RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538734.6

MIR9-3HG-202, Transcript of MIR9-3 host gene, humanhuman

TSL 2

Gene MIR9-3HG, Length 1,877 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIR9-3HG-202ENST00000538734 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
MIR9-3HG-202ENST00000538734 GCC1Q96CN9 775 aa25.55■■□□□ 1.68
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ITPK1Q13572 414 aa25.54■■□□□ 1.68
MIR9-3HG-202ENST00000538734 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SBF2Q86WG5 1849 aa25.53■■□□□ 1.68
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NEURL1BA8MQ27 555 aa25.53■■□□□ 1.68
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa25.53■■□□□ 1.68
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
MIR9-3HG-202ENST00000538734 BTAF1O14981 1849 aa25.53■■□□□ 1.68
MIR9-3HG-202ENST00000538734 DCTPP1Q9H773 170 aa25.52■■□□□ 1.68
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
MIR9-3HG-202ENST00000538734 UTYO14607 1347 aa25.52■■□□□ 1.68
MIR9-3HG-202ENST00000538734 BRWD3Q6RI45 1802 aa25.52■■□□□ 1.68
MIR9-3HG-202ENST00000538734 GRM8O00222 908 aa25.51■■□□□ 1.67
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ATP8B2P98198 1209 aa25.51■■□□□ 1.67
MIR9-3HG-202ENST00000538734 KRT27Q7Z3Y8 459 aa25.51■■□□□ 1.67
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.51■■□□□ 1.67
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ZNF831Q5JPB2 1677 aa25.51■■□□□ 1.67
MIR9-3HG-202ENST00000538734 HMMRO75330 724 aa25.51■■□□□ 1.67
MIR9-3HG-202ENST00000538734 GCKRQ14397 625 aa25.51■■□□□ 1.67
MIR9-3HG-202ENST00000538734 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ZBTB3Q9H5J0 574 aa25.51■■□□□ 1.67
MIR9-3HG-202ENST00000538734 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RGS3P49796 1198 aa25.5■■□□□ 1.67
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CCDC87Q9NVE4 849 aa25.5■■□□□ 1.67
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CRKLP46109 303 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NUCB1Q02818 461 aa25.49■■□□□ 1.67
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa25.49■■□□□ 1.67
MIR9-3HG-202ENST00000538734 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.49■■□□□ 1.67
MIR9-3HG-202ENST00000538734 HDAC5Q9UQL6 1122 aa25.49■■□□□ 1.67
MIR9-3HG-202ENST00000538734 FAM196AQ6ZSG2 479 aa25.47■■□□□ 1.67
MIR9-3HG-202ENST00000538734 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
MIR9-3HG-202ENST00000538734 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa25.47■■□□□ 1.67
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MIR9-3HG-202ENST00000538734 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa25.45■■□□□ 1.67
MIR9-3HG-202ENST00000538734 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.45■■□□□ 1.67
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CHD1LQ86WJ1 897 aa25.45■■□□□ 1.67
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ARXQ96QS3 562 aa25.45■■□□□ 1.67
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RREB1Q92766 1687 aa25.45■■□□□ 1.66
MIR9-3HG-202ENST00000538734 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RXRBP28702 533 aa25.45■■□□□ 1.66
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TCIRG1Q13488 830 aa25.44■■□□□ 1.66
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa25.44■■□□□ 1.66
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
MIR9-3HG-202ENST00000538734 LINC00116Q8NCU8 138 aa25.43■■□□□ 1.66
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SSH3Q8TE77 659 aa25.43■■□□□ 1.66
MIR9-3HG-202ENST00000538734 KAZALD1Q96I82 304 aa25.43■■□□□ 1.66
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.43■■□□□ 1.66
MIR9-3HG-202ENST00000538734 KCNQ4P56696 695 aa25.43■■□□□ 1.66
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CCDC191Q8NCU4 936 aa25.43■■□□□ 1.66
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SUCLG2Q96I99 432 aa25.43■■□□□ 1.66
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ISCA1Q9BUE6 129 aa25.43■■□□□ 1.66
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
MIR9-3HG-202ENST00000538734 A0A087WZG4 1122 aa25.42■■□□□ 1.66
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MIR9-3HG-202ENST00000538734 MTX1Q13505 466 aa25.42■■□□□ 1.66
MIR9-3HG-202ENST00000538734 POLA2Q14181 598 aa25.42■■□□□ 1.66
MIR9-3HG-202ENST00000538734 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
MIR9-3HG-202ENST00000538734 HLFQ16534 295 aa25.41■■□□□ 1.66
MIR9-3HG-202ENST00000538734 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
MIR9-3HG-202ENST00000538734 LNPKQ9C0E8 428 aa25.41■■□□□ 1.66
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa25.41■■□□□ 1.66
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.4■■□□□ 1.66
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SRGAP3O43295 1099 aa25.4■■□□□ 1.66
MIR9-3HG-202ENST00000538734 LY75O60449 1722 aa25.4■■□□□ 1.66
MIR9-3HG-202ENST00000538734 H7C1W4 665 aa25.4■■□□□ 1.66
MIR9-3HG-202ENST00000538734 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa25.39■■□□□ 1.66
MIR9-3HG-202ENST00000538734 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
MIR9-3HG-202ENST00000538734 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CASP7P55210 303 aa25.38■■□□□ 1.65
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa25.38■■□□□ 1.65
MIR9-3HG-202ENST00000538734 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa25.38■■□□□ 1.65
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
MIR9-3HG-202ENST00000538734 COL15A1P39059 1388 aa25.37■■□□□ 1.65
MIR9-3HG-202ENST00000538734 EP400Q96L91 3159 aa25.37■■□□□ 1.65
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TRIM37O94972 964 aa25.36■■□□□ 1.65
MIR9-3HG-202ENST00000538734 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa25.36■■□□□ 1.65
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NUP98P52948 1817 aa25.36■■□□□ 1.65
MIR9-3HG-202ENST00000538734 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25.35■■□□□ 1.65
MIR9-3HG-202ENST00000538734 POTEAQ6S8J7 498 aa25.35■■□□□ 1.65
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
MIR9-3HG-202ENST00000538734 APBB1O00213 710 aa25.34■■□□□ 1.65
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.33■■□□□ 1.64
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CAMTA2O94983 1202 aa25.32■■□□□ 1.64
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa25.32■■□□□ 1.64
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
MIR9-3HG-202ENST00000538734 GPTP24298 496 aa25.32■■□□□ 1.64
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NLRP10Q86W26 655 aa25.32■■□□□ 1.64
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RPS6KA4O75676 772 aa25.31■■□□□ 1.64
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.31■■□□□ 1.64
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
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