RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588667.5

ATG4D-208, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG4D, Length 1,619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-208ENST00000588667 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.92■■□□□ 1.74
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ATG4D-208ENST00000588667 TTLL7Q6ZT98 887 aa25.91■■□□□ 1.74
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ATG4D-208ENST00000588667 NTSR2O95665 410 aa25.66■■□□□ 1.7
ATG4D-208ENST00000588667 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
ATG4D-208ENST00000588667 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
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ATG4D-208ENST00000588667 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
ATG4D-208ENST00000588667 MYD88Q99836 296 aa25.66■■□□□ 1.7
ATG4D-208ENST00000588667 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
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