RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 IQGAP3Q86VI3 1631 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 CLASP1Q7Z460 1538 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 IP6K1Q92551 441 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 CHPF2Q9P2E5 772 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 TTC41PQ6P2S7 1318 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 HOXC9P31274 260 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 ATP2B2Q01814 1243 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 WWC2Q6AWC2 1192 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 CAGE1Q8TC20 777 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 MLH3Q9UHC1 1453 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC152Q4G0S7 254 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 IQCA1Q86XH1 822 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 RHPN1Q8TCX5 695 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 ODF2Q5BJF6 829 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 SLC12A7Q9Y666 1083 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 DCAF8L1A6NGE4 600 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 GSTO1P78417 241 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 TBC1D2Q9BYX2 928 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 ABCF2Q9UG63 623 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 SYCP1Q15431 976 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC178Q5BJE1 867 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 PTPRTO14522 1441 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 LDHCP07864 332 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 KIF24Q5T7B8 1368 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 GRM8O00222 908 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 C8orf76Q96K31 380 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 EFCAB6Q5THR3 1501 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 HOXB7P09629 217 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 PDE4CQ08493 712 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 C8orf58Q8NAV2 365 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 DCAF5Q96JK2 942 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 ZBTB3Q9H5J0 574 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 IL2RBP14784 551 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 HSP90B2PQ58FF3 399 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 MKNK2Q9HBH9 465 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 ANO10Q9NW15 660 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 VAMP4O75379 141 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 ADAMTS2O95450 1211 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 STK11IPQ8N1F8 1099 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 CATIPQ7Z7H3 387 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 NGLY1Q96IV0 654 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 KDM6BO15054 1643 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM2Q9UHN6 1383 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 IL15P40933 162 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 ST5P78524 1137 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 NCOA7Q8NI08 942 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 SNX21Q969T3 373 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 EHMT1Q9H9B1 1298 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 GOLGA8AA7E2F4 631 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 GOLGA8BA8MQT2 603 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 NEK1Q96PY6 1258 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 FAM135BQ49AJ0 1406 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 IL13P35225 146 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 PDE1AP54750 535 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 DDX11Q96FC9 970 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 ATP7BP35670 1465 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 GOLIM4O00461 696 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 RNMTO43148 476 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 BAG3O95817 575 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 KIF5BP33176 963 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 TNIP1Q15025 636 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 XAGE3Q8WTP9 111 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 MEIS3Q99687 375 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 NYXQ9GZU5 481 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 UNC13BO14795 1591 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 TOM1O60784 492 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-228ENST00000636120 IQCEQ6IPM2 695 aa7.53□□□□□ -1.2
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