RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 MILR1Q7Z6M3 343 aa14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 CEP112Q8N8E3 955 aa14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 UCN3Q969E3 161 aa14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 GAL3ST3Q96A11 431 aa14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 PYCR2Q96C36 320 aa14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 GNRHR2Q96P88 292 aa14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM204Q9BSN7 226 aa14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 SHARPINQ9H0F6 387 aa14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 PLAC1Q9HBJ0 212 aa14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 FETUBQ9UGM5 382 aa14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 H0Y3Z8 333 aa14.88□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 CTNSO60931 367 aa14.88□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 BANF1O75531 89 aa14.88□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 ACTL6AO96019 429 aa14.88□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 IGHV4-39P01824 125 aa14.88□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 IGKV3-11P04433 115 aa14.88□□□□□ -0.03
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SPCS1-201ENST00000233025 THBDP07204 575 aa14.88□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 POU2F1P14859 743 aa14.88□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 PGAM1P18669 254 aa14.88□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 CDKN2DP55273 166 aa14.88□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 SP140Q13342 867 aa14.88□□□□□ -0.03
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SPCS1-201ENST00000233025 VWA1Q6PCB0 445 aa14.88□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 PPIL6Q8IXY8 311 aa14.88□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 OR56A3Q8NH54 315 aa14.88□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa14.88□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 DIO2Q92813 273 aa14.88□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 NEIL2Q969S2 332 aa14.88□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 RILPQ96NA2 401 aa14.88□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 ELOVL5Q9NYP7 299 aa14.88□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 SLC17A6Q9P2U8 582 aa14.88□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 DTX4Q9Y2E6 619 aa14.88□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 FRG2CA6NGY1 282 aa14.87□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 C16orf97H3BN30 126 aa14.87□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 C8GP07360 202 aa14.87□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 EGR1P18146 543 aa14.87□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 SRD5A1P18405 259 aa14.87□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 SERPINB3P29508 390 aa14.87□□□□□ -0.03
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SPCS1-201ENST00000233025 CASP9P55211 416 aa14.87□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 MSS51Q4VC12 460 aa14.87□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 PAQR3Q6TCH7 311 aa14.87□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 CNTN4Q8IWV2 1026 aa14.87□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 ACTRT1Q8TDG2 376 aa14.87□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 SLC5A11Q8WWX8 675 aa14.87□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 CTHRC1Q96CG8 243 aa14.87□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 OSBPL9Q96SU4 736 aa14.87□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 PARVBQ9HBI1 364 aa14.87□□□□□ -0.03
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SPCS1-201ENST00000233025 SOD3P08294 240 aa14.86□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 TNNI3P19429 210 aa14.86□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 SAT1P21673 171 aa14.86□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 CHMP24386 653 aa14.86□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 PTPN6P29350 595 aa14.86□□□□□ -0.03
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SPCS1-201ENST00000233025 CDKN1AP38936 164 aa14.86□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 SLC6A12P48065 614 aa14.86□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 RGS4P49798 205 aa14.86□□□□□ -0.03
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SPCS1-201ENST00000233025 LIM2P55344 173 aa14.86□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 VLDLRP98155 873 aa14.86□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
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SPCS1-201ENST00000233025 UGT3A1Q6NUS8 523 aa14.86□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 IGDCC3Q8IVU1 814 aa14.86□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa14.86□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 GRK7Q8WTQ7 553 aa14.86□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 ATL1Q8WXF7 558 aa14.86□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 MS4A6EQ96DS6 147 aa14.86□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 LINGO1Q96FE5 620 aa14.86□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 FAR2Q96K12 515 aa14.86□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 TAS2R13Q9NYV9 303 aa14.86□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 DAPP1Q9UN19 280 aa14.86□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 MAPRE3Q9UPY8 281 aa14.86□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 SAR1BQ9Y6B6 198 aa14.86□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 ERI3O43414 337 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 B3GALT2O43825 422 aa14.85□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 LDB3O75112 727 aa14.85□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 SNX4O95219 450 aa14.85□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 AHSGP02765 367 aa14.85□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 DANCRP0C864 163 aa14.85□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 MASP1P48740 699 aa14.85□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 SRYQ05066 204 aa14.85□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 SERTAD2Q14140 314 aa14.85□□□□□ -0.03
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