RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588918.5

MFSD12-208, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 12, human

TSL 5

Gene MFSD12, Length 2,040 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD12-208	ENST00000588918	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		32.16	■■■□□ 2.74
MFSD12-208	ENST00000588918	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		32.16	■■■□□ 2.74
MFSD12-208	ENST00000588918	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		32.16	■■■□□ 2.74
MFSD12-208	ENST00000588918	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		32.16	■■■□□ 2.74
MFSD12-208	ENST00000588918	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	32.16	■■■□□ 2.74
MFSD12-208	ENST00000588918	MYD88	Q99836	296 aa		32.15	■■■□□ 2.74
MFSD12-208	ENST00000588918	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	32.15	■■■□□ 2.74
MFSD12-208	ENST00000588918	USP44	Q9H0E7	712 aa		32.14	■■■□□ 2.74
MFSD12-208	ENST00000588918	ATP10D	Q9P241	1426 aa		32.13	■■■□□ 2.73
MFSD12-208	ENST00000588918	IGKV5-2	P06315	115 aa		32.12	■■■□□ 2.73
MFSD12-208	ENST00000588918	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
MFSD12-208	ENST00000588918	LINS1	Q8NG48	757 aa		32.12	■■■□□ 2.73
MFSD12-208	ENST00000588918	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
MFSD12-208	ENST00000588918	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		32.11	■■■□□ 2.73
MFSD12-208	ENST00000588918	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		32.11	■■■□□ 2.73
MFSD12-208	ENST00000588918	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
MFSD12-208	ENST00000588918	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		32.1	■■■□□ 2.73
MFSD12-208	ENST00000588918	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
MFSD12-208	ENST00000588918	ALDH1L1	O75891	902 aa		32.09	■■■□□ 2.73
MFSD12-208	ENST00000588918	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	32.09	■■■□□ 2.73
MFSD12-208	ENST00000588918	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	32.09	■■■□□ 2.73
MFSD12-208	ENST00000588918	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		32.09	■■■□□ 2.73
MFSD12-208	ENST00000588918	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		32.08	■■■□□ 2.73
MFSD12-208	ENST00000588918	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	32.08	■■■□□ 2.73
MFSD12-208	ENST00000588918	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		32.08	■■■□□ 2.73
MFSD12-208	ENST00000588918	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		32.08	■■■□□ 2.73
MFSD12-208	ENST00000588918	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	32.08	■■■□□ 2.73
MFSD12-208	ENST00000588918	LY75	O60449	1722 aa		32.07	■■■□□ 2.73
MFSD12-208	ENST00000588918	GNAI3	P08754	354 aa		32.07	■■■□□ 2.72
MFSD12-208	ENST00000588918	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		32.07	■■■□□ 2.72
MFSD12-208	ENST00000588918	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	32.07	■■■□□ 2.72
MFSD12-208	ENST00000588918	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	32.06	■■■□□ 2.72
MFSD12-208	ENST00000588918	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		32.06	■■■□□ 2.72
MFSD12-208	ENST00000588918	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
MFSD12-208	ENST00000588918	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		32.05	■■■□□ 2.72
MFSD12-208	ENST00000588918	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
MFSD12-208	ENST00000588918	GNAI2	P04899	355 aa		32.05	■■■□□ 2.72
MFSD12-208	ENST00000588918	SMIM5	Q71RC9	77 aa		32.05	■■■□□ 2.72
MFSD12-208	ENST00000588918	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
MFSD12-208	ENST00000588918	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		32.04	■■■□□ 2.72
MFSD12-208	ENST00000588918	HLF	Q16534	295 aa		32.04	■■■□□ 2.72
MFSD12-208	ENST00000588918	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		32.03	■■■□□ 2.72
MFSD12-208	ENST00000588918	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
MFSD12-208	ENST00000588918	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
MFSD12-208	ENST00000588918	APBA3	O96018	575 aa		32.02	■■■□□ 2.72
MFSD12-208	ENST00000588918	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	32.02	■■■□□ 2.72
MFSD12-208	ENST00000588918	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		32.02	■■■□□ 2.72
MFSD12-208	ENST00000588918	GCKR	Q14397	625 aa		32.02	■■■□□ 2.72
MFSD12-208	ENST00000588918	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
MFSD12-208	ENST00000588918	RREB1	Q92766	1687 aa		32.01	■■■□□ 2.71
MFSD12-208	ENST00000588918	CEP85	Q6P2H3	762 aa		32.01	■■■□□ 2.71
MFSD12-208	ENST00000588918	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
MFSD12-208	ENST00000588918	GRM8	O00222	908 aa		32	■■■□□ 2.71
MFSD12-208	ENST00000588918	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
MFSD12-208	ENST00000588918	TCIRG1	Q13488	830 aa		31.99	■■■□□ 2.71
MFSD12-208	ENST00000588918	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
MFSD12-208	ENST00000588918	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
MFSD12-208	ENST00000588918	PROM2	Q8N271	834 aa		31.99	■■■□□ 2.71
MFSD12-208	ENST00000588918	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		31.99	■■■□□ 2.71
MFSD12-208	ENST00000588918	GNPAT	O15228	680 aa		31.98	■■■□□ 2.71
MFSD12-208	ENST00000588918	SKAP1	Q86WV1	359 aa		31.98	■■■□□ 2.71
MFSD12-208	ENST00000588918	COL15A1	P39059	1388 aa		31.98	■■■□□ 2.71
MFSD12-208	ENST00000588918	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		31.97	■■■□□ 2.71
MFSD12-208	ENST00000588918	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
MFSD12-208	ENST00000588918	TXNRD1	Q16881	649 aa		31.97	■■■□□ 2.71
MFSD12-208	ENST00000588918	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	31.96	■■■□□ 2.71
MFSD12-208	ENST00000588918	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		31.95	■■■□□ 2.71
MFSD12-208	ENST00000588918	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		31.95	■■■□□ 2.71
MFSD12-208	ENST00000588918	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		31.95	■■■□□ 2.71
MFSD12-208	ENST00000588918		A0A087WZG4	1122 aa		31.95	■■■□□ 2.7
MFSD12-208	ENST00000588918	RPS6KA4	O75676	772 aa		31.95	■■■□□ 2.7
MFSD12-208	ENST00000588918	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		31.95	■■■□□ 2.7
MFSD12-208	ENST00000588918	UTY	O14607	1347 aa		31.94	■■■□□ 2.7
MFSD12-208	ENST00000588918	GPT	P24298	496 aa		31.94	■■■□□ 2.7
MFSD12-208	ENST00000588918	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	31.94	■■■□□ 2.7
MFSD12-208	ENST00000588918	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	31.94	■■■□□ 2.7
MFSD12-208	ENST00000588918	PLSCR1	O15162	318 aa		31.93	■■■□□ 2.7
MFSD12-208	ENST00000588918	CAMTA2	O94983	1202 aa		31.93	■■■□□ 2.7
MFSD12-208	ENST00000588918	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		31.93	■■■□□ 2.7
MFSD12-208	ENST00000588918	SUCLG2	Q96I99	432 aa		31.93	■■■□□ 2.7
MFSD12-208	ENST00000588918	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		31.92	■■■□□ 2.7
MFSD12-208	ENST00000588918	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	31.92	■■■□□ 2.7
MFSD12-208	ENST00000588918	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		31.92	■■■□□ 2.7
MFSD12-208	ENST00000588918	AK7	Q96M32	723 aa		31.92	■■■□□ 2.7
MFSD12-208	ENST00000588918	C4B	P0C0L5	1744 aa		31.92	■■■□□ 2.7
MFSD12-208	ENST00000588918	KAZALD1	Q96I82	304 aa		31.91	■■■□□ 2.7
MFSD12-208	ENST00000588918	ATP8B2	P98198	1209 aa		31.9	■■■□□ 2.7
MFSD12-208	ENST00000588918	NUP98	P52948	1817 aa		31.9	■■■□□ 2.7
MFSD12-208	ENST00000588918	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		31.9	■■■□□ 2.7
MFSD12-208	ENST00000588918	PHF14	O94880	888 aa		31.89	■■■□□ 2.7
MFSD12-208	ENST00000588918	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	31.89	■■■□□ 2.7
MFSD12-208	ENST00000588918	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	31.88	■■■□□ 2.69
MFSD12-208	ENST00000588918	SMC5	Q8IY18	1101 aa		31.88	■■■□□ 2.69
MFSD12-208	ENST00000588918		H7C1W4	665 aa		31.87	■■■□□ 2.69
MFSD12-208	ENST00000588918	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		31.87	■■■□□ 2.69
MFSD12-208	ENST00000588918	CASP7	P55210	303 aa		31.87	■■■□□ 2.69
MFSD12-208	ENST00000588918	NLRP10	Q86W26	655 aa		31.87	■■■□□ 2.69
MFSD12-208	ENST00000588918	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	31.87	■■■□□ 2.69
MFSD12-208	ENST00000588918	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	31.87	■■■□□ 2.69
MFSD12-208	ENST00000588918	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	31.86	■■■□□ 2.69

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