RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546125.1

KNTC1-215, Transcript of kinetochore associated 1, human

TSL 5

Gene KNTC1, Length 624 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KNTC1-215	ENST00000546125	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	C2CD2L	O14523	706 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	MAP3K10	Q02779	954 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	TNP2	Q05952	138 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	ACD	Q96AP0	544 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	ARHGEF15	O94989	841 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	BCR	P11274	1271 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	CD33	P20138	364 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	MAP2K3	P46734	347 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	GSK3A	P49840	483 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	IGFBP4	P22692	258 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	STRN4	Q9NRL3	753 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	MARK1	Q9P0L2	795 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	PRMT3	O60678	531 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	ATG7	O95352	703 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	FAM157B	P0CG42	384 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	WEE1	P30291	646 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	POTEA	Q6S8J7	498 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	STK32A	Q8WU08	396 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	SUSD3	Q96L08	255 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	CEP63	Q96MT8	703 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	HCN2	Q9UL51	889 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KNTC1-215	ENST00000546125	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	OIP5	O43482	229 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	GGA1	Q9UJY5	639 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	EFS	O43281	561 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	FOXO3	O43524	673 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	LAMC2	Q13753	1193 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	GRIN2C	Q14957	1233 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	RTN1	Q16799	776 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	GDF11	O95390	407 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	ARAF	P10398	606 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	FAM182B	Q5T319	152 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	RRAGC	Q9HB90	399 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	BRD7	Q9NPI1	651 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	KLK14	Q9P0G3	267 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	KLF15	Q9UIH9	416 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	AMPD1	P23109	780 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	IRS1	P35568	1242 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	RASSF7	Q02833	373 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	TYRO3	Q06418	890 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	DGKZ	Q13574	1117 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	HIF1A	Q16665	826 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	BTBD6	Q96KE9	485 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	SLC30A3	Q99726	388 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	ARID3A	Q99856	593 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	BCS1L	Q9Y276	419 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	EPX	P11678	715 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	ADH6	P28332	368 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	SPEM2	Q0P670	501 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KNTC1-215	ENST00000546125	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms