQL9 472 aa16.77■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 UCKL1Q9NWZ5 548 aa16.77■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 OR1A2Q9Y585 309 aa16.77■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 CEPT1Q9Y6K0 416 aa16.77■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 SLC22A31A6NKX4 558 aa16.77■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 TNFRSF10BO14763 440 aa16.77■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 PORP16435 677 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 LMX1AQ8TE12 382 aa16.77■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 G6PC3Q9BUM1 346 aa16.77■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 SLC46A2Q9BY10 475 aa16.77■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 TTTY10Q9BZA0 68 aa16.77■□□□□ 0.28
SCARB2-201ENST00000264896 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa16.77■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 ADAMTS4O75173 837 aa16.77■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 GNSP15586 552 aa16.77■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 GK3PQ14409 553 aa16.77■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 TBRG1Q3YBR2 411 aa16.77■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 LIPIQ6XZB0 460 aa16.77■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 ARMC10Q8N2F6 343 aa16.77■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 GATAD2BQ8WXI9 593 aa16.77■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 NSMAFQ92636 917 aa16.77■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 LAMP5Q9UJQ1 280 aa16.77■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 METTL21EPA6NDL7 271 aa16.77■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 GABRR3A8MPY1 467 aa16.77■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 PPM1BO75688 479 aa16.77■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 MAGEA12P43365 314 aa16.77■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 MAP2K3P46734 347 aa16.77■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 SLC7A9P82251 487 aa16.77■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 MLIPQ5VWP3 458 aa16.77■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 Q8N402 240 aa16.77■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 SLC44A3Q8N4M1 653 aa16.77■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 RFT1Q96AA3 541 aa16.77■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 HSFX1Q9UBD0 423 aa16.77■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa16.77■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 LRRN3E7EW58 273 aa16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 CTSCP53634 463 aa16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF234Q14588 700 aa16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 SLC17A9Q9BYT1 436 aa16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 LRRN3Q9H3W5 708 aa16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 BAIAP2Q9UQB8 552 aa16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 GJA8P48165 433 aa16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 DPPA4Q7L190 304 aa16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 PAQR7Q86WK9 346 aa16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 C12orf40Q86WS4 652 aa16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 SUN5Q8TC36 379 aa16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 FAIMQ9NVQ4 179 aa16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 HCSTQ9UBK5 93 aa16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 CPED1A4D0V7 1026 aa16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 JRKO75564 520 aa16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 MAZP56270 477 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 GRIN2CQ14957 1233 aa16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms