RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613876.1

CCL23-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 23, humanhuman

TSL 3

Gene CCL23, Length 402 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23-202ENST00000613876 SMC5Q8IY18 1101 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL23-202ENST00000613876 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CCL23-202ENST00000613876 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL23-202ENST00000613876 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CCL23-202ENST00000613876 BRWD3Q6RI45 1802 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL23-202ENST00000613876 SBF2Q86WG5 1849 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL23-202ENST00000613876 NEURL1BA8MQ27 555 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL23-202ENST00000613876 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CCL23-202ENST00000613876 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CCL23-202ENST00000613876 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CCL23-202ENST00000613876 CRKLP46109 303 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
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CCL23-202ENST00000613876 ZBTB3Q9H5J0 574 aa6.67□□□□□ -1.34
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CCL23-202ENST00000613876 CCDC87Q9NVE4 849 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL23-202ENST00000613876 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
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CCL23-202ENST00000613876 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CCL23-202ENST00000613876 BTAF1O14981 1849 aa6.66□□□□□ -1.34
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CCL23-202ENST00000613876 ERVV-1B6SEH8 477 aa6.66□□□□□ -1.34
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CCL23-202ENST00000613876 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
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CCL23-202ENST00000613876 GCC1Q96CN9 775 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL23-202ENST00000613876 ARXQ96QS3 562 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL23-202ENST00000613876 ISCA1Q9BUE6 129 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL23-202ENST00000613876 HDAC5Q9UQL6 1122 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL23-202ENST00000613876 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CCL23-202ENST00000613876 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL23-202ENST00000613876 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CCL23-202ENST00000613876 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL23-202ENST00000613876 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL23-202ENST00000613876 H7C1W4 665 aa6.65□□□□□ -1.34
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CCL23-202ENST00000613876 CASP7P55210 303 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL23-202ENST00000613876 NUCB1Q02818 461 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL23-202ENST00000613876 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CCL23-202ENST00000613876 POLA2Q14181 598 aa6.65□□□□□ -1.34
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CCL23-202ENST00000613876 KAZALD1Q96I82 304 aa6.65□□□□□ -1.34
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CCL23-202ENST00000613876 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
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CCL23-202ENST00000613876 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL23-202ENST00000613876 SSH3Q8TE77 659 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL23-202ENST00000613876 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL23-202ENST00000613876 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL23-202ENST00000613876 LY75O60449 1722 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL23-202ENST00000613876 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL23-202ENST00000613876 CAMTA2O94983 1202 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL23-202ENST00000613876 COL15A1P39059 1388 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL23-202ENST00000613876 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL23-202ENST00000613876 MTX1Q13505 466 aa6.63□□□□□ -1.35
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CCL23-202ENST00000613876 EPHA10Q5JZY3 1008 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL23-202ENST00000613876 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL23-202ENST00000613876 NLRP10Q86W26 655 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL23-202ENST00000613876 CHD1LQ86WJ1 897 aa6.63□□□□□ -1.35
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CCL23-202ENST00000613876 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
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CCL23-202ENST00000613876 NUP98P52948 1817 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL23-202ENST00000613876 PLSCR1O15162 318 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL23-202ENST00000613876 SRGAP3O43295 1099 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL23-202ENST00000613876 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CCL23-202ENST00000613876 GPTP24298 496 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL23-202ENST00000613876 FOXO4P98177 505 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL23-202ENST00000613876 SMIM5Q71RC9 77 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL23-202ENST00000613876 LNPKQ9C0E8 428 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL23-202ENST00000613876 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL23-202ENST00000613876 TAF1LQ8IZX4 1826 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL23-202ENST00000613876 APBB1O00213 710 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL23-202ENST00000613876 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CCL23-202ENST00000613876 RAB11FIP3O75154 756 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL23-202ENST00000613876 SURF6O75683 361 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
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