RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn1r87Q8R255 295 aa16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vsx1Q91V10 363 aa16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dus3lQ91XI1 637 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tcf19Q99KJ5 263 aa16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mrps33Q9D2R8 106 aa16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slco2a1Q9EPT5 643 aa16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Acox1Q9R0H0 661 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trbv20A0A0B4J1H5 111 aa16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr59B1ARL3 323 aa16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm17174M0QWQ9 212 aa16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp28P10078 825 aa16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sox6P40645 827 aa16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 VaspP70460 375 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Il12rb2P97378 874 aa16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmem38aQ3TMP8 298 aa16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sec24aQ3U2P1 1090 aa16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 StimateQ3UF25 288 aa16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kbtbd8Q3UQV5 599 aa16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ostf1Q62422 215 aa16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 EngQ63961 653 aa16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Elfn2Q68FM6 823 aa16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr744Q7TRM0 323 aa16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Crb2Q80YA8 1282 aa16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 4933430I17RikQ8BHW4 495 aa16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Znf786Q8BV42 777 aa16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PxkQ8BX57 582 aa16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mlc1Q8VHK5 382 aa16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cyp4f15Q99N18 534 aa16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Maf1Q9D0U6 258 aa16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp472B0V2W5 534 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr544E9PX47 334 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr171G5E8J1 314 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp934K7N6H3 473 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc7a2P18581 657 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pcyt1aP49586 367 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 TstP52196 297 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ArntP53762 791 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adamts19P59509 1210 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rapgefl1Q68EF8 662 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gpr62Q80UC6 358 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Elp6Q8BK75 266 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sall4Q8BX22 1067 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lcmt2Q8BYR1 686 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc22a12Q8CFZ5 553 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cyp51a1Q8K0C4 503 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SuoxQ8R086 546 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 FbrsQ8R089 466 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q8R3C1 574 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ak6Q8VCP8 172 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc92Q8VDN4 314 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Snx4Q91YJ2 450 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hspa14Q99M31 509 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SrpraQ9DBG7 636 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ropn1lQ9EQ00 218 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ntn4Q9JI33 628 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prss16Q9QXE5 509 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cfap77A0A087WRI3 283 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prr36E9PV26 1098 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1513L7N457 313 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Clk4O35493 481 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Clcn7O70496 803 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tp63O88898 680 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hoxd10P28359 340 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Polr1cP52432 346 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 TepsinQ3U3N6 573 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Elavl4Q61701 385 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 GkQ64516 559 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ShbQ6PD21 503 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CebpeQ6PZD9 281 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 FkrpQ8CG64 494 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr166Q8VGX2 312 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cox4i2Q91W29 172 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pex16Q91XC9 336 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tram2Q924Z5 370 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam32aQ9CR80 112 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2010005H15RikQ9D8D6 97 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atp5oQ9DB20 213 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kcnj10Q9JM63 379 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp40B1B1D3 796 aa16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm5478D3Z6R0 159 aa16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kcnmb3E9Q7U0 239 aa16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prss56F2YMG0 604 aa16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1249L7MU51 318 aa16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fmo1P50285 532 aa16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Runx3Q64131 409 aa16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Znf513Q6PD29 541 aa16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 GnptgQ6S5C2 307 aa16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ffar1Q76JU9 300 aa16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cmtr2Q8BWQ4 767 aa16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tgm4Q8BZH1 670 aa16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam155aQ8CCS2 467 aa16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmem106aQ8VC04 261 aa16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dusp7Q91Z46 422 aa16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NrarpQ91ZA8 114 aa16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lrch4Q921G6 680 aa16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ttc9bQ9D6E4 239 aa16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cdrt4Q9DA64 179 aa16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Emc7Q9EP72 241 aa16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nek6Q9ES70 313 aa16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PalmdQ9JHU2 551 aa16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.8 ms