RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 USP16Q9Y5T5 823 aa26.07■■□□□ 1.76
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IL17RAQ96F46 866 aa25.98■■□□□ 1.75
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NBPF15Q8N660 670 aa25.91■■□□□ 1.74
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EVI5LQ96CN4 794 aa25.91■■□□□ 1.74
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa25.9■■□□□ 1.74
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25.89■■□□□ 1.73
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa25.89■■□□□ 1.73
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SIL1Q9H173 461 aa25.87■■□□□ 1.73
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BTG4Q9NY30 223 aa25.87■■□□□ 1.73
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PALD1Q9ULE6 856 aa25.87■■□□□ 1.73
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CASP7P55210 303 aa25.86■■□□□ 1.73
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.86■■□□□ 1.73
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 H7C1W4 665 aa25.84■■□□□ 1.73
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 A1BGP04217 495 aa25.84■■□□□ 1.73
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.84■■□□□ 1.73
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GOLGA6L22H0YM25 854 aa25.84■■□□□ 1.73
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 VSIG10Q8N0Z9 540 aa25.84■■□□□ 1.73
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IL25Q9H293 177 aa25.84■■□□□ 1.73
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TTLL7Q6ZT98 887 aa25.83■■□□□ 1.73
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC191Q8NCU4 936 aa25.83■■□□□ 1.73
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SSFA2P28290 1259 aa25.82■■□□□ 1.72
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
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