RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555881.5

COCH-209, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 2

Gene COCH, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-209ENST00000555881 NFIXQ14938 502 aa28.21■■■□□ 2.11
COCH-209ENST00000555881 CCDC30Q5VVM6 783 aa28.21■■■□□ 2.11
COCH-209ENST00000555881 CLEC4GQ6UXB4 293 aa28.21■■■□□ 2.11
COCH-209ENST00000555881 ZNF652Q9Y2D9 606 aa28.21■■■□□ 2.11
COCH-209ENST00000555881 NRXN2Q9P2S2 1712 aa28.21■■■□□ 2.11
COCH-209ENST00000555881 ERVV-1B6SEH8 477 aa28.2■■■□□ 2.1
COCH-209ENST00000555881 DDR1Q08345 913 aa28.2■■■□□ 2.1
COCH-209ENST00000555881 HYPKQ9NX55 129 aa28.2■■■□□ 2.1
COCH-209ENST00000555881 PARP3Q9Y6F1 533 aa28.2■■■□□ 2.1
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COCH-209ENST00000555881 KIF13BQ9NQT8 1826 aa28.18■■■□□ 2.1
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COCH-209ENST00000555881 TBC1D9BQ66K14 1250 aa28.18■■■□□ 2.1
COCH-209ENST00000555881 XAGE3Q8WTP9 111 aa28.18■■■□□ 2.1
COCH-209ENST00000555881 CACNA1FO60840 1977 aa28.18■■■□□ 2.1
COCH-209ENST00000555881 VAMP4O75379 141 aa28.17■■■□□ 2.1
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COCH-209ENST00000555881 ZBTB3Q9H5J0 574 aa28.16■■■□□ 2.1
COCH-209ENST00000555881 C10orf71Q711Q0 1435 aa28.16■■■□□ 2.1
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COCH-209ENST00000555881 ATP10DQ9P241 1426 aa28.15■■■□□ 2.1
COCH-209ENST00000555881 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa28.14■■■□□ 2.1
COCH-209ENST00000555881 SYT17Q9BSW7 474 aa28.14■■■□□ 2.1
COCH-209ENST00000555881 STK31Q9BXU1 1019 aa28.14■■■□□ 2.1
COCH-209ENST00000555881 CD2APQ9Y5K6 639 aa28.14■■■□□ 2.1
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COCH-209ENST00000555881 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa28.12■■■□□ 2.09
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COCH-209ENST00000555881 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
COCH-209ENST00000555881 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP28.1■■■□□ 2.09
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COCH-209ENST00000555881 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa28.08■■■□□ 2.09
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COCH-209ENST00000555881 NLGN2Q8NFZ4 835 aa28.06■■■□□ 2.08
COCH-209ENST00000555881 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa28.04■■■□□ 2.08
COCH-209ENST00000555881 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
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COCH-209ENST00000555881 DDX58O95786 925 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
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COCH-209ENST00000555881 PXDNLA1KZ92 1463 aa28.03■■■□□ 2.08
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COCH-209ENST00000555881 G2E3Q7L622 706 aa28.03■■■□□ 2.08
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COCH-209ENST00000555881 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
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COCH-209ENST00000555881 RIC3Q7Z5B4 369 aa28.02■■■□□ 2.08
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COCH-209ENST00000555881 TPTE2Q6XPS3 522 aa28■■■□□ 2.07
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COCH-209ENST00000555881 DLEC1Q9Y238 1755 aa27.99■■■□□ 2.07
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COCH-209ENST00000555881 SUSD4Q5VX71 490 aa27.97■■■□□ 2.07
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COCH-209ENST00000555881 BRIP1Q9BX63 1249 aa27.97■■■□□ 2.07
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COCH-209ENST00000555881 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
COCH-209ENST00000555881 RNF123Q5XPI4 1314 aa27.94■■■□□ 2.06
COCH-209ENST00000555881 RIC1Q4ADV7 1423 aa27.94■■■□□ 2.06
COCH-209ENST00000555881 DPEP1P16444 411 aa27.94■■■□□ 2.06
COCH-209ENST00000555881 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
COCH-209ENST00000555881 A0A0G2JLW4 131 aa27.93■■■□□ 2.06
COCH-209ENST00000555881 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa27.93■■■□□ 2.06
COCH-209ENST00000555881 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
COCH-209ENST00000555881 PDE6BP35913 854 aa27.93■■■□□ 2.06
COCH-209ENST00000555881 MYD88Q99836 296 aa27.93■■■□□ 2.06
COCH-209ENST00000555881 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
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