RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596536.5

FCHO1-216, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,204 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-216ENST00000596536 FAM177BA6PVY3 158 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-216ENST00000596536 NWD1Q149M9 1564 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-216ENST00000596536 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-216ENST00000596536 ATP2B3Q16720 1220 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-216ENST00000596536 LRSAM1Q6UWE0 723 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-216ENST00000596536 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-216ENST00000596536 USP48Q86UV5 1035 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-216ENST00000596536 TEFQ10587 303 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-216ENST00000596536 SSH3Q8TE77 659 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-216ENST00000596536 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-216ENST00000596536 STAP2Q9UGK3 403 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-216ENST00000596536 PLCB2Q00722 1185 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-216ENST00000596536 CUL4AQ13619 759 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-216ENST00000596536 PROSER3Q2NL68 480 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-216ENST00000596536 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-216ENST00000596536 PI4K2BQ8TCG2 481 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-216ENST00000596536 CNPY2Q9Y2B0 182 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-216ENST00000596536 PTMAP06454 111 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF710Q8N1W2 664 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-216ENST00000596536 DNAAF4Q8WXU2 420 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-216ENST00000596536 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 BTBD11A6QL63 1104 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 FIBPO43427 364 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 MCM2P49736 904 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 AK2P54819 239 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 SNX14Q9Y5W7 946 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 IGSF3O75054 1194 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 CASTP20810 708 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 HSPA4P34932 840 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 PDLIM2Q96JY6 352 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 LARGE1O95461 756 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 CHMP3Q9Y3E7 222 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 SGSM2O43147 1006 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 TAF3Q5VWG9 929 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 KIF1BPQ96EK5 621 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 TCEANC2Q96MN5 208 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 SIL1Q9H173 461 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 PIP4K2BP78356 416 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 PTH1RQ03431 593 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 BEND3Q5T5X7 828 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 CCDC83Q8IWF9 413 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 MYRIPQ8NFW9 859 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 MBD3O95983 291 aa12.81□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 MCM5P33992 734 aa12.81□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 ANAPC15P60006 121 aa12.81□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 CHRNA2Q15822 529 aa12.81□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 ADCK5Q3MIX3 580 aa12.81□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 CNTROBQ8N137 903 aa12.81□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa12.81□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 RUFY3Q7L099 469 aa12.81□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 KLHDC4Q8TBB5 520 aa12.81□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 TSPY26PQ9H489 355 aa12.81□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 SPDYE4A6NLX3 237 aa12.81□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 NECAB1Q8N987 351 aa12.81□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 PHF8Q9UPP1 1060 aa12.81□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa12.8□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 KCNJ4P48050 445 aa12.8□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 POLA2Q14181 598 aa12.8□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 RAD50Q92878 1312 aa12.79□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 RAB11FIP3O75154 756 aa12.79□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 SYT1P21579 422 aa12.79□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 SMC3Q9UQE7 1217 aa12.79□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 AACSQ86V21 672 aa12.79□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 USP25Q9UHP3 1055 aa12.79□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 FAM173BQ6P4H8 233 aa12.78□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 FERMT3Q86UX7 667 aa12.78□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 FAM227BQ96M60 508 aa12.78□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 CCDC39Q9UFE4 941 aa12.78□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 STX6O43752 255 aa12.77□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 MYL6BP14649 208 aa12.77□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 SLC39A6Q13433 755 aa12.77□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 IP6K1Q92551 441 aa12.77□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa12.77□□□□□ -0.36
FCHO1-216ENST00000596536 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.1 ms