RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617158.4

CSAG3-202, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG3, Length 789 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
CSAG3-202ENST00000617158 BCORQ6W2J9 1755 aa26.64■■□□□ 1.86
CSAG3-202ENST00000617158 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
CSAG3-202ENST00000617158 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa26.63■■□□□ 1.85
CSAG3-202ENST00000617158 PLBD2Q8NHP8 589 aa26.63■■□□□ 1.85
CSAG3-202ENST00000617158 AK7Q96M32 723 aa26.63■■□□□ 1.85
CSAG3-202ENST00000617158 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa26.63■■□□□ 1.85
CSAG3-202ENST00000617158 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa26.63■■□□□ 1.85
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM57Q8N5G2 664 aa26.62■■□□□ 1.85
CSAG3-202ENST00000617158 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa26.62■■□□□ 1.85
CSAG3-202ENST00000617158 NUP98P52948 1817 aa26.61■■□□□ 1.85
CSAG3-202ENST00000617158 CAMTA2O94983 1202 aa26.61■■□□□ 1.85
CSAG3-202ENST00000617158 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
CSAG3-202ENST00000617158 DNAAF4Q8WXU2 420 aa26.61■■□□□ 1.85
CSAG3-202ENST00000617158 ZBTB3Q9H5J0 574 aa26.61■■□□□ 1.85
CSAG3-202ENST00000617158 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
CSAG3-202ENST00000617158 PXDNLA1KZ92 1463 aa26.61■■□□□ 1.85
CSAG3-202ENST00000617158 SCN7AQ01118 1682 aa26.6■■□□□ 1.85
CSAG3-202ENST00000617158 HLFQ16534 295 aa26.6■■□□□ 1.85
CSAG3-202ENST00000617158 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
CSAG3-202ENST00000617158 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
CSAG3-202ENST00000617158 DDX58O95786 925 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
CSAG3-202ENST00000617158 BEND3Q5T5X7 828 aa26.59■■□□□ 1.85
CSAG3-202ENST00000617158 RIC3Q7Z5B4 369 aa26.59■■□□□ 1.85
CSAG3-202ENST00000617158 CRBNQ96SW2 442 aa26.59■■□□□ 1.85
CSAG3-202ENST00000617158 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
CSAG3-202ENST00000617158 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
CSAG3-202ENST00000617158 BCL2L12Q9HB09 334 aa26.58■■□□□ 1.85
CSAG3-202ENST00000617158 COG6Q9Y2V7 657 aa26.58■■□□□ 1.85
CSAG3-202ENST00000617158 QSER1Q2KHR3 1735 aa26.58■■□□□ 1.85
CSAG3-202ENST00000617158 ATP10DQ9P241 1426 aa26.57■■□□□ 1.84
CSAG3-202ENST00000617158 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa26.57■■□□□ 1.84
CSAG3-202ENST00000617158 ERVV-1B6SEH8 477 aa26.57■■□□□ 1.84
CSAG3-202ENST00000617158 IGKV5-2P06315 115 aa26.57■■□□□ 1.84
CSAG3-202ENST00000617158 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
CSAG3-202ENST00000617158 A0A087WZG4 1122 aa26.56■■□□□ 1.84
CSAG3-202ENST00000617158 PHF14O94880 888 aa26.56■■□□□ 1.84
CSAG3-202ENST00000617158 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.56■■□□□ 1.84
CSAG3-202ENST00000617158 KIF6Q6ZMV9 814 aa26.56■■□□□ 1.84
CSAG3-202ENST00000617158 ADRA2BP18089 450 aa26.55■■□□□ 1.84
CSAG3-202ENST00000617158 SSFA2P28290 1259 aa26.55■■□□□ 1.84
CSAG3-202ENST00000617158 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
CSAG3-202ENST00000617158 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
CSAG3-202ENST00000617158 NARFQ9UHQ1 456 aa26.55■■□□□ 1.84
CSAG3-202ENST00000617158 MS4A1P11836 297 aa26.54■■□□□ 1.84
CSAG3-202ENST00000617158 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
CSAG3-202ENST00000617158 MVPQ14764 893 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
CSAG3-202ENST00000617158 SLC15A2Q16348 729 aa26.54■■□□□ 1.84
CSAG3-202ENST00000617158 TRAPPC3LQ5T215 181 aa26.54■■□□□ 1.84
CSAG3-202ENST00000617158 EXOC6Q8TAG9 804 aa26.54■■□□□ 1.84
CSAG3-202ENST00000617158 ARXQ96QS3 562 aa26.54■■□□□ 1.84
CSAG3-202ENST00000617158 MYD88Q99836 296 aa26.54■■□□□ 1.84
CSAG3-202ENST00000617158 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa26.54■■□□□ 1.84
CSAG3-202ENST00000617158 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CSAG3-202ENST00000617158 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CSAG3-202ENST00000617158 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
CSAG3-202ENST00000617158 ISCA1Q9BUE6 129 aa26.53■■□□□ 1.84
CSAG3-202ENST00000617158 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa26.53■■□□□ 1.84
CSAG3-202ENST00000617158 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CSAG3-202ENST00000617158 CCT4P50991 539 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
CSAG3-202ENST00000617158 TCIRG1Q13488 830 aa26.52■■□□□ 1.84
CSAG3-202ENST00000617158 USPL1Q5W0Q7 1092 aa26.52■■□□□ 1.84
CSAG3-202ENST00000617158 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa26.51■■□□□ 1.83
CSAG3-202ENST00000617158 LINS1Q8NG48 757 aa26.51■■□□□ 1.83
CSAG3-202ENST00000617158 NEURL1BA8MQ27 555 aa26.5■■□□□ 1.83
CSAG3-202ENST00000617158 ITPRIPQ8IWB1 547 aa26.5■■□□□ 1.83
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF34Q8IZ26 560 aa26.5■■□□□ 1.83
CSAG3-202ENST00000617158 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa26.5■■□□□ 1.83
CSAG3-202ENST00000617158 STK32BQ9NY57 414 aa26.5■■□□□ 1.83
CSAG3-202ENST00000617158 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
CSAG3-202ENST00000617158 ALDH1L1O75891 902 aa26.49■■□□□ 1.83
CSAG3-202ENST00000617158 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
CSAG3-202ENST00000617158 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
CSAG3-202ENST00000617158 RGL2O15211 777 aa26.48■■□□□ 1.83
CSAG3-202ENST00000617158 RFC4P35249 363 aa26.48■■□□□ 1.83
CSAG3-202ENST00000617158 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
CSAG3-202ENST00000617158 FKBP8Q14318 412 aa26.48■■□□□ 1.83
CSAG3-202ENST00000617158 UBN2Q6ZU65 1347 aa26.47■■□□□ 1.83
CSAG3-202ENST00000617158 CLEC4GQ6UXB4 293 aa26.47■■□□□ 1.83
CSAG3-202ENST00000617158 USP44Q9H0E7 712 aa26.47■■□□□ 1.83
CSAG3-202ENST00000617158 GYS1P13807 737 aa26.46■■□□□ 1.83
CSAG3-202ENST00000617158 MEIS3Q99687 375 aa26.46■■□□□ 1.83
CSAG3-202ENST00000617158 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
CSAG3-202ENST00000617158 ZPR1O75312 459 aa26.45■■□□□ 1.82
CSAG3-202ENST00000617158 GPTP24298 496 aa26.45■■□□□ 1.82
CSAG3-202ENST00000617158 NEXNQ0ZGT2 675 aa26.45■■□□□ 1.82
CSAG3-202ENST00000617158 GCKRQ14397 625 aa26.45■■□□□ 1.82
CSAG3-202ENST00000617158 TBC1D9BQ66K14 1250 aa26.45■■□□□ 1.82
CSAG3-202ENST00000617158 NLRP10Q86W26 655 aa26.45■■□□□ 1.82
CSAG3-202ENST00000617158 COL24A1Q17RW2 1714 aa26.45■■□□□ 1.82
CSAG3-202ENST00000617158 FLAD1Q8NFF5 587 aa26.44■■□□□ 1.82
CSAG3-202ENST00000617158 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa26.44■■□□□ 1.82
CSAG3-202ENST00000617158 DDX19BQ9UMR2 479 aa26.44■■□□□ 1.82
CSAG3-202ENST00000617158 NEFLP07196 543 aa26.43■■□□□ 1.82
CSAG3-202ENST00000617158 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa26.43■■□□□ 1.82
CSAG3-202ENST00000617158 UTYO14607 1347 aa26.42■■□□□ 1.82
CSAG3-202ENST00000617158 CASP7P55210 303 aa26.42■■□□□ 1.82
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC191Q8NCU4 936 aa26.42■■□□□ 1.82
CSAG3-202ENST00000617158 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
CSAG3-202ENST00000617158 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms