RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619252.4

CU633967.1-201, humanhuman

TSL 2

Gene CU633967.1, Length 549 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU633967.1-201ENST00000619252 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
CU633967.1-201ENST00000619252 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa13.15□□□□□ -0.3
CU633967.1-201ENST00000619252 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP13.15□□□□□ -0.3
CU633967.1-201ENST00000619252 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa13.15□□□□□ -0.3
CU633967.1-201ENST00000619252 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa13.14□□□□□ -0.31
CU633967.1-201ENST00000619252 RGL2O15211 777 aa13.14□□□□□ -0.31
CU633967.1-201ENST00000619252 A1BGP04217 495 aa13.14□□□□□ -0.31
CU633967.1-201ENST00000619252 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP13.14□□□□□ -0.31
CU633967.1-201ENST00000619252 CNKSR1Q969H4 720 aa13.14□□□□□ -0.31
CU633967.1-201ENST00000619252 KLRG1Q96E93 195 aa13.14□□□□□ -0.31
CU633967.1-201ENST00000619252 PHACTR3Q96KR7 559 aa13.14□□□□□ -0.31
CU633967.1-201ENST00000619252 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CU633967.1-201ENST00000619252 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CU633967.1-201ENST00000619252 STYK1Q6J9G0 422 aa13.13□□□□□ -0.31
CU633967.1-201ENST00000619252 DPY19L2Q6NUT2 758 aa13.13□□□□□ -0.31
CU633967.1-201ENST00000619252 CLEC4GQ6UXB4 293 aa13.13□□□□□ -0.31
CU633967.1-201ENST00000619252 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CU633967.1-201ENST00000619252 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
CU633967.1-201ENST00000619252 SCN4AP35499 1836 aa13.13□□□□□ -0.31
CU633967.1-201ENST00000619252 NUP98P52948 1817 aa13.12□□□□□ -0.31
CU633967.1-201ENST00000619252 PRELPP51888 382 aa13.12□□□□□ -0.31
CU633967.1-201ENST00000619252 TAOK3Q9H2K8 898 aa13.12□□□□□ -0.31
CU633967.1-201ENST00000619252 ANP32CO43423 234 aa13.11□□□□□ -0.31
CU633967.1-201ENST00000619252 KCNQ3O43525 872 aa13.11□□□□□ -0.31
CU633967.1-201ENST00000619252 C21orf2O43822 256 aa13.11□□□□□ -0.31
CU633967.1-201ENST00000619252 SRGNP10124 158 aa13.11□□□□□ -0.31
CU633967.1-201ENST00000619252 ERFEQ4G0M1 354 aa13.11□□□□□ -0.31
CU633967.1-201ENST00000619252 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CU633967.1-201ENST00000619252 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
CU633967.1-201ENST00000619252 JMYQ8N9B5 988 aa13.11□□□□□ -0.31
CU633967.1-201ENST00000619252 MASTLQ96GX5 879 aa13.11□□□□□ -0.31
CU633967.1-201ENST00000619252 MCM10Q7L590 875 aa13.1□□□□□ -0.31
CU633967.1-201ENST00000619252 USP16Q9Y5T5 823 aa13.1□□□□□ -0.31
CU633967.1-201ENST00000619252 CCDC24Q8N4L8 307 aa13.09□□□□□ -0.31
CU633967.1-201ENST00000619252 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CU633967.1-201ENST00000619252 NPR1P16066 1061 aa13.08□□□□□ -0.32
CU633967.1-201ENST00000619252 HTRA3P83110 453 aa13.08□□□□□ -0.32
CU633967.1-201ENST00000619252 CCDC93Q567U6 631 aa13.08□□□□□ -0.32
CU633967.1-201ENST00000619252 CCDC146Q8IYE0 955 aa13.08□□□□□ -0.32
CU633967.1-201ENST00000619252 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
CU633967.1-201ENST00000619252 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa13.07□□□□□ -0.32
CU633967.1-201ENST00000619252 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CU633967.1-201ENST00000619252 DCTN1Q14203 1278 aa13.07□□□□□ -0.32
CU633967.1-201ENST00000619252 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CU633967.1-201ENST00000619252 TPTE2Q6XPS3 522 aa13.07□□□□□ -0.32
CU633967.1-201ENST00000619252 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP13.07□□□□□ -0.32
CU633967.1-201ENST00000619252 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CU633967.1-201ENST00000619252 RIC1Q4ADV7 1423 aa13.06□□□□□ -0.32
CU633967.1-201ENST00000619252 IQCA1LA6NCM1 817 aa13.06□□□□□ -0.32
CU633967.1-201ENST00000619252 NEUROD2Q15784 382 aa13.06□□□□□ -0.32
CU633967.1-201ENST00000619252 PCNTO95613 3336 aa13.05□□□□□ -0.32
CU633967.1-201ENST00000619252 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa13.05□□□□□ -0.32
CU633967.1-201ENST00000619252 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
CU633967.1-201ENST00000619252 NBPF26B4DH59 902 aa13.05□□□□□ -0.32
CU633967.1-201ENST00000619252 NFE2L2Q16236 605 aa13.05□□□□□ -0.32
CU633967.1-201ENST00000619252 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
CU633967.1-201ENST00000619252 NBPF15Q8N660 670 aa13.05□□□□□ -0.32
CU633967.1-201ENST00000619252 NYXQ9GZU5 481 aa13.05□□□□□ -0.32
CU633967.1-201ENST00000619252 POTECB2RU33 542 aa13.04□□□□□ -0.32
CU633967.1-201ENST00000619252 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP13.04□□□□□ -0.32
CU633967.1-201ENST00000619252 CHADLQ6NUI6 762 aa13.04□□□□□ -0.32
CU633967.1-201ENST00000619252 RTKN2Q8IZC4 609 aa13.04□□□□□ -0.32
CU633967.1-201ENST00000619252 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
CU633967.1-201ENST00000619252 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
CU633967.1-201ENST00000619252 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa13.03□□□□□ -0.32
CU633967.1-201ENST00000619252 ERVV-1B6SEH8 477 aa13.03□□□□□ -0.32
CU633967.1-201ENST00000619252 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
CU633967.1-201ENST00000619252 ALDH1B1P30837 517 aa13.03□□□□□ -0.32
CU633967.1-201ENST00000619252 RIPK4P57078 832 aa13.03□□□□□ -0.32
CU633967.1-201ENST00000619252 KIF6Q6ZMV9 814 aa13.03□□□□□ -0.32
CU633967.1-201ENST00000619252 C7orf43Q8WVR3 580 aa13.03□□□□□ -0.32
CU633967.1-201ENST00000619252 PLEKHF1Q96S99 279 aa13.03□□□□□ -0.32
CU633967.1-201ENST00000619252 ERBB4Q15303 1308 aa13.03□□□□□ -0.32
CU633967.1-201ENST00000619252 DDNO94850 711 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
CU633967.1-201ENST00000619252 MRS2Q9HD23 443 aa13.02□□□□□ -0.33
CU633967.1-201ENST00000619252 CREBZFQ9NS37 354 aa13.02□□□□□ -0.33
CU633967.1-201ENST00000619252 ADAMTS8Q9UP79 889 aa13.02□□□□□ -0.33
CU633967.1-201ENST00000619252 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa13.02□□□□□ -0.33
CU633967.1-201ENST00000619252 ABCC12Q96J65 1359 aa13.02□□□□□ -0.33
CU633967.1-201ENST00000619252 FAM177BA6PVY3 158 aa13.01□□□□□ -0.33
CU633967.1-201ENST00000619252 LMOD3Q0VAK6 560 aa13.01□□□□□ -0.33
CU633967.1-201ENST00000619252 LDHDQ86WU2 507 aa13.01□□□□□ -0.33
CU633967.1-201ENST00000619252 RUNDC1Q96C34 613 aa13.01□□□□□ -0.33
CU633967.1-201ENST00000619252 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
CU633967.1-201ENST00000619252 SNED1Q8TER0 1413 aa13□□□□□ -0.33
CU633967.1-201ENST00000619252 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CU633967.1-201ENST00000619252 HLFQ16534 295 aa13□□□□□ -0.33
CU633967.1-201ENST00000619252 CRY2Q49AN0 593 aa13□□□□□ -0.33
CU633967.1-201ENST00000619252 GRIPAP1Q4V328 841 aa13□□□□□ -0.33
CU633967.1-201ENST00000619252 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa13□□□□□ -0.33
CU633967.1-201ENST00000619252 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
CU633967.1-201ENST00000619252 MIS18AQ9NYP9 233 aa13□□□□□ -0.33
CU633967.1-201ENST00000619252 LAMB2P55268 1798 aa12.99□□□□□ -0.33
CU633967.1-201ENST00000619252 ZNF541Q9H0D2 1346 aa12.99□□□□□ -0.33
CU633967.1-201ENST00000619252 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CU633967.1-201ENST00000619252 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CU633967.1-201ENST00000619252 IARSP41252 1262 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CU633967.1-201ENST00000619252 TMPOP42166 694 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CU633967.1-201ENST00000619252 CCDC184Q52MB2 194 aa12.99□□□□□ -0.33
CU633967.1-201ENST00000619252 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms