RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616614.4

FMR1-216, Transcript of fragile X mental retardation 1, humanhuman

TSL 5

Gene FMR1, Length 1,409 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1-216ENST00000616614 XAGE3Q8WTP9 111 aa41.1■■■■■ 4.17
FMR1-216ENST00000616614 COPS6Q7L5N1 327 aa41.09■■■■■ 4.17
FMR1-216ENST00000616614 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP41.09■■■■■ 4.17
FMR1-216ENST00000616614 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP41.09■■■■■ 4.17
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FMR1-216ENST00000616614 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa41.08■■■■■ 4.17
FMR1-216ENST00000616614 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP41.07■■■■■ 4.16
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FMR1-216ENST00000616614 CCDC30Q5VVM6 783 aa41.07■■■■■ 4.16
FMR1-216ENST00000616614 BICDL1Q6ZP65 573 aa41.07■■■■■ 4.16
FMR1-216ENST00000616614 ZBTB3Q9H5J0 574 aa41.06■■■■■ 4.16
FMR1-216ENST00000616614 CLEC4GQ6UXB4 293 aa41.05■■■■■ 4.16
FMR1-216ENST00000616614 KIF6Q6ZMV9 814 aa41.05■■■■■ 4.16
FMR1-216ENST00000616614 PARP3Q9Y6F1 533 aa41.05■■■■■ 4.16
FMR1-216ENST00000616614 BCORQ6W2J9 1755 aa41.04■■■■■ 4.16
FMR1-216ENST00000616614 ERVV-1B6SEH8 477 aa41.04■■■■■ 4.16
FMR1-216ENST00000616614 HYPKQ9NX55 129 aa41.04■■■■■ 4.16
FMR1-216ENST00000616614 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
FMR1-216ENST00000616614 SYT17Q9BSW7 474 aa41.02■■■■■ 4.16
FMR1-216ENST00000616614 RGL2O15211 777 aa41.01■■■■■ 4.16
FMR1-216ENST00000616614 KLHL34Q8N239 644 aa41.01■■■■■ 4.15
FMR1-216ENST00000616614 ZNF652Q9Y2D9 606 aa41■■■■■ 4.15
FMR1-216ENST00000616614 CHMP4AQ9BY43 222 aa40.99■■■■■ 4.15
FMR1-216ENST00000616614 SERPINB2P05120 415 aa40.97■■■■■ 4.15
FMR1-216ENST00000616614 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP40.96■■■■■ 4.15
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FMR1-216ENST00000616614 NLGN2Q8NFZ4 835 aa40.94■■■■■ 4.14
FMR1-216ENST00000616614 STK31Q9BXU1 1019 aa40.94■■■■■ 4.14
FMR1-216ENST00000616614 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP40.94■■■■■ 4.14
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FMR1-216ENST00000616614 CD2APQ9Y5K6 639 aa40.93■■■■■ 4.14
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FMR1-216ENST00000616614 ZBED9Q6R2W3 1325 aa40.92■■■■■ 4.14
FMR1-216ENST00000616614 CARMIL3Q8ND23 1372 aa40.92■■■■■ 4.14
FMR1-216ENST00000616614 C10orf71Q711Q0 1435 aa40.91■■■■■ 4.14
FMR1-216ENST00000616614 PLBD2Q8NHP8 589 aa40.91■■■■■ 4.14
FMR1-216ENST00000616614 ATP10DQ9P241 1426 aa40.9■■■■■ 4.14
FMR1-216ENST00000616614 GPTP24298 496 aa40.9■■■■■ 4.14
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FMR1-216ENST00000616614 PRR5LQ6MZQ0 368 aa40.85■■■■■ 4.13
FMR1-216ENST00000616614 NUP98P52948 1817 aa40.85■■■■■ 4.13
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FMR1-216ENST00000616614 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
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FMR1-216ENST00000616614 RIC3Q7Z5B4 369 aa40.82■■■■■ 4.12
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FMR1-216ENST00000616614 CNBD1Q8NA66 436 aa40.8■■■■■ 4.12
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FMR1-216ENST00000616614 ADCY9O60503 1353 aa40.78■■■■■ 4.12
FMR1-216ENST00000616614 KIF13BQ9NQT8 1826 aa40.77■■■■■ 4.12
FMR1-216ENST00000616614 PI4KAP2A4QPH2 592 aa40.77■■■■■ 4.12
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FMR1-216ENST00000616614 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa40.76■■■■■ 4.12
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FMR1-216ENST00000616614 TPTE2Q6XPS3 522 aa40.76■■■■■ 4.12
FMR1-216ENST00000616614 NLRP10Q86W26 655 aa40.76■■■■■ 4.12
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FMR1-216ENST00000616614 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa40.76■■■■■ 4.12
FMR1-216ENST00000616614 A0A0G2JLW4 131 aa40.76■■■■■ 4.11
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FMR1-216ENST00000616614 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP40.74■■■■■ 4.11
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FMR1-216ENST00000616614 ERFEQ4G0M1 354 aa40.7■■■■■ 4.11
FMR1-216ENST00000616614 NYXQ9GZU5 481 aa40.7■■■■■ 4.11
FMR1-216ENST00000616614 WWC3Q9ULE0 1092 aa40.7■■■■■ 4.11
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FMR1-216ENST00000616614 ALDH1L2Q3SY69 923 aa40.68■■■■■ 4.1
FMR1-216ENST00000616614 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa40.68■■■■■ 4.1
FMR1-216ENST00000616614 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP40.68■■■■■ 4.1
FMR1-216ENST00000616614 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
FMR1-216ENST00000616614 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
FMR1-216ENST00000616614 SYNE4Q8N205 404 aa40.67■■■■■ 4.1
FMR1-216ENST00000616614 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa40.66■■■■■ 4.1
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