RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567489.5

C16orf59-208, Transcript of Uncharacterized protein C16orf59, human

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene C16orf59, Length 907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C16orf59-208	ENST00000567489	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
C16orf59-208	ENST00000567489	CHADL	Q6NUI6	762 aa		28.78	■■■□□ 2.2
C16orf59-208	ENST00000567489	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	28.77	■■■□□ 2.2
C16orf59-208	ENST00000567489	PRKAR2B	P31323	418 aa		28.77	■■■□□ 2.2
C16orf59-208	ENST00000567489	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		28.76	■■■□□ 2.2
C16orf59-208	ENST00000567489	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	28.76	■■■□□ 2.19
C16orf59-208	ENST00000567489	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		28.76	■■■□□ 2.19
C16orf59-208	ENST00000567489	CFAP53	Q96M91	514 aa		28.76	■■■□□ 2.19
C16orf59-208	ENST00000567489	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
C16orf59-208	ENST00000567489	CREBZF	Q9NS37	354 aa		28.75	■■■□□ 2.19
C16orf59-208	ENST00000567489	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		28.75	■■■□□ 2.19
C16orf59-208	ENST00000567489	USP16	Q9Y5T5	823 aa		28.75	■■■□□ 2.19
C16orf59-208	ENST00000567489	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
C16orf59-208	ENST00000567489	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		28.74	■■■□□ 2.19
C16orf59-208	ENST00000567489	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		28.73	■■■□□ 2.19
C16orf59-208	ENST00000567489	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		28.73	■■■□□ 2.19
C16orf59-208	ENST00000567489	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		28.72	■■■□□ 2.19
C16orf59-208	ENST00000567489	POTEI	P0CG38	1075 aa		28.72	■■■□□ 2.19
C16orf59-208	ENST00000567489	POTEJ	P0CG39	1038 aa		28.72	■■■□□ 2.19
C16orf59-208	ENST00000567489	CCDC93	Q567U6	631 aa		28.72	■■■□□ 2.19
C16orf59-208	ENST00000567489	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	28.72	■■■□□ 2.19
C16orf59-208	ENST00000567489	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	28.72	■■■□□ 2.19
C16orf59-208	ENST00000567489	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	28.71	■■■□□ 2.19
C16orf59-208	ENST00000567489	NUDC	Q9Y266	331 aa		28.71	■■■□□ 2.19
C16orf59-208	ENST00000567489	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		28.7	■■■□□ 2.18
C16orf59-208	ENST00000567489	NPR1	P16066	1061 aa		28.7	■■■□□ 2.18
C16orf59-208	ENST00000567489	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	28.69	■■■□□ 2.18
C16orf59-208	ENST00000567489	SLX4	Q8IY92	1834 aa		28.69	■■■□□ 2.18
C16orf59-208	ENST00000567489	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		28.68	■■■□□ 2.18
C16orf59-208	ENST00000567489	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		28.67	■■■□□ 2.18
C16orf59-208	ENST00000567489	MCM10	Q7L590	875 aa		28.67	■■■□□ 2.18
C16orf59-208	ENST00000567489	LDHD	Q86WU2	507 aa		28.67	■■■□□ 2.18
C16orf59-208	ENST00000567489	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		28.67	■■■□□ 2.18
C16orf59-208	ENST00000567489	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	28.67	■■■□□ 2.18
C16orf59-208	ENST00000567489	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	28.66	■■■□□ 2.18
C16orf59-208	ENST00000567489	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	28.66	■■■□□ 2.18
C16orf59-208	ENST00000567489	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	28.66	■■■□□ 2.18
C16orf59-208	ENST00000567489	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	28.66	■■■□□ 2.18
C16orf59-208	ENST00000567489	PCNT	O95613	3336 aa		28.65	■■■□□ 2.18
C16orf59-208	ENST00000567489	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	28.65	■■■□□ 2.18
C16orf59-208	ENST00000567489	FAM177B	A6PVY3	158 aa		28.64	■■■□□ 2.18
C16orf59-208	ENST00000567489	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	28.64	■■■□□ 2.18
C16orf59-208	ENST00000567489	RGL2	O15211	777 aa		28.63	■■■□□ 2.17
C16orf59-208	ENST00000567489	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	28.62	■■■□□ 2.17
C16orf59-208	ENST00000567489	NBPF26	B4DH59	902 aa		28.62	■■■□□ 2.17
C16orf59-208	ENST00000567489	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	28.62	■■■□□ 2.17
C16orf59-208	ENST00000567489	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
C16orf59-208	ENST00000567489	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		28.62	■■■□□ 2.17
C16orf59-208	ENST00000567489	NBPF15	Q8N660	670 aa		28.62	■■■□□ 2.17
C16orf59-208	ENST00000567489	PASK	Q96RG2	1323 aa		28.62	■■■□□ 2.17
C16orf59-208	ENST00000567489	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		28.62	■■■□□ 2.17
C16orf59-208	ENST00000567489	CNTNAP1	P78357	1384 aa		28.62	■■■□□ 2.17
C16orf59-208	ENST00000567489	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	28.61	■■■□□ 2.17
C16orf59-208	ENST00000567489	DCTN1	Q14203	1278 aa		28.61	■■■□□ 2.17
C16orf59-208	ENST00000567489	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		28.61	■■■□□ 2.17
C16orf59-208	ENST00000567489	CACNA1S	Q13698	1873 aa		28.61	■■■□□ 2.17
C16orf59-208	ENST00000567489	HACL1	Q9UJ83	578 aa		28.6	■■■□□ 2.17
C16orf59-208	ENST00000567489	ALDH1B1	P30837	517 aa		28.59	■■■□□ 2.17
C16orf59-208	ENST00000567489	OLFM4	Q6UX06	510 aa		28.59	■■■□□ 2.17
C16orf59-208	ENST00000567489	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		28.59	■■■□□ 2.17
C16orf59-208	ENST00000567489	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
C16orf59-208	ENST00000567489	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		28.57	■■■□□ 2.16
C16orf59-208	ENST00000567489	PPP2R1A	P30153	589 aa		28.56	■■■□□ 2.16
C16orf59-208	ENST00000567489	EPHX2	P34913	555 aa		28.56	■■■□□ 2.16
C16orf59-208	ENST00000567489	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	28.56	■■■□□ 2.16
C16orf59-208	ENST00000567489	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	28.56	■■■□□ 2.16
C16orf59-208	ENST00000567489	HLF	Q16534	295 aa		28.56	■■■□□ 2.16
C16orf59-208	ENST00000567489	AIDA	Q96BJ3	306 aa		28.56	■■■□□ 2.16
C16orf59-208	ENST00000567489	FOXN1	O15353	648 aa		28.55	■■■□□ 2.16
C16orf59-208	ENST00000567489	SYNE4	Q8N205	404 aa		28.55	■■■□□ 2.16
C16orf59-208	ENST00000567489	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	28.54	■■■□□ 2.16
C16orf59-208	ENST00000567489	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	28.54	■■■□□ 2.16
C16orf59-208	ENST00000567489	SCN4A	P35499	1836 aa		28.54	■■■□□ 2.16
C16orf59-208	ENST00000567489	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		28.53	■■■□□ 2.16
C16orf59-208	ENST00000567489	VEGFB	P49765	207 aa		28.53	■■■□□ 2.16
C16orf59-208	ENST00000567489	NYX	Q9GZU5	481 aa		28.53	■■■□□ 2.16
C16orf59-208	ENST00000567489	FZD9	O00144	591 aa		28.52	■■■□□ 2.16
C16orf59-208	ENST00000567489	NGEF	Q8N5V2	710 aa		28.52	■■■□□ 2.16
C16orf59-208	ENST00000567489	JDP2	Q8WYK2	163 aa		28.52	■■■□□ 2.16
C16orf59-208	ENST00000567489	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		28.52	■■■□□ 2.16
C16orf59-208	ENST00000567489	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		28.51	■■■□□ 2.15
C16orf59-208	ENST00000567489	NEFM	P07197	916 aa		28.5	■■■□□ 2.15
C16orf59-208	ENST00000567489	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	28.5	■■■□□ 2.15
C16orf59-208	ENST00000567489	GPC2	Q8N158	579 aa		28.5	■■■□□ 2.15
C16orf59-208	ENST00000567489	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		28.49	■■■□□ 2.15
C16orf59-208	ENST00000567489	CNTROB	Q8N137	903 aa		28.49	■■■□□ 2.15
C16orf59-208	ENST00000567489	PSMD1	Q99460	953 aa		28.49	■■■□□ 2.15
C16orf59-208	ENST00000567489	ABCC12	Q96J65	1359 aa		28.49	■■■□□ 2.15
C16orf59-208	ENST00000567489	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		28.48	■■■□□ 2.15
C16orf59-208	ENST00000567489	CRY2	Q49AN0	593 aa		28.48	■■■□□ 2.15
C16orf59-208	ENST00000567489	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	28.48	■■■□□ 2.15
C16orf59-208	ENST00000567489	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		28.48	■■■□□ 2.15
C16orf59-208	ENST00000567489	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		28.48	■■■□□ 2.15
C16orf59-208	ENST00000567489	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	28.48	■■■□□ 2.15
C16orf59-208	ENST00000567489	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	28.48	■■■□□ 2.15
C16orf59-208	ENST00000567489	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	28.47	■■■□□ 2.15
C16orf59-208	ENST00000567489	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		28.46	■■■□□ 2.15
C16orf59-208	ENST00000567489	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	28.46	■■■□□ 2.15
C16orf59-208	ENST00000567489	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		28.46	■■■□□ 2.15
C16orf59-208	ENST00000567489	RASSF10	A6NK89	507 aa		28.44	■■■□□ 2.14

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