RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559312.5

NUMB-231, Transcript of NUMB, endocytic adaptor protein, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUMB, Length 1,439 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUMB-231	ENST00000559312	PSME1	Q06323	249 aa		10.35	□□□□□ -0.75
NUMB-231	ENST00000559312	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
NUMB-231	ENST00000559312	TMC1	Q8TDI8	760 aa		10.35	□□□□□ -0.75
NUMB-231	ENST00000559312	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		10.35	□□□□□ -0.75
NUMB-231	ENST00000559312	MAP10	Q9P2G4	905 aa		10.35	□□□□□ -0.75
NUMB-231	ENST00000559312	PHLPP1	O60346	1717 aa		10.35	□□□□□ -0.75
NUMB-231	ENST00000559312	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		10.35	□□□□□ -0.75
NUMB-231	ENST00000559312	SLC19A1	P41440	591 aa		10.34	□□□□□ -0.75
NUMB-231	ENST00000559312	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
NUMB-231	ENST00000559312	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		10.34	□□□□□ -0.75
NUMB-231	ENST00000559312	SNRK	Q9NRH2	765 aa		10.34	□□□□□ -0.75
NUMB-231	ENST00000559312	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
NUMB-231	ENST00000559312	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		10.34	□□□□□ -0.75
NUMB-231	ENST00000559312	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		10.34	□□□□□ -0.75
NUMB-231	ENST00000559312		A0A1W2PP64	1363 aa		10.34	□□□□□ -0.75
NUMB-231	ENST00000559312	SBNO1	A3KN83	1393 aa		10.34	□□□□□ -0.75
NUMB-231	ENST00000559312	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		10.34	□□□□□ -0.75
NUMB-231	ENST00000559312	USP6	P35125	1406 aa		10.34	□□□□□ -0.75
NUMB-231	ENST00000559312	APBB1	O00213	710 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312	FLII	Q13045	1269 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312	NR6A1	Q15406	480 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312	SSH2	Q76I76	1423 aa		10.32	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		10.32	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		10.32	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		10.31	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		10.31	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		10.31	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312	HSPA1L	P34931	641 aa		10.31	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312	TRIM32	Q13049	653 aa		10.31	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312	MCM6	Q14566	821 aa		10.31	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		10.31	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		10.31	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312	ARHGEF10	O15013	1369 aa		10.3	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312	SPRYD7	Q5W111	196 aa		10.3	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312	PNMA1	Q8ND90	353 aa		10.3	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		10.3	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312	ALS2	Q96Q42	1657 aa		10.3	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312	SHPRH	Q149N8	1683 aa		10.29	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		10.29	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312	JCAD	Q9P266	1359 aa		10.29	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		10.28	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312	PANK3	Q9H999	370 aa		10.28	□□□□□ -0.76
NUMB-231	ENST00000559312	ABTB2	Q8N961	1025 aa		10.27	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		10.27	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		10.27	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		10.27	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		10.27	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	PIK3C2A	O00443	1686 aa		10.26	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	USP54	Q70EL1	1684 aa		10.26	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	USP31	Q70CQ4	1352 aa		10.26	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		10.26	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		10.26	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	WNT7B	P56706	349 aa		10.26	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	NBPF14	Q5TI25	921 aa		10.26	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	NLRP13	Q86W25	1043 aa		10.26	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	BAP1	Q92560	729 aa		10.26	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	10.26	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		10.26	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	10.25	□□□□□ -0.77	1e-7	■■□□□ 14.4
NUMB-231	ENST00000559312	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	NSD2	O96028	1365 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	LINC01559	Q495D7	138 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF511	Q8NB15	262 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	USP19	O94966	1318 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	FYB1	O15117	783 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	SH3BP2	P78314	561 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	SKOR1	P84550	965 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	NME9	Q86XW9	330 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	COG3	Q96JB2	828 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	SLIT3	O75094	1523 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	ABCA3	Q99758	1704 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
NUMB-231	ENST00000559312	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77

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