RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586813.5

TRAF4-216, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF4, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-216ENST00000586813 NPHP1O15259 732 aa25.79■■□□□ 1.72
TRAF4-216ENST00000586813 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
TRAF4-216ENST00000586813 IFFO2Q5TF58 517 aa25.79■■□□□ 1.72
TRAF4-216ENST00000586813 GLTPD2A6NH11 291 aa25.78■■□□□ 1.72
TRAF4-216ENST00000586813 ST5P78524 1137 aa25.78■■□□□ 1.72
TRAF4-216ENST00000586813 C21orf2O43822 256 aa25.77■■□□□ 1.72
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
TRAF4-216ENST00000586813 CLEC4GQ6UXB4 293 aa25.75■■□□□ 1.71
TRAF4-216ENST00000586813 SMC1BQ8NDV3 1235 aa25.75■■□□□ 1.71
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.75■■□□□ 1.71
TRAF4-216ENST00000586813 SRGNP10124 158 aa25.74■■□□□ 1.71
TRAF4-216ENST00000586813 STYK1Q6J9G0 422 aa25.74■■□□□ 1.71
TRAF4-216ENST00000586813 NBPF26B4DH59 902 aa25.73■■□□□ 1.71
TRAF4-216ENST00000586813 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
TRAF4-216ENST00000586813 HTRA3P83110 453 aa25.73■■□□□ 1.71
TRAF4-216ENST00000586813 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
TRAF4-216ENST00000586813 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
TRAF4-216ENST00000586813 NBPF15Q8N660 670 aa25.73■■□□□ 1.71
TRAF4-216ENST00000586813 CNKSR1Q969H4 720 aa25.73■■□□□ 1.71
TRAF4-216ENST00000586813 LTBP3Q9NS15 1303 aa25.72■■□□□ 1.71
TRAF4-216ENST00000586813 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
TRAF4-216ENST00000586813 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
TRAF4-216ENST00000586813 MASTLQ96GX5 879 aa25.72■■□□□ 1.71
TRAF4-216ENST00000586813 TAOK3Q9H2K8 898 aa25.71■■□□□ 1.71
TRAF4-216ENST00000586813 RGL2O15211 777 aa25.7■■□□□ 1.7
TRAF4-216ENST00000586813 NEFMP07197 916 aa25.7■■□□□ 1.7
TRAF4-216ENST00000586813 ERFEQ4G0M1 354 aa25.7■■□□□ 1.7
TRAF4-216ENST00000586813 NUP98P52948 1817 aa25.7■■□□□ 1.7
TRAF4-216ENST00000586813 MIS18AQ9NYP9 233 aa25.69■■□□□ 1.7
TRAF4-216ENST00000586813 SOGA3Q5TF21 947 aa25.68■■□□□ 1.7
TRAF4-216ENST00000586813 DPY19L2Q6NUT2 758 aa25.68■■□□□ 1.7
TRAF4-216ENST00000586813 KLRG1Q96E93 195 aa25.68■■□□□ 1.7
TRAF4-216ENST00000586813 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.68■■□□□ 1.7
TRAF4-216ENST00000586813 PLEKHF1Q96S99 279 aa25.67■■□□□ 1.7
TRAF4-216ENST00000586813 POTECB2RU33 542 aa25.66■■□□□ 1.7
TRAF4-216ENST00000586813 TPTE2Q6XPS3 522 aa25.65■■□□□ 1.7
TRAF4-216ENST00000586813 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
TRAF4-216ENST00000586813 NPR1P16066 1061 aa25.64■■□□□ 1.7
TRAF4-216ENST00000586813 HLFQ16534 295 aa25.64■■□□□ 1.7
TRAF4-216ENST00000586813 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
TRAF4-216ENST00000586813 NFE2L2Q16236 605 aa25.63■■□□□ 1.69
TRAF4-216ENST00000586813 JMYQ8N9B5 988 aa25.63■■□□□ 1.69
TRAF4-216ENST00000586813 C7orf43Q8WVR3 580 aa25.63■■□□□ 1.69
TRAF4-216ENST00000586813 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
TRAF4-216ENST00000586813 FAM177BA6PVY3 158 aa25.61■■□□□ 1.69
TRAF4-216ENST00000586813 CCDC93Q567U6 631 aa25.61■■□□□ 1.69
TRAF4-216ENST00000586813 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.61■■□□□ 1.69
TRAF4-216ENST00000586813 SCN4AP35499 1836 aa25.6■■□□□ 1.69
TRAF4-216ENST00000586813 PCNTO95613 3336 aa25.6■■□□□ 1.69
TRAF4-216ENST00000586813 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
TRAF4-216ENST00000586813 NGEFQ8N5V2 710 aa25.59■■□□□ 1.69
TRAF4-216ENST00000586813 ABCC12Q96J65 1359 aa25.58■■□□□ 1.69
TRAF4-216ENST00000586813 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.58■■□□□ 1.69
TRAF4-216ENST00000586813 DDNO94850 711 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
TRAF4-216ENST00000586813 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
TRAF4-216ENST00000586813 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa25.58■■□□□ 1.69
TRAF4-216ENST00000586813 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
TRAF4-216ENST00000586813 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP25.56■■□□□ 1.68
TRAF4-216ENST00000586813 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.56■■□□□ 1.68
TRAF4-216ENST00000586813 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
TRAF4-216ENST00000586813 MYL6BP14649 208 aa25.55■■□□□ 1.68
TRAF4-216ENST00000586813 OLFM4Q6UX06 510 aa25.55■■□□□ 1.68
TRAF4-216ENST00000586813 TTLL7Q6ZT98 887 aa25.55■■□□□ 1.68
TRAF4-216ENST00000586813 NYXQ9GZU5 481 aa25.55■■□□□ 1.68
TRAF4-216ENST00000586813 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
TRAF4-216ENST00000586813 ALDH1B1P30837 517 aa25.54■■□□□ 1.68
TRAF4-216ENST00000586813 NUTM1Q86Y26 1132 aa25.54■■□□□ 1.68
TRAF4-216ENST00000586813 RIC1Q4ADV7 1423 aa25.54■■□□□ 1.68
TRAF4-216ENST00000586813 CRY2Q49AN0 593 aa25.53■■□□□ 1.68
TRAF4-216ENST00000586813 RTKN2Q8IZC4 609 aa25.53■■□□□ 1.68
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
TRAF4-216ENST00000586813 SNED1Q8TER0 1413 aa25.53■■□□□ 1.68
TRAF4-216ENST00000586813 CHADLQ6NUI6 762 aa25.52■■□□□ 1.68
TRAF4-216ENST00000586813 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
TRAF4-216ENST00000586813 ZBTB3Q9H5J0 574 aa25.52■■□□□ 1.68
TRAF4-216ENST00000586813 ERBB4Q15303 1308 aa25.52■■□□□ 1.68
TRAF4-216ENST00000586813 UBN2Q6ZU65 1347 aa25.52■■□□□ 1.68
TRAF4-216ENST00000586813 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa25.51■■□□□ 1.67
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TRAF4-216ENST00000586813 POTEIP0CG38 1075 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAF4-216ENST00000586813 POTEJP0CG39 1038 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAF4-216ENST00000586813 GPTP24298 496 aa25.5■■□□□ 1.67
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF541Q9H0D2 1346 aa25.5■■□□□ 1.67
TRAF4-216ENST00000586813 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.5■■□□□ 1.67
TRAF4-216ENST00000586813 RALBP1Q15311 655 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAF4-216ENST00000586813 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa25.49■■□□□ 1.67
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TRAF4-216ENST00000586813 SUSD4Q5VX71 490 aa25.47■■□□□ 1.67
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.47■■□□□ 1.67
TRAF4-216ENST00000586813 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
TRAF4-216ENST00000586813 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
TRAF4-216ENST00000586813 LDHDQ86WU2 507 aa25.46■■□□□ 1.67
TRAF4-216ENST00000586813 SYNE4Q8N205 404 aa25.46■■□□□ 1.67
TRAF4-216ENST00000586813 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
TRAF4-216ENST00000586813 NTSR2O95665 410 aa25.45■■□□□ 1.66
TRAF4-216ENST00000586813 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
TRAF4-216ENST00000586813 LRP10Q7Z4F1 713 aa25.45■■□□□ 1.66
TRAF4-216ENST00000586813 PSMD1Q99460 953 aa25.45■■□□□ 1.66
TRAF4-216ENST00000586813 CREBZFQ9NS37 354 aa25.45■■□□□ 1.66
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