RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572010.5

SLC12A4-208, Transcript of solute carrier family 12 member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLC12A4, Length 1,016 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4-208ENST00000572010 STYK1Q6J9G0 422 aa28.29■■■□□ 2.12
SLC12A4-208ENST00000572010 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
SLC12A4-208ENST00000572010 MASTLQ96GX5 879 aa28.28■■■□□ 2.12
SLC12A4-208ENST00000572010 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa28.27■■■□□ 2.12
SLC12A4-208ENST00000572010 SRGNP10124 158 aa28.27■■■□□ 2.12
SLC12A4-208ENST00000572010 SOGA3Q5TF21 947 aa28.27■■■□□ 2.12
SLC12A4-208ENST00000572010 TAOK3Q9H2K8 898 aa28.27■■■□□ 2.12
SLC12A4-208ENST00000572010 SCN7AQ01118 1682 aa28.26■■■□□ 2.12
SLC12A4-208ENST00000572010 NEFMP07197 916 aa28.26■■■□□ 2.11
SLC12A4-208ENST00000572010 DCTN1Q14203 1278 aa28.25■■■□□ 2.11
SLC12A4-208ENST00000572010 JMYQ8N9B5 988 aa28.25■■■□□ 2.11
SLC12A4-208ENST00000572010 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
SLC12A4-208ENST00000572010 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
SLC12A4-208ENST00000572010 TPTE2Q6XPS3 522 aa28.24■■■□□ 2.11
SLC12A4-208ENST00000572010 LTBP3Q9NS15 1303 aa28.23■■■□□ 2.11
SLC12A4-208ENST00000572010 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa28.23■■■□□ 2.11
SLC12A4-208ENST00000572010 POTECB2RU33 542 aa28.21■■■□□ 2.11
SLC12A4-208ENST00000572010 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP28.21■■■□□ 2.11
SLC12A4-208ENST00000572010 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa28.21■■■□□ 2.11
SLC12A4-208ENST00000572010 NBPF26B4DH59 902 aa28.19■■■□□ 2.1
SLC12A4-208ENST00000572010 RGL2O15211 777 aa28.19■■■□□ 2.1
SLC12A4-208ENST00000572010 NPR1P16066 1061 aa28.19■■■□□ 2.1
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SLC12A4-208ENST00000572010 NBPF15Q8N660 670 aa28.19■■■□□ 2.1
SLC12A4-208ENST00000572010 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
SLC12A4-208ENST00000572010 MIS18AQ9NYP9 233 aa28.18■■■□□ 2.1
SLC12A4-208ENST00000572010 TIAM2Q8IVF5 1701 aa28.18■■■□□ 2.1
SLC12A4-208ENST00000572010 FAM177BA6PVY3 158 aa28.17■■■□□ 2.1
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SLC12A4-208ENST00000572010 CCDC93Q567U6 631 aa28.16■■■□□ 2.1
SLC12A4-208ENST00000572010 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
SLC12A4-208ENST00000572010 DDNO94850 711 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
SLC12A4-208ENST00000572010 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
SLC12A4-208ENST00000572010 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa28.14■■■□□ 2.1
SLC12A4-208ENST00000572010 BCORQ6W2J9 1755 aa28.14■■■□□ 2.09
SLC12A4-208ENST00000572010 ALDH1B1P30837 517 aa28.13■■■□□ 2.09
SLC12A4-208ENST00000572010 NGEFQ8N5V2 710 aa28.13■■■□□ 2.09
SLC12A4-208ENST00000572010 C7orf43Q8WVR3 580 aa28.13■■■□□ 2.09
SLC12A4-208ENST00000572010 SLX4Q8IY92 1834 aa28.13■■■□□ 2.09
SLC12A4-208ENST00000572010 HLFQ16534 295 aa28.12■■■□□ 2.09
SLC12A4-208ENST00000572010 CHADLQ6NUI6 762 aa28.12■■■□□ 2.09
SLC12A4-208ENST00000572010 RTKN2Q8IZC4 609 aa28.12■■■□□ 2.09
SLC12A4-208ENST00000572010 IQCA1LA6NCM1 817 aa28.11■■■□□ 2.09
SLC12A4-208ENST00000572010 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
SLC12A4-208ENST00000572010 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP28.1■■■□□ 2.098e-6■■■□□ 17.9
SLC12A4-208ENST00000572010 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
SLC12A4-208ENST00000572010 NYXQ9GZU5 481 aa28.09■■■□□ 2.09
SLC12A4-208ENST00000572010 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
SLC12A4-208ENST00000572010 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
SLC12A4-208ENST00000572010 ERVV-1B6SEH8 477 aa28.08■■■□□ 2.09
SLC12A4-208ENST00000572010 KIF6Q6ZMV9 814 aa28.07■■■□□ 2.08
SLC12A4-208ENST00000572010 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
SLC12A4-208ENST00000572010 NFE2L2Q16236 605 aa28.06■■■□□ 2.08
SLC12A4-208ENST00000572010 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
SLC12A4-208ENST00000572010 PLEKHF1Q96S99 279 aa28.05■■■□□ 2.08
SLC12A4-208ENST00000572010 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa28.05■■■□□ 2.08
SLC12A4-208ENST00000572010 CACNA1SQ13698 1873 aa28.04■■■□□ 2.08
SLC12A4-208ENST00000572010 MYL6BP14649 208 aa28.04■■■□□ 2.08
SLC12A4-208ENST00000572010 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
SLC12A4-208ENST00000572010 CREBZFQ9NS37 354 aa28.04■■■□□ 2.08
SLC12A4-208ENST00000572010 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa28.03■■■□□ 2.08
SLC12A4-208ENST00000572010 POTEIP0CG38 1075 aa28.03■■■□□ 2.08
SLC12A4-208ENST00000572010 POTEJP0CG39 1038 aa28.03■■■□□ 2.08
SLC12A4-208ENST00000572010 OLFM4Q6UX06 510 aa28.03■■■□□ 2.08
SLC12A4-208ENST00000572010 LDHDQ86WU2 507 aa28.03■■■□□ 2.08
SLC12A4-208ENST00000572010 SYNE4Q8N205 404 aa28.03■■■□□ 2.08
SLC12A4-208ENST00000572010 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa28.03■■■□□ 2.08
SLC12A4-208ENST00000572010 NUTM1Q86Y26 1132 aa28.02■■■□□ 2.08
SLC12A4-208ENST00000572010 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
SLC12A4-208ENST00000572010 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
SLC12A4-208ENST00000572010 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
SLC12A4-208ENST00000572010 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
SLC12A4-208ENST00000572010 IARSP41252 1262 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
SLC12A4-208ENST00000572010 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
SLC12A4-208ENST00000572010 TTLL7Q6ZT98 887 aa28■■■□□ 2.07
SLC12A4-208ENST00000572010 TNS4Q8IZW8 715 aa28■■■□□ 2.07
SLC12A4-208ENST00000572010 HACL1Q9UJ83 578 aa28■■■□□ 2.07
SLC12A4-208ENST00000572010 CLEC11AQ9Y240 323 aa28■■■□□ 2.07
SLC12A4-208ENST00000572010 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
SLC12A4-208ENST00000572010 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa27.99■■■□□ 2.07
SLC12A4-208ENST00000572010 JDP2Q8WYK2 163 aa27.99■■■□□ 2.07
SLC12A4-208ENST00000572010 ZBTB3Q9H5J0 574 aa27.99■■■□□ 2.07
SLC12A4-208ENST00000572010 GPTP24298 496 aa27.98■■■□□ 2.07
SLC12A4-208ENST00000572010 CRY2Q49AN0 593 aa27.98■■■□□ 2.07
SLC12A4-208ENST00000572010 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
SLC12A4-208ENST00000572010 ZNF541Q9H0D2 1346 aa27.97■■■□□ 2.07
SLC12A4-208ENST00000572010 PSMD1Q99460 953 aa27.97■■■□□ 2.07
SLC12A4-208ENST00000572010 FZD9O00144 591 aa27.96■■■□□ 2.07
SLC12A4-208ENST00000572010 GRIPAP1Q4V328 841 aa27.96■■■□□ 2.07
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SLC12A4-208ENST00000572010 EPHX2P34913 555 aa27.95■■■□□ 2.06
SLC12A4-208ENST00000572010 SUSD4Q5VX71 490 aa27.95■■■□□ 2.06
SLC12A4-208ENST00000572010 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
SLC12A4-208ENST00000572010 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
SLC12A4-208ENST00000572010 ERBB4Q15303 1308 aa27.94■■■□□ 2.06
SLC12A4-208ENST00000572010 LAMB4A4D0S4 1761 aa27.94■■■□□ 2.06
SLC12A4-208ENST00000572010 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
SLC12A4-208ENST00000572010 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa27.94■■■□□ 2.06
SLC12A4-208ENST00000572010 ZNF34Q8IZ26 560 aa27.94■■■□□ 2.06
SLC12A4-208ENST00000572010 GPC2Q8N158 579 aa27.94■■■□□ 2.06
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