RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628263.2

PCBP1-AS1-324, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 755 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 CCDC24Q8N4L8 307 aa11.32□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 CCDC82Q8N4S0 544 aa11.32□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa11.32□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa11.32□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 PHLPP1O60346 1717 aa11.32□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 NSD2O96028 1365 aa11.31□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 MSH6P52701 1360 aa11.31□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 S1PR4O95977 384 aa11.31□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 WAPLQ7Z5K2 1190 aa11.31□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 CDK19Q9BWU1 502 aa11.31□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 PTCH1Q13635 1447 aa11.31□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 ROBO2Q9HCK4 1378 aa11.3□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 PPP2R1AP30153 589 aa11.3□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 PNMA1Q8ND90 353 aa11.3□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 EVA1BQ9NVM1 165 aa11.3□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 ATP7BP35670 1465 aa11.3□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 CGNL1Q0VF96 1302 aa11.3□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 ZBED9Q6R2W3 1325 aa11.3□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 KCNH2Q12809 1159 aa11.29□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 TERF2IPQ9NYB0 399 aa11.29□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 CD163L1Q9NR16 1453 aa11.29□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 A0A1W2PP64 1363 aa11.28□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 WASLO00401 505 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 WASHC4Q2M389 1173 aa11.28□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 PLSCR2Q9NRY7 297 aa11.28□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 FKBPLQ9UIM3 349 aa11.28□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 NHSL1Q5SYE7 1610 aa11.27□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 KCNC4Q03721 635 aa11.27□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 GLMNQ92990 594 aa11.27□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 SLAIN2Q9P270 581 aa11.27□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 C19orf44Q9H6X5 657 aa11.26□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 DCCP43146 1447 aa11.26□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 MST1RQ04912 1400 aa11.26□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa11.26□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 ILDR2Q71H61 639 aa11.25□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa11.25□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa11.24□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa11.24□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 MORC1Q86VD1 984 aa11.24□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 UNC93B1Q9H1C4 597 aa11.24□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa11.24□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa11.23□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 CABP1Q9NZU7 370 aa11.23□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 SHPRHQ149N8 1683 aa11.23□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 KIF20BQ96Q89 1820 aa11.23□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 FBXO45P0C2W1 286 aa11.22□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 ATF3P18847 181 aa11.22□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa11.22□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 AKAP12Q02952 1782 aa11.21□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 MON2Q7Z3U7 1717 aa11.21□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 FMN2Q9NZ56 1722 aa11.21□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 PRR36Q9H6K5 1346 aa11.21□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 ZBBXA8MT70 800 aa11.21□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 MMRN1Q13201 1228 aa11.21□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 ARMC2Q8NEN0 867 aa11.21□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 SERPINA10Q9UK55 444 aa11.21□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 ITSN1Q15811 1721 aa11.21□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 NR1H3Q13133 447 aa11.2□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP11.2□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 NBPF14Q5TI25 921 aa11.2□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 BRINP3Q76B58 766 aa11.2□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 ARXQ96QS3 562 aa11.2□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 ANKARQ7Z5J8 1434 aa11.19□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 FYB1O15117 783 aa11.19□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 C1orf167Q5SNV9 1468 aa11.19□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 ADAMTS8Q9UP79 889 aa11.18□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 NRKQ7Z2Y5 1582 aa11.17□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 RNF223E7ERA6 249 aa11.17□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 SEMA3FQ13275 785 aa11.17□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 LINC01559Q495D7 138 aa11.17□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 PDXDC2PQ6P474 469 aa11.17□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 ALG2Q9H553 416 aa11.17□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 LRP6O75581 1613 aa11.17□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 PTK2Q05397 1052 aa11.16□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 HOMEZQ8IX15 550 aa11.16□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 BAP1Q92560 729 aa11.16□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP11.16□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 CFAP53Q96M91 514 aa11.16□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 GGNBP2Q9H3C7 697 aa11.16□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 JCADQ9P266 1359 aa11.16□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-324ENST00000628263 SOX11P35716 441 aa11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 229.7 ms