RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640888.1

LIAS-222, Transcript of lipoic acid synthetase, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIAS, Length 4,041 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LIAS-222	ENST00000640888	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	SNX21	Q969T3	373 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	GORAB	Q5T7V8	394 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	FSD1	Q9BTV5	496 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	GSE1	Q14687	1217 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	POLA2	Q14181	598 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	CHML	P26374	656 aa		11.83	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		11.83	□□□□□ -0.51
LIAS-222	ENST00000640888	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	AOX1	Q06278	1338 aa		11.82	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		11.82	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	11.82	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	11.82	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	IGKV5-2	P06315	115 aa		11.82	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		11.82	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	11.82	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	STAP2	Q9UGK3	403 aa		11.82	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	PDIA6	Q15084	440 aa		11.82	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	11.82	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		11.81	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		11.81	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		11.81	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		11.81	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	11.81	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	11.81	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		11.81	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	11.81	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	11.81	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	USP54	Q70EL1	1684 aa		11.81	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	11.81	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	HIP1	O00291	1037 aa		11.8	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	11.8	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		11.8	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		11.8	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	ERBB4	Q15303	1308 aa		11.8	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	MCM4	P33991	863 aa		11.8	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	LRRC37A3	O60309	1634 aa		11.79	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	GPT	P24298	496 aa		11.79	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	MTX1	Q13505	466 aa		11.79	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	EVI5L	Q96CN4	794 aa		11.79	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		11.79	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	11.79	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	MCM2	P49736	904 aa		11.79	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	TOM1	O60784	492 aa		11.79	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	NUCB2	P80303	420 aa		11.79	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	FAM177B	A6PVY3	158 aa		11.78	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	FGD1	P98174	961 aa		11.78	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	DDB1	Q16531	1140 aa		11.78	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		11.78	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	TFCP2	Q12800	502 aa		11.77	□□□□□ -0.52
LIAS-222	ENST00000640888	PTMS	P20962	102 aa		11.77	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		11.77	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		11.77	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	PIGB	Q92521	554 aa		11.77	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		11.77	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	NBPF26	B4DH59	902 aa		11.76	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	NBPF14	Q5TI25	921 aa		11.76	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	RNF20	Q5VTR2	975 aa		11.76	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	NBPF15	Q8N660	670 aa		11.76	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		11.76	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		11.76	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		11.76	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	KIF2C	Q99661	725 aa		11.76	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	ALS2	Q96Q42	1657 aa		11.76	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		11.76	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	TRAK2	O60296	914 aa		11.76	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	NGLY1	Q96IV0	654 aa		11.76	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		11.75	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	ANAPC15	P60006	121 aa		11.75	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		11.75	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	SGSM2	O43147	1006 aa		11.75	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		11.75	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	RGPD5	Q99666	1765 aa		11.75	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	CACNA1F	O60840	1977 aa		11.75	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	NPHP1	O15259	732 aa		11.75	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	SASH1	O94885	1247 aa		11.75	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	SSFA2	P28290	1259 aa		11.75	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		11.75	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	TNNI3K	Q59H18	835 aa		11.74	□□□□□ -0.53
LIAS-222	ENST00000640888	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53

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