RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566635.5

HERC2-208, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HERC2, Length 2,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2-208ENST00000566635 LINS1Q8NG48 757 aa22.19■■□□□ 1.14
HERC2-208ENST00000566635 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.19■■□□□ 1.14
HERC2-208ENST00000566635 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HERC2-208ENST00000566635 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.19■■□□□ 1.14
HERC2-208ENST00000566635 RREB1Q92766 1687 aa22.19■■□□□ 1.14
HERC2-208ENST00000566635 ALDH1L1O75891 902 aa22.19■■□□□ 1.14
HERC2-208ENST00000566635 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HERC2-208ENST00000566635 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HERC2-208ENST00000566635 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
HERC2-208ENST00000566635 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
HERC2-208ENST00000566635 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.18■■□□□ 1.14
HERC2-208ENST00000566635 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.17■■□□□ 1.14
HERC2-208ENST00000566635 SMC5Q8IY18 1101 aa22.17■■□□□ 1.14
HERC2-208ENST00000566635 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.17■■□□□ 1.14
HERC2-208ENST00000566635 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.16■■□□□ 1.14
HERC2-208ENST00000566635 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HERC2-208ENST00000566635 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HERC2-208ENST00000566635 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.16■■□□□ 1.14
HERC2-208ENST00000566635 LY75O60449 1722 aa22.15■■□□□ 1.14
HERC2-208ENST00000566635 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.15■■□□□ 1.14
HERC2-208ENST00000566635 RGS3P49796 1198 aa22.15■■□□□ 1.14
HERC2-208ENST00000566635 KCNQ4P56696 695 aa22.15■■□□□ 1.14
HERC2-208ENST00000566635 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HERC2-208ENST00000566635 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HERC2-208ENST00000566635 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HERC2-208ENST00000566635 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.13■■□□□ 1.13
HERC2-208ENST00000566635 GRM8O00222 908 aa22.12■■□□□ 1.13
HERC2-208ENST00000566635 GCKRQ14397 625 aa22.12■■□□□ 1.13
HERC2-208ENST00000566635 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.12■■□□□ 1.13
HERC2-208ENST00000566635 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.12■■□□□ 1.13
HERC2-208ENST00000566635 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HERC2-208ENST00000566635 ARXQ96QS3 562 aa22.12■■□□□ 1.13
HERC2-208ENST00000566635 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.11■■□□□ 1.13
HERC2-208ENST00000566635 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HERC2-208ENST00000566635 GCC1Q96CN9 775 aa22.11■■□□□ 1.13
HERC2-208ENST00000566635 UTYO14607 1347 aa22.11■■□□□ 1.13
HERC2-208ENST00000566635 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
HERC2-208ENST00000566635 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.1■■□□□ 1.13
HERC2-208ENST00000566635 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.1■■□□□ 1.13
HERC2-208ENST00000566635 ATP8B2P98198 1209 aa22.09■■□□□ 1.13
HERC2-208ENST00000566635 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
HERC2-208ENST00000566635 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.09■■□□□ 1.13
HERC2-208ENST00000566635 HMMRO75330 724 aa22.09■■□□□ 1.13
HERC2-208ENST00000566635 RXRBP28702 533 aa22.09■■□□□ 1.13
HERC2-208ENST00000566635 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
HERC2-208ENST00000566635 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
HERC2-208ENST00000566635 SUCLG2Q96I99 432 aa22.09■■□□□ 1.13
HERC2-208ENST00000566635 DCTPP1Q9H773 170 aa22.09■■□□□ 1.13
HERC2-208ENST00000566635 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.08■■□□□ 1.13
HERC2-208ENST00000566635 NUCB1Q02818 461 aa22.08■■□□□ 1.13
HERC2-208ENST00000566635 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.07■■□□□ 1.12
HERC2-208ENST00000566635 NUP98P52948 1817 aa22.07■■□□□ 1.12
HERC2-208ENST00000566635 PDE4AP27815 886 aa22.07■■□□□ 1.12
HERC2-208ENST00000566635 HLFQ16534 295 aa22.07■■□□□ 1.12
HERC2-208ENST00000566635 POTEAQ6S8J7 498 aa22.07■■□□□ 1.12
HERC2-208ENST00000566635 KAZALD1Q96I82 304 aa22.07■■□□□ 1.12
HERC2-208ENST00000566635 LNPKQ9C0E8 428 aa22.07■■□□□ 1.12
HERC2-208ENST00000566635 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
HERC2-208ENST00000566635 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.06■■□□□ 1.12
HERC2-208ENST00000566635 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.06■■□□□ 1.12
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HERC2-208ENST00000566635 TRIM37O94972 964 aa22.06■■□□□ 1.12
HERC2-208ENST00000566635 A0A087WZG4 1122 aa22.05■■□□□ 1.12
HERC2-208ENST00000566635 TCIRG1Q13488 830 aa22.05■■□□□ 1.12
HERC2-208ENST00000566635 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.05■■□□□ 1.12
HERC2-208ENST00000566635 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
HERC2-208ENST00000566635 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.05■■□□□ 1.12
HERC2-208ENST00000566635 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.05■■□□□ 1.12
HERC2-208ENST00000566635 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
HERC2-208ENST00000566635 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
HERC2-208ENST00000566635 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.04■■□□□ 1.12
HERC2-208ENST00000566635 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.04■■□□□ 1.12
HERC2-208ENST00000566635 COL15A1P39059 1388 aa22.04■■□□□ 1.12
HERC2-208ENST00000566635 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
HERC2-208ENST00000566635 SSH3Q8TE77 659 aa22.04■■□□□ 1.12
HERC2-208ENST00000566635 APBB1O00213 710 aa22.03■■□□□ 1.12
HERC2-208ENST00000566635 SRGAP3O43295 1099 aa22.03■■□□□ 1.12
HERC2-208ENST00000566635 CASP7P55210 303 aa22.03■■□□□ 1.12
HERC2-208ENST00000566635 POLA2Q14181 598 aa22.03■■□□□ 1.12
HERC2-208ENST00000566635 BCORQ6W2J9 1755 aa22.03■■□□□ 1.12
HERC2-208ENST00000566635 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.03■■□□□ 1.12
HERC2-208ENST00000566635 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.03■■□□□ 1.12
HERC2-208ENST00000566635 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.03■■□□□ 1.12
HERC2-208ENST00000566635 C4BP0C0L5 1744 aa22.02■■□□□ 1.12
HERC2-208ENST00000566635 GPTP24298 496 aa22.01■■□□□ 1.11
HERC2-208ENST00000566635 MTX1Q13505 466 aa22.01■■□□□ 1.11
HERC2-208ENST00000566635 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
HERC2-208ENST00000566635 SMIM5Q71RC9 77 aa22.01■■□□□ 1.11
HERC2-208ENST00000566635 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.01■■□□□ 1.11
HERC2-208ENST00000566635 ERVV-1B6SEH8 477 aa22■■□□□ 1.11
HERC2-208ENST00000566635 H7C1W4 665 aa22■■□□□ 1.11
HERC2-208ENST00000566635 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
HERC2-208ENST00000566635 BCL11AQ9H165 835 aa22■■□□□ 1.11
HERC2-208ENST00000566635 SCN7AQ01118 1682 aa21.99■■□□□ 1.11
HERC2-208ENST00000566635 CAMTA2O94983 1202 aa21.99■■□□□ 1.11
HERC2-208ENST00000566635 LRRC4BQ9NT99 713 aa21.99■■□□□ 1.11
HERC2-208ENST00000566635 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
HERC2-208ENST00000566635 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.98■■□□□ 1.11
HERC2-208ENST00000566635 GNPATO15228 680 aa21.97■■□□□ 1.11
HERC2-208ENST00000566635 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
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