RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000631199.2

CNTNAP2-208, Transcript of contactin associated protein like 2, human

TSL 3

Gene CNTNAP2, Length 650 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNTNAP2-208	ENST00000631199	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	SLX4	Q8IY92	1834 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	STYK1	Q6J9G0	422 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	SCN4A	P35499	1836 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	NFKBIE	O00221	500 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	CAPN15	O75808	1086 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	TNS4	Q8IZW8	715 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	JMY	Q8N9B5	988 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	FAM177B	A6PVY3	158 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	CAMTA2	O94983	1202 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	CCDC93	Q567U6	631 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	MCM10	Q7L590	875 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	10.06	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	SRGN	P10124	158 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	NPR1	P16066	1061 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	ALDH1B1	P30837	517 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	CHADL	Q6NUI6	762 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	NGEF	Q8N5V2	710 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	JDP2	Q8WYK2	163 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	AIDA	Q96BJ3	306 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	NYX	Q9GZU5	481 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	USP16	Q9Y5T5	823 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	NUP98	P52948	1817 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	PCNT	O95613	3336 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	KCNQ3	O43525	872 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	CREBZF	Q9NS37	354 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CNTNAP2-208	ENST00000631199	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	PPP2R1A	P30153	589 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	PRELP	P51888	382 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	10.02	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	LDHD	Q86WU2	507 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	RGL2	O15211	777 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	DCTN1	Q14203	1278 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	HACL1	Q9UJ83	578 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		10	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		10	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	MYL6B	P14649	208 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	EPHX2	P34913	555 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	SYNE4	Q8N205	404 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	POTEC	B2RU33	542 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	NBPF26	B4DH59	902 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	GPT	P24298	496 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	HLF	Q16534	295 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	GPC2	Q8N158	579 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	NBPF15	Q8N660	670 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CNTNAP2-208	ENST00000631199	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		9.97	□□□□□ -0.81

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