RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552253.1

PTPRB-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 2,373 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-211ENST00000552253 BTBD11A6QL63 1104 aa7.16□□□□□ -1.26
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PTPRB-211ENST00000552253 LRP10Q7Z4F1 713 aa7.12□□□□□ -1.27
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PTPRB-211ENST00000552253 F13A1P00488 732 aa7.12□□□□□ -1.27
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PTPRB-211ENST00000552253 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-211ENST00000552253 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-211ENST00000552253 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-211ENST00000552253 TAF6LQ9Y6J9 622 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-211ENST00000552253 C5P01031 1676 aa7.11□□□□□ -1.27
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