RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623333.1

AP000997.3-201, humanhuman

BASIC

Gene AP000997.3, Length 2,250 nt, Biotype TEC.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP000997.3-201ENST00000623333 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
AP000997.3-201ENST00000623333 ATP8B2P98198 1209 aa22.53■■□□□ 1.2
AP000997.3-201ENST00000623333 COPS6Q7L5N1 327 aa22.53■■□□□ 1.2
AP000997.3-201ENST00000623333 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.53■■□□□ 1.2
AP000997.3-201ENST00000623333 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.53■■□□□ 1.2
AP000997.3-201ENST00000623333 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
AP000997.3-201ENST00000623333 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
AP000997.3-201ENST00000623333 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
AP000997.3-201ENST00000623333 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.52■■□□□ 1.2
AP000997.3-201ENST00000623333 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
AP000997.3-201ENST00000623333 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.52■■□□□ 1.2
AP000997.3-201ENST00000623333 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.51■■□□□ 1.19
AP000997.3-201ENST00000623333 GLI3P10071 1580 aa22.51■■□□□ 1.19
AP000997.3-201ENST00000623333 EXOC5O00471 708 aa22.51■■□□□ 1.19
AP000997.3-201ENST00000623333 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.51■■□□□ 1.19
AP000997.3-201ENST00000623333 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
AP000997.3-201ENST00000623333 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.5■■□□□ 1.19
AP000997.3-201ENST00000623333 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
AP000997.3-201ENST00000623333 PIGBQ92521 554 aa22.49■■□□□ 1.19
AP000997.3-201ENST00000623333 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.49■■□□□ 1.19
AP000997.3-201ENST00000623333 ALDH1L1O75891 902 aa22.48■■□□□ 1.19
AP000997.3-201ENST00000623333 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.48■■□□□ 1.19
AP000997.3-201ENST00000623333 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
AP000997.3-201ENST00000623333 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.48■■□□□ 1.19
AP000997.3-201ENST00000623333 LINS1Q8NG48 757 aa22.48■■□□□ 1.19
AP000997.3-201ENST00000623333 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.48■■□□□ 1.19
AP000997.3-201ENST00000623333 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.48■■□□□ 1.19
AP000997.3-201ENST00000623333 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
AP000997.3-201ENST00000623333 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.47■■□□□ 1.19
AP000997.3-201ENST00000623333 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
AP000997.3-201ENST00000623333 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.47■■□□□ 1.19
AP000997.3-201ENST00000623333 PAPPAQ13219 1627 aa22.47■■□□□ 1.19
AP000997.3-201ENST00000623333 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.47■■□□□ 1.19
AP000997.3-201ENST00000623333 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.47■■□□□ 1.19
AP000997.3-201ENST00000623333 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.47■■□□□ 1.19
AP000997.3-201ENST00000623333 NBPF26B4DH59 902 aa22.46■■□□□ 1.19
AP000997.3-201ENST00000623333 NBPF14Q5TI25 921 aa22.46■■□□□ 1.19
AP000997.3-201ENST00000623333 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
AP000997.3-201ENST00000623333 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.46■■□□□ 1.19
AP000997.3-201ENST00000623333 NBPF15Q8N660 670 aa22.46■■□□□ 1.19
AP000997.3-201ENST00000623333 OFD1O75665 1012 aa22.46■■□□□ 1.19
AP000997.3-201ENST00000623333 IGKV5-2P06315 115 aa22.46■■□□□ 1.19
AP000997.3-201ENST00000623333 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.45■■□□□ 1.18
AP000997.3-201ENST00000623333 A1BGP04217 495 aa22.45■■□□□ 1.18
AP000997.3-201ENST00000623333 SSFA2P28290 1259 aa22.45■■□□□ 1.18
AP000997.3-201ENST00000623333 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
AP000997.3-201ENST00000623333 ITGB4P16144 1822 aa22.45■■□□□ 1.18
AP000997.3-201ENST00000623333 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.45■■□□□ 1.18
AP000997.3-201ENST00000623333 SSH3Q8TE77 659 aa22.45■■□□□ 1.18
AP000997.3-201ENST00000623333 TNS2Q63HR2 1409 aa22.44■■□□□ 1.18
AP000997.3-201ENST00000623333 TERF1P54274 439 aa22.44■■□□□ 1.18
AP000997.3-201ENST00000623333 MYD88Q99836 296 aa22.44■■□□□ 1.18
AP000997.3-201ENST00000623333 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.44■■□□□ 1.18
AP000997.3-201ENST00000623333 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.44■■□□□ 1.18
AP000997.3-201ENST00000623333 SRGAP3O43295 1099 aa22.43■■□□□ 1.18
AP000997.3-201ENST00000623333 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
AP000997.3-201ENST00000623333 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.43■■□□□ 1.18
AP000997.3-201ENST00000623333 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
AP000997.3-201ENST00000623333 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.43■■□□□ 1.18
AP000997.3-201ENST00000623333 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
AP000997.3-201ENST00000623333 ATG3Q9NT62 314 aa22.43■■□□□ 1.18
AP000997.3-201ENST00000623333 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.43■■□□□ 1.18
AP000997.3-201ENST00000623333 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.42■■□□□ 1.18
AP000997.3-201ENST00000623333 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.42■■□□□ 1.18
AP000997.3-201ENST00000623333 GRM8O00222 908 aa22.42■■□□□ 1.18
AP000997.3-201ENST00000623333 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
AP000997.3-201ENST00000623333 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
AP000997.3-201ENST00000623333 POLA2Q14181 598 aa22.42■■□□□ 1.18
AP000997.3-201ENST00000623333 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
AP000997.3-201ENST00000623333 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.41■■□□□ 1.18
AP000997.3-201ENST00000623333 ZNF445P59923 1031 aa22.41■■□□□ 1.18
AP000997.3-201ENST00000623333 DDB1Q16531 1140 aa22.41■■□□□ 1.18
AP000997.3-201ENST00000623333 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
AP000997.3-201ENST00000623333 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
AP000997.3-201ENST00000623333 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.41■■□□□ 1.18
AP000997.3-201ENST00000623333 SLIT2O94813 1529 aa22.41■■□□□ 1.18
AP000997.3-201ENST00000623333 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
AP000997.3-201ENST00000623333 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
AP000997.3-201ENST00000623333 HS1BP3Q53T59 392 aa22.4■■□□□ 1.18
AP000997.3-201ENST00000623333 C8orf37Q96NL8 207 aa22.4■■□□□ 1.18
AP000997.3-201ENST00000623333 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
AP000997.3-201ENST00000623333 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
AP000997.3-201ENST00000623333 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
AP000997.3-201ENST00000623333 GCKRQ14397 625 aa22.39■■□□□ 1.17
AP000997.3-201ENST00000623333 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.39■■□□□ 1.17
AP000997.3-201ENST00000623333 NGLY1Q96IV0 654 aa22.39■■□□□ 1.17
AP000997.3-201ENST00000623333 UTYO14607 1347 aa22.39■■□□□ 1.17
AP000997.3-201ENST00000623333 BCL9O00512 1426 aa22.38■■□□□ 1.17
AP000997.3-201ENST00000623333 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.38■■□□□ 1.17
AP000997.3-201ENST00000623333 SUCLG2Q96I99 432 aa22.38■■□□□ 1.17
AP000997.3-201ENST00000623333 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.38■■□□□ 1.17
AP000997.3-201ENST00000623333 TTC22Q5TAA0 569 aa22.38■■□□□ 1.17
AP000997.3-201ENST00000623333 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.38■■□□□ 1.17
AP000997.3-201ENST00000623333 KAZALD1Q96I82 304 aa22.38■■□□□ 1.17
AP000997.3-201ENST00000623333 JCADQ9P266 1359 aa22.38■■□□□ 1.17
AP000997.3-201ENST00000623333 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
AP000997.3-201ENST00000623333 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.37■■□□□ 1.17
AP000997.3-201ENST00000623333 CERKQ8TCT0 537 aa22.37■■□□□ 1.17
AP000997.3-201ENST00000623333 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
AP000997.3-201ENST00000623333 MTX1Q13505 466 aa22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms