RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000040877.1

TARBP1-201, Transcript of TAR (HIV-1) RNA binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TARBP1, Length 5,130 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP1-201ENST00000040877 C6orf183Q5T699 404 aa22.09■■□□□ 1.13
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TARBP1-201ENST00000040877 SARDHQ9UL12 918 aa22.09■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 TSPAN4O14817 238 aa22.09■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 ADAP00813 363 aa22.09■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 DPP6P42658 865 aa22.09■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 IST1P53990 364 aa22.09■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 TMBIM6P55061 237 aa22.09■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa22.09■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 GATSQ8NAP1 163 aa22.09■■□□□ 1.13
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TARBP1-201ENST00000040877 OR2L8Q8NGY9 312 aa22.09■■□□□ 1.13
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TARBP1-201ENST00000040877 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
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TARBP1-201ENST00000040877 SPEF1Q9Y4P9 236 aa22.08■■□□□ 1.13
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TARBP1-201ENST00000040877 A0A0G2JNG1 304 aa22.08■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa22.08■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 SOBPA7XYQ1 873 aa22.08■■□□□ 1.13
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TARBP1-201ENST00000040877 KIR2DS3K7RE56 304 aa22.08■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 SPARCP09486 303 aa22.08■■□□□ 1.13
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TARBP1-201ENST00000040877 KIR2DS5Q14953 304 aa22.08■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 ULK3Q6PHR2 472 aa22.08■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 DHRS1Q96LJ7 313 aa22.08■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
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TARBP1-201ENST00000040877 SLC9A3P48764 834 aa22.08■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa22.08■■□□□ 1.13
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TARBP1-201ENST00000040877 TPSD1Q9BZJ3 242 aa22.08■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 HCN2Q9UL51 889 aa22.08■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 VSTM2BA6NLU5 285 aa22.08■■□□□ 1.12
TARBP1-201ENST00000040877 GPR37L1O60883 481 aa22.08■■□□□ 1.12
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TARBP1-201ENST00000040877 SNAP29O95721 258 aa22.08■■□□□ 1.12
TARBP1-201ENST00000040877 H2BFMP0C1H6 154 aa22.08■■□□□ 1.12
TARBP1-201ENST00000040877 GNG2P59768 71 aa22.08■■□□□ 1.12
TARBP1-201ENST00000040877 ACTA2P62736 377 aa22.08■■□□□ 1.12
TARBP1-201ENST00000040877 ACTG2P63267 376 aa22.08■■□□□ 1.12
TARBP1-201ENST00000040877 DSC1Q08554 894 aa22.08■■□□□ 1.12
TARBP1-201ENST00000040877 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa22.08■■□□□ 1.12
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TARBP1-201ENST00000040877 DISC1C4P0D8 188 aa22.07■■□□□ 1.12
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TARBP1-201ENST00000040877 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa22.07■■□□□ 1.12
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TARBP1-201ENST00000040877 ZMYND11Q15326 602 aa22.07■■□□□ 1.12
TARBP1-201ENST00000040877 LRIT3Q3SXY7 679 aa22.07■■□□□ 1.12
TARBP1-201ENST00000040877 ZNF565Q8N9K5 539 aa22.07■■□□□ 1.12
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TARBP1-201ENST00000040877 OR51A7Q8NH64 312 aa22.07■■□□□ 1.12
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TARBP1-201ENST00000040877 C11orf98E9PRG8 122 aa22.07■■□□□ 1.12
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TARBP1-201ENST00000040877 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
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TARBP1-201ENST00000040877 ZBTB42B2RXF5 422 aa22.06■■□□□ 1.12
TARBP1-201ENST00000040877 PHYHO14832 338 aa22.06■■□□□ 1.12
TARBP1-201ENST00000040877 IL1RNP18510 177 aa22.06■■□□□ 1.12
TARBP1-201ENST00000040877 ATF6P18850 670 aa22.06■■□□□ 1.12
TARBP1-201ENST00000040877 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
TARBP1-201ENST00000040877 ZNF613Q6PF04 617 aa22.06■■□□□ 1.12
TARBP1-201ENST00000040877 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa22.06■■□□□ 1.12
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TARBP1-201ENST00000040877 EDN1P05305 212 aa22.06■■□□□ 1.12
TARBP1-201ENST00000040877 RPS17P08708 135 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TARBP1-201ENST00000040877 DHRS4L1P0CG22 281 aa22.06■■□□□ 1.12
TARBP1-201ENST00000040877 MFSD13AQ14CX5 517 aa22.06■■□□□ 1.12
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TARBP1-201ENST00000040877 ANKDD1AQ495B1 522 aa22.06■■□□□ 1.12
TARBP1-201ENST00000040877 GXYLT1Q4G148 440 aa22.06■■□□□ 1.12
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